More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_R0060 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_R0060  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.222014  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0008  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  145  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0007  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0045  tRNA-Glu  98.48 
 
 		 76 bp  123  6e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.942532  normal  0.960719 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0046  tRNA-Glu  98.48 
 
 		 76 bp  123  6e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.960937  normal  0.776399 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0034  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  119  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.187046  normal  0.0177267 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0015  tRNA-Glu  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.879975  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0016  tRNA-Glu  94.52 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.671374  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0023  tRNA-Glu  95.59 
 
 		 73 bp  111  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0064  tRNA-Glu  95.45 
 
 		 73 bp  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0065  tRNA-Glu  93.94 
 
 		 76 bp  99.6  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0022  tRNA-Glu  92.65 
 
 		 73 bp  95.6  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.572486  hitchhiker  0.00000059439 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0044  tRNA-Glu  92.65 
 
 		 73 bp  95.6  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.424597 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0024  tRNA-Glu  92.65 
 
 		 73 bp  95.6  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.229893  normal  0.201113 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0023  tRNA-Glu  92.65 
 
 		 73 bp  95.6  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.294422  unclonable  0.0000000304821 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0019  tRNA-Glu  92.65 
 
 		 73 bp  95.6  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0023  tRNA-Glu  92.65 
 
 		 73 bp  95.6  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0770759  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0018  tRNA-Glu  92.65 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0058  tRNA-Glu  93.55 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.069455  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0013  tRNA-Glu  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0017  tRNA-Glu  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0036  tRNA-Glu  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.661246  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0014  tRNA-Glu  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.206321  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0035  tRNA-Glu  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.461495  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0013  tRNA-Glu  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0047  tRNA-Glu  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.792355  normal  0.693567 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0048  tRNA-Glu  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.185598  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0014  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.372263 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0067  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0066  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.659746  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0050  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.499869  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0043  tRNA-Glu  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0040  tRNA-Glu  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000066395 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0021  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.349986  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14035  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00157329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0047  tRNA-Glu  90.32 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.877641  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0046  tRNA-Glu  90.32 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0047  tRNA-Glu  90.32 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0019  tRNA-Glu  90.32 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0055  tRNA-Glu  90.32 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0050  tRNA-Glu  90.32 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141779  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0061  tRNA-Glu  90.32 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180901  normal  0.112494 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0015  tRNA-Glu  90.32 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0046  tRNA-Glu  90.32 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.404692  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0045  tRNA-Glu  90.32 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.427459  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0046  tRNA-Glu  90.32 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.282187 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09040  tRNA-Glu  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.431816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2128  tRNA-Glu  91.23 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.223155  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0032  tRNA-Glu  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.362082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11080  tRNA-Glu  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0052  tRNA-Glu  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.822673  hitchhiker  0.00818343 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0045  tRNA-Glu  90 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0043  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  7.66398e-18  hitchhiker  0.000611065 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0053  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.646689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0046  tRNA-Glu  90 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0045  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000328054  normal  0.0346347 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0055  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.380229  normal  0.600027 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0077  tRNA-Glu  90 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0051  tRNA-Glu  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.63793  hitchhiker  0.00823145 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14011  tRNA-Glu  90.48 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.08359e-33  hitchhiker  0.00000339353 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0045  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0700385  normal  0.136088 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0052  tRNA-Glu  88.71 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0054  tRNA-Glu  88.71 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.208215 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0010  tRNA-Glu  88.71 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0072  tRNA-Glu  88.71 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.514054 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0015  tRNA-Glu  88.71 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.652261  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t38  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.444842  normal  0.0196237 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t40  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.1195  normal  0.0190117 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t42  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0670416  normal  0.0185498 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0073  tRNA-Glu  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000261854  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t067  tRNA-Glu  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0013  tRNA-Glu  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.330262 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t069  tRNA-Glu  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t071  tRNA-Glu  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t20  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t22  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t30  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111782  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t32  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0584269  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt26  tRNA-Glu  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt27  tRNA-Glu  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R33  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R35  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R64  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R66  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0016  tRNA-Glu  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000647027  hitchhiker  0.00000106632 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0070  tRNA-Glu  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00169817  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0069  tRNA-Glu  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0164971  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0072  tRNA-Glu  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000632211  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0074  tRNA-Glu  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000020686  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0071  tRNA-Glu  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000687617  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0040  tRNA-Glu  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000000578854  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27600  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0544848  hitchhiker  0.00250338 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0061  tRNA-Glu  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0064  tRNA-Glu  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000354559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0065  tRNA-Glu  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000145591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0066  tRNA-Glu  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000460024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0067  tRNA-Glu  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000450413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0088  tRNA-Glu  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00276432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0090  tRNA-Glu  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00102507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0092  tRNA-Glu  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000105241  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>