More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_R0040 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_R0040  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000000578854  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0029  tRNA-Glu  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.370228  normal  0.16961 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0032  tRNA-Glu  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.041206  normal  0.167752 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0038  tRNA-Glu  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000438841  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0030  tRNA-Glu  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.11215  normal  0.168988 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0027  tRNA-Glu  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.692909  normal  0.166571 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0034  tRNA-Glu  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0402265  normal  0.166571 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0038  tRNA-Glu  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0232145  normal  0.168988 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0036  tRNA-Glu  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0430019  normal  0.171485 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0042  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000000779226  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0044  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000000878437  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0046  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000603782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0045  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000152021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0044  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000161143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0043  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000364581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0047  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000519759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0042  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260023  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0095  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000187463  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0097  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00001173  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0098  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00699861  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0099  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0236458  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0100  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0345698  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0101  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0318597  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0105  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000352091  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0106  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000169546  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0107  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000079121  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0108  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000317177  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0109  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000956258  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0110  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000963161  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0041  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000000984885  normal  0.888378 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0025  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.797735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0036  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000110474  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0030  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0731495 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0032  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0707402 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1996  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 78 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1998  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 78 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t20  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t22  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t30  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111782  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t32  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0584269  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA37  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.244013 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA39  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783995  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA58  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.237213  normal  0.68605 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA60  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.095942  normal  0.6882 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R33  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R35  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R62  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R64  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R66  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0034  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00458122  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0034  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.103972 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0016  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000647027  hitchhiker  0.00000106632 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0028  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0423864  normal  0.609581 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0043  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0888454 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0041  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0885225 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0050  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0023  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.834038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0052  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.233686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0048  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0601001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0048  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.670571 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0052  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.514953 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0050  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.652046 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0030  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.044277  normal  0.615022 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0072  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.735221 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0070  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.924064  normal  0.541649 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0079  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.672863  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0074  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.562141 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0081  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.863726  normal  0.5241 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0035  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000448273  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0037  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000193498  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0066  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0228326  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0002  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0220588  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0027  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0216822  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0043  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000144635  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0102  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2336  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 78 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0131684  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0086  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.138064  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t31  tRNA-Glu  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.281788 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t33  tRNA-Glu  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.285433 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t38  tRNA-Glu  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.444842  normal  0.0196237 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t40  tRNA-Glu  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.1195  normal  0.0190117 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t42  tRNA-Glu  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0670416  normal  0.0185498 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23580  tRNA-Glu  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0268964 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27600  tRNA-Glu  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0544848  hitchhiker  0.00250338 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60120  tRNA-Glu  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60540  tRNA-Glu  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.454942  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60520  tRNA-Glu  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.671804  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00064  tRNA-Glu  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0611511  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0028  tRNA-Glu  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000151808  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0089  tRNA-Glu  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0392203  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0112  tRNA-Glu  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000205577  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0008  tRNA-Glu  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.029159  normal  0.0288609 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4686  tRNA-Glu  93.42 
 
 		 78 bp  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0982037  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5082  tRNA-Glu  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0023409  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0087  tRNA-Glu  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00145961  normal  0.0492727 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5105  tRNA-Glu  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0706149  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5097  tRNA-Glu  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000188223  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4716  tRNA-Glu  93.42 
 
 		 78 bp  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000625265  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0067  tRNA-Glu  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000550936  normal  0.0102746 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5055  tRNA-Glu  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0897941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>