More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_R0023 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_R0023  tRNA-Glu  100 
 
 
74 bp  147  4e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  2.72439e-12  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0047  tRNA-Glu  100 
 
 
74 bp  147  4e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00511598  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0027  tRNA-Glu  97.3 
 
 
74 bp  131  2e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  1.39828e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0015  tRNA-Glu  97.3 
 
 
77 bp  131  2e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00567316  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t31  tRNA-Glu  97.3 
 
 
74 bp  131  2e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00120069  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0040  tRNA-Glu  97.3 
 
 
74 bp  131  2e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  5.76677e-11  normal  0.10261 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0021  tRNA-Glu  97.3 
 
 
77 bp  131  2e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0007  tRNA-Glu  93.65 
 
 
74 bp  93.7  5e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0005  tRNA-Glu  93.22 
 
 
77 bp  85.7  1e-15  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0083  tRNA-Glu  93.22 
 
 
73 bp  77.8  3e-13  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0043  tRNA-Glu  93.22 
 
 
76 bp  77.8  3e-13  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0981603  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0033  tRNA-Glu  91.38 
 
 
77 bp  75.8  1e-12  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0516198  hitchhiker  4.02532e-07 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0039  tRNA-Glu  92.98 
 
 
76 bp  73.8  5e-12  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  2.2733e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0039  tRNA-Glu  91.53 
 
 
73 bp  69.9  8e-11  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05430  tRNA-Glu  93.62 
 
 
77 bp  69.9  8e-11  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  6.67739e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0061  tRNA-Glu  91.53 
 
 
76 bp  69.9  8e-11  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0057  tRNA-Glu  89.83 
 
 
77 bp  69.9  8e-11  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0003  tRNA-Glu  89.83 
 
 
77 bp  69.9  8e-11  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0763147  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0031  tRNA-Glu  89.66 
 
 
77 bp  67.9  3e-10  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0288989  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0014  tRNA-Glu  89.66 
 
 
77 bp  67.9  3e-10  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807422  normal  0.0868676 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0012  tRNA-Glu  89.66 
 
 
77 bp  67.9  3e-10  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.418114  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1796  tRNA-Glu  90.16 
 
 
76 bp  65.9  1e-09  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0065  tRNA-Glu  97.3 
 
 
76 bp  65.9  1e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0013  tRNA-Glu  91.23 
 
 
76 bp  65.9  1e-09  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.330262 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0012  tRNA-Glu  89.47 
 
 
77 bp  65.9  1e-09  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0007  tRNA-Glu  88.89 
 
 
76 bp  61.9  2e-08  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866877  hitchhiker  0.000537745 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0046  tRNA-Glu  89.83 
 
 
73 bp  61.9  2e-08  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01850  tRNA-Glu  89.83 
 
 
73 bp  61.9  2e-08  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0041  tRNA-Glu  89.83 
 
 
76 bp  61.9  2e-08  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  1.19319e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0060  tRNA-Glu  89.83 
 
 
73 bp  61.9  2e-08  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.790027  normal  0.68606 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0015  tRNA-Glu  89.83 
 
 
73 bp  61.9  2e-08  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08980  tRNA-Glu  93.02 
 
 
77 bp  61.9  2e-08  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.3154e-05 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0062  tRNA-Glu  89.83 
 
 
73 bp  61.9  2e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.216976  normal  0.206697 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0023  tRNA-Glu  94.59 
 
 
73 bp  58  3e-07  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.294422  unclonable  3.04821e-08 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0022  tRNA-Glu  94.59 
 
 
73 bp  58  3e-07  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.572486  hitchhiker  5.9439e-07 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0018  tRNA-Glu  86.89 
 
 
77 bp  58  3e-07  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0024  tRNA-Glu  94.59 
 
 
73 bp  58  3e-07  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.229893  normal  0.201113 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0008  tRNA-Glu  94.59 
 
 
76 bp  58  3e-07  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0033  tRNA-Glu  87.72 
 
 
77 bp  58  3e-07  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  1.14551e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0050  tRNA-Glu  86.89 
 
 
77 bp  58  3e-07  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.199689  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0389  tRNA-Glu  88.52 
 
 
78 bp  58  3e-07  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0245226  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0019  tRNA-Glu  94.59 
 
 
73 bp  58  3e-07  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0023  tRNA-Glu  94.59 
 
 
73 bp  58  3e-07  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0770759  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0060  tRNA-Glu  94.59 
 
 
73 bp  58  3e-07  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.222014  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0007  tRNA-Glu  94.59 
 
 
73 bp  58  3e-07  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0034  tRNA-Glu  94.59 
 
 
76 bp  58  3e-07  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.187046  normal  0.0177267 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Glu-2  tRNA-Glu  94.59 
 
 
76 bp  58  3e-07  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.270372  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0044  tRNA-Glu  94.59 
 
 
73 bp  58  3e-07  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.424597 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0023  tRNA-Glu  94.59 
 
 
73 bp  58  3e-07  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0064  tRNA-Glu  94.59 
 
