More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02436 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02436  methanol dehydrogenase regulator  100 
 
 
308 aa  599  1e-170  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.808259  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0864  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  83.77 
 
 
317 aa  504  9.999999999999999e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1116  ATPase  80.58 
 
 
317 aa  496  1e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1210  methanol dehydrogenase regulatory protein  80.26 
 
 
317 aa  494  1e-139  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1883  ATPase  60.84 
 
 
306 aa  343  2e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.666763 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1752  ATPase  56.95 
 
 
303 aa  338  5e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.682382  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2530  ATPase  55.67 
 
 
303 aa  334  1e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2098  ATPase  56.55 
 
 
303 aa  332  5e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2623  ATPase  54.46 
 
 
303 aa  332  5e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.3673  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2051  ATPase  56.21 
 
 
303 aa  330  1e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1967  ATPase  56.85 
 
 
303 aa  331  1e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.379731  normal  0.918061 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2107  ATPase  56.55 
 
 
303 aa  330  3e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2348  ATPase  55.63 
 
 
315 aa  329  4e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1897  MoxR protein  58.42 
 
 
309 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.585542  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3009  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  60.95 
 
 
331 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.116146  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2096  ATPase  58.21 
 
 
306 aa  327  2.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0468  moxR protein, putative  60.95 
 
 
303 aa  325  5e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1491  MoxR protein, putative  59.8 
 
 
315 aa  325  8.000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00106383  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4561  hypothetical protein  56.54 
 
 
303 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2275  ATPase  56.54 
 
 
303 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0819  ATPase  54.61 
 
 
315 aa  324  1e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2287  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.54 
 
 
303 aa  324  1e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2153  MoxR protein  55.83 
 
 
303 aa  323  2e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1778  ATPase  57.24 
 
 
303 aa  323  3e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1856  ATPase  56.89 
 
 
303 aa  322  3e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.195599  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2242  ATPase  56.54 
 
 
313 aa  322  4e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.839891  normal  0.451068 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2163  ATPase  54.3 
 
 
306 aa  322  5e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.591841  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2126  ATPase  55.25 
 
 
303 aa  322  6e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3377  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.95 
 
 
306 aa  320  9.999999999999999e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.28342  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3626  putative ATPase  58.66 
 
 
308 aa  318  6e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5567  ATPase  57.19 
 
 
305 aa  318  9e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0627555  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2386  ATPase  61.07 
 
 
306 aa  317  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1245  putative MoxR like protein  56.06 
 
 
306 aa  317  1e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0487098  normal  0.300383 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02555  MoxR protein  50.8 
 
 
315 aa  317  2e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.080155  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2814  ATPase  55.63 
 
 
306 aa  317  2e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.826305  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2303  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.63 
 
 
306 aa  317  2e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3146  ATPase  52.15 
 
 
306 aa  316  3e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.109548 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1837  ATPase  55.48 
 
 
302 aa  315  4e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3854  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  58.63 
 
 
323 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.484851  normal  0.657971 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2069  succinyl-CoA ligase, alpha subunit  53.14 
 
 
306 aa  313  1.9999999999999998e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534339  normal  0.58415 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26910  hypothetical protein  59.25 
 
 
305 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3968  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  58.63 
 
 
323 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0680524 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2450  ATPase  57.76 
 
 
305 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.620681  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0889  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.33 
 
 
329 aa  313  2.9999999999999996e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2279  hypothetical protein  57.81 
 
 
305 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2416  ATPase  52.22 
 
 
303 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.858381  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2248  moxR protein, putative  57 
 
 
305 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.161333  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  57.28 
 
 
300 aa  310  2e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0353167  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03013  hypothetical protein  58.09 
 
 
321 aa  309  2.9999999999999997e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.601982 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1945  ATPase  55.2 
 
 
335 aa  309  2.9999999999999997e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2053  moxR protein, putative  56.66 
 
 
305 aa  309  4e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2370  MoxR-like ATPase  52.58 
 
 
305 aa  308  5e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.470488  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2529  AAA_3 ATPase  52.65 
 
 
306 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1676  methanol dehydrogenase regulatory protein  55.2 
 
 
335 aa  306  2.0000000000000002e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1523  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.87 
 
 
305 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1219  ATPase  51.82 
 
 
310 aa  303  3.0000000000000004e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.240667  normal  0.223931 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2912  ATPase  57.8 
 
 
349 aa  299  3e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.275117 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2778  hypothetical protein  49.17 
 
 
350 aa  299  4e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19020  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.21 
 
 
313 aa  295  4e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1792  ATPase  54.05 
 
 
317 aa  293  3e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.611153  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.77 
 
 
318 aa  292  5e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2517  ATPase  57.89 
 
 
315 aa  289  4e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.431864  normal  0.118214 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1879  MoxR protein-like  54.48 
 
 
312 aa  288  8e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1862  hypothetical protein  48.32 
 
 
304 aa  288  1e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.38 
 
 
319 aa  288  1e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1871  hypothetical protein  50.54 
 
 
304 aa  287  2e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2054  MoxR-like ATPases  52.05 
 
 
312 aa  287  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0418936  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2426  ATPase  54.31 
 
 
314 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.624284  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2119  magnesium chelatase, ChlI subunit  48.03 
 
 
302 aa  286  4e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1323  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.77 
 
 
308 aa  286  4e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.167846  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0280  ATPase  42.05 
 
 
312 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.760866  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2044  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.06 
 
 
314 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0164  ATPase  47.46 
 
 
319 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.65 
 
 
341 aa  282  4.0000000000000003e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000363093  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  43.68 
 
 
314 aa  281  9e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0095  MoxR protein  53.42 
 
 
317 aa  281  1e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2964  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.62 
 
 
305 aa  281  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00460178 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0187  ATPase  49.47 
 
 
313 aa  281  1e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3201  ATPase  47.44 
 
 
319 aa  281  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2538  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  40.2 
 
 
314 aa  281  1e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6584  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.69 
 
 
325 aa  281  1e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.597099 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0216  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.69 
 
 
302 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316575  normal  0.204344 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3112  ATPase  49.82 
 
 
331 aa  280  2e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4029  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.87 
 
 
306 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2912  ATPase  49.11 
 
 
331 aa  280  3e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0275816  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  47.48 
 
 
308 aa  280  3e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0802  ATPase  49.48 
 
 
317 aa  279  4e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0476  ATPase  50 
 
 
317 aa  279  4e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0240  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.32 
 
 
303 aa  278  6e-74  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.288695  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1679  ATPase  47.35 
 
 
305 aa  278  7e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2275  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.61 
 
 
322 aa  278  8e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.67 
 
 
325 aa  278  9e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1359  ATPase  45.36 
 
 
310 aa  277  1e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.020418  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0180  ATPase  47.99 
 
 
320 aa  278  1e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0627815  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1696  MoxR family protein  49.83 
 
 
313 aa  277  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0958  MoxR-like ATPase  45.57 
 
 
457 aa  276  2e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2560  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  40.53 
 
 
315 aa  276  2e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.050472  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  46.26 
 
 
347 aa  276  4e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2134  MoxR protein  42.56 
 
 
320 aa  275  6e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0438  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.32 
 
 
316 aa  275  7e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>