19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2060 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2060  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  496  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02070  stress-induced protein UspE  28.57 
 
 		 239 aa  112  6e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11679  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003480  hypothetical protein  25.98 
 
 		 265 aa  106  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000514785  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1040  hypothetical protein  28.24 
 
 		 281 aa  106  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000182734  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1407  hypothetical protein  32.05 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02290  hypothetical protein  26.14 
 
 		 265 aa  102  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2976  hypothetical protein  27.68 
 
 		 275 aa  97.8  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1579  membrane protein  27.46 
 
 		 269 aa  93.6  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.247343  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1792  hypothetical protein  29.05 
 
 		 266 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3315  hypothetical protein  24.37 
 
 		 252 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.607217 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4886  hypothetical protein  27.03 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.758345  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0383  hypothetical protein  26.24 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56090  hypothetical protein  25.56 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1900  hypothetical protein  24.04 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.873498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2146  hypothetical protein  19.82 
 
 		 218 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00523759  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2073  hypothetical protein  23.26 
 
 		 218 aa  52  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000612499  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2098  protein of unknown function DUF975  24.06 
 
 		 225 aa  49.3  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.274945  normal  0.188406 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0425  hypothetical membrane spanning protein  22.18 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.800318  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1749  hypothetical protein  22.13 
 
 		 253 aa  45.4  0.0008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000252365  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>