 
73 bp  58  3e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  87.72 
 
 
77 bp  58  3e-07  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.068843  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0010  tRNA-Glu  88.14 
 
 
73 bp  54  5e-06  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0050  tRNA-Glu  88.14 
 
 
76 bp  54  5e-06  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.499869  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0015  tRNA-Glu  88.14 
 
 
73 bp  54  5e-06  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.652261  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0072  tRNA-Glu  88.14 
 
 
73 bp  54  5e-06  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.514054 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18600  tRNA-Glu  92.31 
 
 
76 bp  54  5e-06  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.204503  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0054  tRNA-Glu  88.14 
 
 
73 bp  54  5e-06  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.208215 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18590  tRNA-Glu  92.31 
 
 
73 bp  54  5e-06  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.2903  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25080  tRNA-Glu  88.14 
 
 
73 bp  54  5e-06  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0058  tRNA-Glu  88.14 
 
 
73 bp  54  5e-06  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.069455  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0052  tRNA-Glu  88.14 
 
 
76 bp  54  5e-06  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0061  tRNA-Glu  88.14 
 
 
73 bp  54  5e-06  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180901  normal  0.112494 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0005  tRNA-Glu  88.14 
 
 
73 bp  54  5e-06  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00334016 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0003  tRNA-Asp  92.31 
 
 
75 bp  54  5e-06  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.541849 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0059  tRNA-Glu  88.14 
 
 
76 bp  54  5e-06  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.327246  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0062  tRNA-Glu  88.14 
 
 
73 bp  54  5e-06  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.427189  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0060  tRNA-Glu  88.14 
 
 
76 bp  54  5e-06  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0056  tRNA-Glu  88.14 
 
 
76 bp  54  5e-06  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0058  tRNA-Asp  92.31 
 
 
75 bp  54  5e-06  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0002  tRNA-Glu  88.14 
 
 
76 bp  54  5e-06  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.509318 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0063  tRNA-Asp  92.31 
 
 
78 bp  54  5e-06  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.453793  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0052  tRNA-Glu  88.14 
 
 
73 bp  54  5e-06  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0006  tRNA-Glu  88.14 
 
 
73 bp  54  5e-06  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.766786  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0023  tRNA-Glu  92.11 
 
 
76 bp  52  2e-05  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.834038  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0025  tRNA-Glu  92.11 
 
 
76 bp  52  2e-05  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.797735  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0030  tRNA-Glu  92.11 
 
 
76 bp  52  2e-05  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0731495 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0032  tRNA-Glu  92.11 
 
 
76 bp  52  2e-05  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0707402 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3593  tRNA-Glu  92.11 
 
 
78 bp  52  2e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0242982  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3056  tRNA-Glu  92.11 
 
 
78 bp  52  2e-05  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0721496  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0034  tRNA-Glu  92.11 
 
 
76 bp  52  2e-05  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.103972 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4327  tRNA-Glu  92.11 
 
 
78 bp  52  2e-05  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.75323e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0041  tRNA-Glu  92.11 
 
 
76 bp  52  2e-05  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0885225 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4416  tRNA-Glu  92.11 
 
 
78 bp  52  2e-05  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  3.80054e-05  hitchhiker  0.00248894 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0043  tRNA-Glu  92.11 
 
 
76 bp  52  2e-05  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0888454 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0048  tRNA-Glu  92.11 
 
 
76 bp  52  2e-05  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0601001  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0050  tRNA-Glu  92.11 
 
 
76 bp  52  2e-05  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119449  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0052  tRNA-Glu  92.11 
 
 
76 bp  52  2e-05  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.233686  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0032  tRNA-Glu  92.11 
 
 
76 bp  52  2e-05  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000829453  hitchhiker  1.51548e-05 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0104  tRNA-Glu  92.11 
 
 
76 bp  52  2e-05  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.597387  normal  0.0687014 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0112  tRNA-Glu  92.11 
 
 
76 bp  52  2e-05  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.010822  hitchhiker  0.00272786 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0129  tRNA-Glu  92.11 
 
 
76 bp  52  2e-05  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00335623  normal  0.0126805 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2744  tRNA-Glu  92.11 
 
 
78 bp  52  2e-05  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0202899  normal  0.795242 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4125  tRNA-Glu  92.11 
 
 
78 bp  52  2e-05  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00109058  normal  0.113801 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4233  tRNA-Glu  92.11 
 
 
78 bp  52  2e-05  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  3.31616e-05  normal  0.0574538 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4458  tRNA-Glu  92.11 
 
 
78 bp  52  2e-05  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0692997  hitchhiker  0.00363105 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4502  tRNA-Glu  92.11 
 
 
78 bp  52  2e-05  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00140691  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2987  tRNA-Glu  92.11 
 
 
78 bp  52  2e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00372041  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3762  tRNA-Glu  92.11 
 
 
78 bp  52  2e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00180196  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4282  tRNA-Glu  92.11 
 
 
78 bp  52  2e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0611024  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4586  tRNA-Glu  92.11 
 
 
78 bp  52  2e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  6.16309e-05  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>