54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0828 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0828  lipolytic enzyme, G-D-S-L  100 
 
 		 500 aa  1038    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0189609  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2606  lipolytic protein G-D-S-L family  35.88 
 
 		 457 aa  288  1e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00170788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4821  lipolytic protein G-D-S-L family  32.3 
 
 		 456 aa  217  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000350884  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2979  hypothetical protein  27.69 
 
 		 295 aa  75.5  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000369688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2692  lipolytic protein G-D-S-L family  29.82 
 
 		 217 aa  72.4  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0553  lipolytic protein G-D-S-L family  24.55 
 
 		 214 aa  69.3  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2720  lipolytic protein G-D-S-L family  25.06 
 
 		 455 aa  68.2  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0378561  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2048  lipolytic protein G-D-S-L family  26.13 
 
 		 207 aa  67  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.137191 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1223  lipolytic protein G-D-S-L family  25.44 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0796712  normal  0.271135 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2077  lipolytic protein G-D-S-L family  27.21 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0650  GDSL family lipase  22.37 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4778  lipolytic protein G-D-S-L family  20.35 
 
 		 417 aa  56.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2141  GDSL family lipase  23.86 
 
 		 189 aa  54.7  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.953926  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0817  lipolytic protein G-D-S-L family  25.7 
 
 		 331 aa  54.3  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00788434 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0794  lipolytic protein G-D-S-L family  30.77 
 
 		 209 aa  53.5  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.774781  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2599  lipolytic protein G-D-S-L family  25.66 
 
 		 213 aa  52.8  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3416  esterase  24.71 
 
 		 188 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0484902  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0436  GDSL family lipase  23.38 
 
 		 208 aa  52.8  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.633376  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3427  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  25 
 
 		 188 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0443  GDSL family lipase  22.33 
 
 		 213 aa  52.4  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.665716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3393  lipolytic protein G-D-S-L family  24.54 
 
 		 209 aa  51.6  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0644196  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3118  esterase  25.56 
 
 		 188 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1523  lipolytic protein G-D-S-L family  23.91 
 
 		 220 aa  49.7  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1486  lipolytic protein G-D-S-L family  24.43 
 
 		 264 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.585939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1374  lipolytic protein G-D-S-L family  21.27 
 
 		 410 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.221741 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19520  lysophospholipase L1-like esterase  26.09 
 
 		 209 aa  48.9  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.347124  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1162  lipolytic enzyme, G-D-S-L  23.81 
 
 		 183 aa  48.9  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.232056  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3144  lipolytic protein G-D-S-L family  20.75 
 
 		 225 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2310  GDSL family lipase  23.99 
 
 		 307 aa  48.5  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1716  lipolytic protein  25 
 
 		 194 aa  48.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000204836  normal  0.492944 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  31.53 
 
 		 223 aa  48.5  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2625  hypothetical protein  22.92 
 
 		 469 aa  48.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1829  esterase  24.54 
 
 		 188 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0305538  normal  0.13667 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0578  lipolytic protein G-D-S-L family  34.62 
 
 		 228 aa  47.8  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.695462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06240  lysophospholipase L1-like esterase  32.98 
 
 		 216 aa  47.4  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23690  putative secreted protein  25.91 
 
 		 442 aa  47  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00903335 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3443  esterase  25 
 
 		 188 aa  47  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0191  GDSL family lipase  28.7 
 
 		 201 aa  47  0.0009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1815  acyl-CoA thioesterase I precursor  26.76 
 
 		 216 aa  46.2  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3980  lipolytic protein G-D-S-L family  22.65 
 
 		 262 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.235003  normal  0.737943 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2563  lipolytic protein G-D-S-L family  32.65 
 
 		 261 aa  45.8  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2311  acyl-CoA thioesterase I  26.57 
 
 		 226 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328666  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3119  lipolytic protein G-D-S-L family  30.39 
 
 		 227 aa  45.1  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0965245  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3728  lipolytic protein G-D-S-L family  34.15 
 
 		 257 aa  45.1  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0881256  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  24.53 
 
 		 266 aa  44.3  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0772  GDSL family lipase  25.62 
 
 		 201 aa  44.3  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2498  putative acyl-CoA thioesterase  24.4 
 
 		 186 aa  44.3  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2468  acyl-CoA thioesterase I  26.57 
 
 		 232 aa  43.9  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0429  arylesterase  30.09 
 
 		 202 aa  44.3  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2349  acyl-CoA thioesterase I  26.57 
 
 		 226 aa  43.9  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342974  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2149  putative lipase  26.53 
 
 		 203 aa  43.9  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.208079 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3360  acyl-CoA thioesterase I  26.57 
 
 		 226 aa  43.5  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.323811  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1219  acyl-CoA thioesterase, putative  26.57 
 
 		 226 aa  43.5  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0125  lipolytic protein G-D-S-L family  38.16 
 
 		 249 aa  43.5  0.01  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.299252  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>