More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_R0064 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_R0064  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0023  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  137  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0065  tRNA-Glu  98.46 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0044  tRNA-Glu  97.1 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.424597 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0023  tRNA-Glu  97.1 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.294422  unclonable  0.0000000304821 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0019  tRNA-Glu  97.1 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0024  tRNA-Glu  97.1 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.229893  normal  0.201113 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0018  tRNA-Glu  97.1 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0023  tRNA-Glu  97.1 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0770759  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0022  tRNA-Glu  97.1 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.572486  hitchhiker  0.00000059439 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0050  tRNA-Glu  95.65 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.499869  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0015  tRNA-Glu  95.45 
 
 		 73 bp  107  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.879975  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0016  tRNA-Glu  95.45 
 
 		 76 bp  107  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.671374  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0060  tRNA-Glu  95.45 
 
 		 73 bp  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.222014  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0007  tRNA-Glu  95.45 
 
 		 73 bp  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0008  tRNA-Glu  95.45 
 
 		 76 bp  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0048  tRNA-Glu  98.15 
 
 		 76 bp  99.6  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.185598  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0045  tRNA-Glu  93.85 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.942532  normal  0.960719 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0034  tRNA-Glu  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.187046  normal  0.0177267 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0046  tRNA-Glu  93.85 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.960937  normal  0.776399 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0067  tRNA-Glu  92.75 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0066  tRNA-Glu  92.75 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.659746  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0040  tRNA-Glu  96.3 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000066395 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0021  tRNA-Glu  91.3 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.349986  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14035  tRNA-Glu  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00157329  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0055  tRNA-Glu  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0058  tRNA-Glu  94.55 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.069455  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0050  tRNA-Glu  94.55 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141779  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0019  tRNA-Glu  94.55 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0015  tRNA-Glu  94.55 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0047  tRNA-Glu  94.55 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.877641  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0047  tRNA-Glu  94.55 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0046  tRNA-Glu  94.55 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0046  tRNA-Glu  94.55 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.282187 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0035  tRNA-Glu  93.1 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.461495  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0014  tRNA-Glu  93.1 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.206321  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0036  tRNA-Glu  93.1 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.661246  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0041  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000102386  normal  0.397694 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0013  tRNA-Glu  93.1 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0017  tRNA-Glu  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0047  tRNA-Glu  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.792355  normal  0.693567 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0013  tRNA-Glu  93.1 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0025  tRNA-Glu  92.98 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.684862 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0024  tRNA-Glu  92.98 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.700845 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0046  tRNA-Glu  89.86 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10740  tRNA-Glu  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0961043  normal  0.333944 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0045  tRNA-Glu  89.86 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0010  tRNA-Glu  92.73 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0072  tRNA-Glu  92.73 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.514054 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0054  tRNA-Glu  92.73 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.208215 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0052  tRNA-Glu  92.73 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0015  tRNA-Glu  92.73 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.652261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0014  tRNA-Glu  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0013  tRNA-Glu  91.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0052  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0061  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180901  normal  0.112494 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34010  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.284833  normal  0.536737 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0077  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0043  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0045  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.427459  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0060  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.790027  normal  0.68606 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0046  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.404692  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0014  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.372263 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0062  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.216976  normal  0.206697 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18590  tRNA-Glu  89.66 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.2903  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09040  tRNA-Glu  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.431816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18600  tRNA-Glu  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.204503  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14011  tRNA-Glu  93.48 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.08359e-33  hitchhiker  0.00000339353 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0052  tRNA-Glu  94.87 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.822673  hitchhiker  0.00818343 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0059  tRNA-Glu  89.09 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.872199  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0048  tRNA-Glu  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.849322 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0002  tRNA-Glu  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.509318 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37130  tRNA-Glu  89.09 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.179999  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1796  tRNA-Glu  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0059  tRNA-Glu  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.327246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0051  tRNA-Glu  94.87 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.63793  hitchhiker  0.00823145 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08680  tRNA-Glu  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0053  tRNA-Glu  89.09 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.526279 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11080  tRNA-Glu  94.87 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0052  tRNA-Glu  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.699751  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0083  tRNA-Glu  94.59 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0043  tRNA-Glu  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0981603  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0023  tRNA-Glu  94.59 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000000272439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0047  tRNA-Glu  94.59 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00511598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0045  tRNA-Glu  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0700385  normal  0.136088 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0013  tRNA-Glu  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.330262 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0056  tRNA-Glu  88.46 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.116328  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0032  tRNA-Glu  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.362082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2128  tRNA-Glu  88.46 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.223155  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t42  tRNA-Glu  92.31 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0670416  normal  0.0185498 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA58  tRNA-Glu  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.237213  normal  0.68605 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA60  tRNA-Glu  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.095942  normal  0.6882 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60120  tRNA-Glu  92.31 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0046  tRNA-Glu  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000308892 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0040  tRNA-Glu  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000000578854  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0045  tRNA-Glu  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000328054  normal  0.0346347 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0032  tRNA-Glu  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0707402 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0030  tRNA-Glu  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0731495 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0034  tRNA-Glu  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.103972 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23580  tRNA-Glu  92.31 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0268964 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>