More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_23580 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_60120  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0043  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  145  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0888454 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0025  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  145  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.797735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0032  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  145  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0707402 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0052  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  145  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.233686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0023  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  145  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.834038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0030  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  145  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0731495 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0050  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  145  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119449  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t31  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.281788 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t33  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.285433 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t38  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.444842  normal  0.0196237 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t40  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.1195  normal  0.0190117 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t42  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0670416  normal  0.0185498 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0072  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  145  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.735221 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1996  tRNA-Glu  100 
 
 		 78 bp  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0074  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  145  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.562141 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0030  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  145  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.044277  normal  0.615022 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t20  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t22  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t30  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111782  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t32  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0584269  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA37  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.244013 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA39  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783995  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA58  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.237213  normal  0.68605 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA60  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.095942  normal  0.6882 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60540  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.454942  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R33  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R35  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R62  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R64  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R66  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2336  tRNA-Glu  100 
 
 		 78 bp  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0131684  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0070  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  145  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.924064  normal  0.541649 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0081  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  145  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.863726  normal  0.5241 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0079  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  145  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.672863  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0052  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  145  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.514953 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0050  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  145  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.652046 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1998  tRNA-Glu  100 
 
 		 78 bp  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0034  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  145  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.103972 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0028  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  145  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0423864  normal  0.609581 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60520  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.671804  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23580  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0268964 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27600  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0544848  hitchhiker  0.00250338 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0048  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  145  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0601001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0041  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  145  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0885225 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0048  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  145  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.670571 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0002  tRNA-Glu  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0220588  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0102  tRNA-Glu  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0016  tRNA-Glu  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000647027  hitchhiker  0.00000106632 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0035  tRNA-Glu  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000448273  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0034  tRNA-Glu  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00458122  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0037  tRNA-Glu  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000193498  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0036  tRNA-Glu  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000110474  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0086  tRNA-Glu  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.138064  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0066  tRNA-Glu  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0228326  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t065  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t066  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t067  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t068  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t069  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t071  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0083  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00174717  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0099  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000375203  normal  0.111863 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0087  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042653  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0086  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000105777  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0090  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000382107  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0089  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000367651  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0063  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000754963  normal  0.0219255 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0065  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126201  normal  0.0214958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0066  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122545  normal  0.0214958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0067  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000119712  normal  0.0214958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0068  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000101886  normal  0.0219255 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0069  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000616599  normal  0.0122631 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0070  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000026178  normal  0.0123268 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0063  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000852764  normal  0.666936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0065  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000829998  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0066  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000483266  normal  0.663718 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0071  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000687617  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0073  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000261854  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0061  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0063  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000126718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0064  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000354559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0065  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000145591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0066  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000460024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0067  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000450413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0068  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000473191  normal  0.85687 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0088  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00276432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0090  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00102507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0092  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000105241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0094  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000925295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0095  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000290046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0096  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000128006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0097  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000012419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0101  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000061614  normal  0.113768 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0085  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107355  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0074  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0152418  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0075  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0139677  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0076  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00648413  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0078  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00140572  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0080  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000593448  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>