54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1355 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1355  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1538  hypothetical protein  65 
 
 		 81 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0059018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3628  hypothetical protein  63.16 
 
 		 81 aa  103  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000561848  hitchhiker  0.00583621 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000608  hypothetical protein  59.74 
 
 		 79 aa  98.2  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000125444  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0834  hypothetical protein  63.16 
 
 		 81 aa  98.6  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3234  hypothetical protein  58.75 
 
 		 82 aa  95.9  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06468  hypothetical protein  55.84 
 
 		 87 aa  92  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3963  hypothetical protein  56.76 
 
 		 79 aa  84.7  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3391  hypothetical protein  52.63 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1754  hypothetical protein  51.32 
 
 		 84 aa  78.6  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.427593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3745  hypothetical protein  51.28 
 
 		 81 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2344  hypothetical protein  46.05 
 
 		 81 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.519419 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1323  hypothetical protein  46.91 
 
 		 84 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.938492  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3280  hypothetical protein  46.25 
 
 		 81 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0577  hypothetical protein  48.68 
 
 		 87 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1294  hypothetical protein  45 
 
 		 81 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1314  hypothetical protein  43.75 
 
 		 81 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000026782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1244  hypothetical protein  43.75 
 
 		 81 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1388  protein of unknown function DUF465  43.75 
 
 		 81 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3133  hypothetical protein  43.75 
 
 		 81 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.143017  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2989  hypothetical protein  43.75 
 
 		 81 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.992485  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2975  hypothetical protein  43.75 
 
 		 81 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000873818  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1163  hypothetical protein  45.16 
 
 		 73 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61010  hypothetical protein  36.99 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0859  hypothetical protein  36.36 
 
 		 88 aa  52  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000472034  hitchhiker  0.0000091308 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3892  hypothetical protein  36.76 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5251  hypothetical protein  35.62 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.464221  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0754  hypothetical protein  38.36 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1273  hypothetical protein  37.14 
 
 		 79 aa  48.9  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.804034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3788  hypothetical protein  36.99 
 
 		 84 aa  47.8  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0715  protein of unknown function DUF465  33.82 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0542  hypothetical protein  39.68 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0502225  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0466  hypothetical protein  39.68 
 
 		 70 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000739571  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0490  hypothetical protein  39.68 
 
 		 70 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000900641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0487  hypothetical protein  39.68 
 
 		 70 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000002687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3853  hypothetical protein  39.68 
 
 		 70 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000215717  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0753  hypothetical protein  37.31 
 
 		 80 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2645  hypothetical protein  38.71 
 
 		 72 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4134  hypothetical protein  38.1 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1880  hypothetical protein  33.82 
 
 		 79 aa  46.2  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0459  hypothetical protein  38.71 
 
 		 71 aa  45.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0446  hypothetical protein  36.51 
 
 		 70 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00475096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3506  hypothetical protein  34.92 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00012483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3681  hypothetical protein  34.92 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0122929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1817  protein of unknown function DUF465  33.87 
 
 		 73 aa  42.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0116394  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0584  hypothetical protein  33.77 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.430122  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1761  hypothetical protein  32.43 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1438  hypothetical protein  32.43 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.119684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41080  hypothetical protein  30.77 
 
 		 85 aa  41.6  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.441707  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0008  hypothetical protein  35.62 
 
 		 83 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482211  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4761  hypothetical protein  38.71 
 
 		 72 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544295  normal  0.403355 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3920  hypothetical protein  34.29 
 
 		 79 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.787239  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0459  hypothetical protein  35.59 
 
 		 73 aa  40.8  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4690  hypothetical protein  31.34 
 
 		 73 aa  40.8  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0906435  normal  0.0131343 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>