More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_R0045 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_R0045  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.942532  normal  0.960719 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0046  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.960937  normal  0.776399 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0008  tRNA-Glu  98.48 
 
 		 76 bp  123  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0007  tRNA-Glu  98.48 
 
 		 73 bp  123  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0060  tRNA-Glu  98.48 
 
 		 73 bp  123  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.222014  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0034  tRNA-Glu  95.71 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.187046  normal  0.0177267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0065  tRNA-Glu  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0015  tRNA-Glu  93.94 
 
 		 73 bp  99.6  9e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.879975  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0016  tRNA-Glu  93.94 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.671374  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0023  tRNA-Glu  93.94 
 
 		 73 bp  99.6  9e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0018  tRNA-Glu  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0064  tRNA-Glu  93.85 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0024  tRNA-Glu  92.42 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.229893  normal  0.201113 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0023  tRNA-Glu  92.42 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0770759  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0022  tRNA-Glu  92.42 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.572486  hitchhiker  0.00000059439 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0044  tRNA-Glu  92.42 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.424597 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0019  tRNA-Glu  92.42 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0023  tRNA-Glu  92.42 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.294422  unclonable  0.0000000304821 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0067  tRNA-Glu  93.22 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0050  tRNA-Glu  93.22 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.499869  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0066  tRNA-Glu  93.22 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.659746  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14035  tRNA-Glu  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00157329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0047  tRNA-Glu  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.792355  normal  0.693567 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0043  tRNA-Glu  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  7.66398e-18  hitchhiker  0.000611065 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0053  tRNA-Glu  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.646689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0058  tRNA-Glu  92.73 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.069455  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0043  tRNA-Glu  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0061  tRNA-Glu  92.73 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180901  normal  0.112494 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0035  tRNA-Glu  91.53 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.461495  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0014  tRNA-Glu  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.372263 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0045  tRNA-Glu  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000328054  normal  0.0346347 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0055  tRNA-Glu  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.380229  normal  0.600027 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0014  tRNA-Glu  91.53 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.206321  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0045  tRNA-Glu  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0700385  normal  0.136088 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0021  tRNA-Glu  91.53 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.349986  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0036  tRNA-Glu  91.53 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.661246  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0013  tRNA-Glu  91.53 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0017  tRNA-Glu  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0013  tRNA-Glu  91.53 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0048  tRNA-Glu  89.39 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.185598  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14011  tRNA-Glu  92.86 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.08359e-33  hitchhiker  0.00000339353 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1796  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0072  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000632211  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0070  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00169817  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0071  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000687617  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2829  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000126927  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2830  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000136674  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2831  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000125741  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2832  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000126927  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2833  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0000102319  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t065  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t071  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt26  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt27  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt26  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt27  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0046  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118448  normal  0.0335348 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0049  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000939786  normal  0.015549 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0098  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00699861  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0101  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0318597  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0050  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141779  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0053  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000330135  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0054  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000364712  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0055  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537124  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0063  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000754963  normal  0.0219255 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0065  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126201  normal  0.0214958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0066  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122545  normal  0.0214958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0067  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000119712  normal  0.0214958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0068  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000101886  normal  0.0219255 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0069  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000616599  normal  0.0122631 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0070  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000026178  normal  0.0123268 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0063  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000852764  normal  0.666936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0065  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000829998  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0066  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000483266  normal  0.663718 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0067  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000412805  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0068  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000457267  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0069  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000472024  normal  0.658468 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0070  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000548592  normal  0.634145 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0105  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000352091  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0106  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000169546  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0068  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000473191  normal  0.85687 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0055  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0094  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000925295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0095  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000290046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0096  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000128006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0097  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000012419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0047  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.877641  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0074  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0152418  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0075  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0139677  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0076  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00648413  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0078  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00140572  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0080  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000593448  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0081  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000080757  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0046  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.282187 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0041  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000000984885  normal  0.888378 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0042  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260023  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0043  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000364581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0044  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000161143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0045  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000152021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0046  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000603782  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>