More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3493 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3493  ATPase  100 
 
 		 356 aa  730    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2094  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  58.97 
 
 		 356 aa  408  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.640713  normal  0.885504 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1324  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  58.65 
 
 		 327 aa  404  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.430216  normal  0.197723 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0087  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  59.43 
 
 		 327 aa  402  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.299862  normal  0.0406879 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2774  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.33 
 
 		 351 aa  355  5e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335282  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1689  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.81 
 
 		 338 aa  352  8e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1419  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.87 
 
 		 345 aa  349  3e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00950  methanol dehydrogenase regulator-like protein  50.32 
 
 		 317 aa  345  6e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1950  ATPase  50.48 
 
 		 317 aa  341  9e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4268  ATPase associated with various cellular activities, AAA-3  53.44 
 
 		 343 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4423  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.44 
 
 		 341 aa  338  7e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.886882  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1801  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.04 
 
 		 349 aa  338  9.999999999999999e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4402  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.8 
 
 		 341 aa  336  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.861235  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4422  ATPase  50.61 
 
 		 338 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2500  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.31 
 
 		 308 aa  333  4e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0488  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.67 
 
 		 320 aa  330  2e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3175  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.29 
 
 		 379 aa  327  2.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.336988 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2234  ATPase  49.54 
 
 		 349 aa  326  3e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0190  methanol dehydrogenase regulator  51.49 
 
 		 321 aa  321  9.999999999999999e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.17889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.72 
 
 		 320 aa  321  9.999999999999999e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.485502 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1285  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.14 
 
 		 334 aa  320  3e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3229  MoxR family protein  51.74 
 
 		 342 aa  319  3.9999999999999996e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3013  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.16 
 
 		 350 aa  319  6e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0925287  normal  0.302039 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.86 
 
 		 334 aa  318  9e-86  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0947462  normal  0.0709428 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1609  ATPase  49.84 
 
 		 335 aa  317  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1556  moxR protein  49.53 
 
 		 335 aa  315  8e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0207  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.84 
 
 		 333 aa  315  8e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1007  AAA family ATPase  50.99 
 
 		 343 aa  314  9.999999999999999e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.664695  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2792  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.27 
 
 		 336 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258088 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0369  ATPase  49.53 
 
 		 336 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.536923  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1504  moxR protein  49.21 
 
 		 335 aa  313  2.9999999999999996e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.408209  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2275  ATPase  51.27 
 
 		 337 aa  312  5.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.225446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3056  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.64 
 
 		 336 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0112658 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0683  AAA_3 ATPase  49.07 
 
 		 335 aa  310  2e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.557098 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0254  ATPase  47.42 
 
 		 329 aa  309  4e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.211212  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3818  ATPase  48.38 
 
 		 334 aa  309  4e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1719  methanol dehydrogenase regulator  47.45 
 
 		 324 aa  308  8e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1738  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.51 
 
 		 333 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0725  ATPase  50.65 
 
 		 332 aa  306  3e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3263  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.72 
 
 		 341 aa  306  4.0000000000000004e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302795  normal  0.0121123 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2649  moxR-like ATPase  48.53 
 
 		 339 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.342238  normal  0.176389 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.41 
 
 		 329 aa  305  7e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.816775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1888  ATPase  47.73 
 
 		 334 aa  304  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.277676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2179  ATPase  48.36 
 
 		 340 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0042  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.57 
 
 		 325 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3901  ATPase  49.38 
 
 		 333 aa  301  1e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.186525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0203  ATPase  47.47 
 
 		 338 aa  299  5e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.526307 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5171  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.68 
 
 		 336 aa  298  7e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.311831  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2007  ATPase  48.85 
 
 		 362 aa  297  2e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  47.13 
 
 		 328 aa  296  4e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3251  ATPase  48.4 
 
 		 346 aa  295  7e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228846  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  45.23 
 
 		 332 aa  295  7e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0233  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.39 
 
 		 325 aa  295  7e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2626  ATPase  48.4 
 
 		 337 aa  294  1e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1088  ATPase  48.21 
 
 		 318 aa  294  1e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2906  hypothetical protein  46.75 
 
 		 335 aa  295  1e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106091  normal  0.402062 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1024  putative MoxR family protein  47.15 
 
 		 338 aa  294  2e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1643  ATPase  44.62 
 
 		 340 aa  294  2e-78  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2685  ATPase  47.15 
 
 		 338 aa  294  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452086  normal  0.63009 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0916  ATPase  48.4 
 
 		 334 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1456  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.39 
 
 		 336 aa  292  7e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal  0.294697 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1736  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.71 
 
 		 336 aa  291  9e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0658349 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1459  ATPase  48.71 
 
 		 336 aa  291  9e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  0.0369744 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.12 
 
 		 329 aa  291  1e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4480  ATPase  48.39 
 
 		 336 aa  291  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.290117  hitchhiker  0.00475786 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1365  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.22 
 
 		 313 aa  291  1e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.780175  normal  0.334218 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0345  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.02 
 
 		 310 aa  290  3e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.898086  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1192  ATPase  48.72 
 
 		 332 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.464003 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0153  methanol dehydrogenase regulator  44.41 
 
 		 330 aa  288  9e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.442514  normal  0.724123 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1376  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.44 
 
 		 334 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.875215  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3635  ATPase  51.29 
 
 		 334 aa  288  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.05587  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1932  moxR-like ATPase  47.04 
 
 		 324 aa  287  2e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1295  ATPase  47.76 
 
 		 334 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.962935  normal  0.478279 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0164  ATPase  46.67 
 
 		 319 aa  287  2e-76  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2271  putative MoxR family protein  47.44 
 
 		 332 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537768  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2844  ATPase  46.01 
 
 		 333 aa  286  5e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0804  ATPase  46.53 
 
 		 324 aa  285  8e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2771  hypothetical protein  47.08 
 
 		 331 aa  284  1.0000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2948  ATPase  47.67 
 
 		 333 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.343803  normal  0.69652 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1243  Sigma 54 interacting domain protein  44.35 
 
 		 337 aa  285  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3671  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.36 
 
 		 334 aa  284  2.0000000000000002e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2917  hypothetical protein  46.77 
 
 		 331 aa  284  2.0000000000000002e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0786  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.81 
 
 		 333 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.112127 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  42.86 
 
 		 328 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_002950  PG1579  MoxR family ATPase  43.27 
 
 		 331 aa  281  9e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  42.63 
 
 		 315 aa  280  3e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1478  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.84 
 
 		 342 aa  280  3e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  0.470444 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2939  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.54 
 
 		 325 aa  279  5e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.346358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0111  magnesium chelatase, subunit I, putative  45.25 
 
 		 332 aa  279  5e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1945  ATPase  47.04 
 
 		 320 aa  279  5e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0252  hypothetical protein  44.27 
 
 		 316 aa  279  6e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.486199  normal  0.225181 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0433  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.84 
 
 		 333 aa  278  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1781  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.2 
 
 		 327 aa  277  2e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0560879 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.25 
 
 		 331 aa  277  2e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02348  methanol dehydrogenase regulatory protein  43.93 
 
 		 339 aa  276  3e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1126  ATPase  45.4 
 
 		 327 aa  276  3e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2518  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.8 
 
 		 342 aa  276  4e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0319  hypothetical protein  45.06 
 
 		 335 aa  276  5e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00084292  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.48 
 
 		 350 aa  275  6e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  43.17 
 
 		 325 aa  275  7e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>