More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2151 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2106  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  90.3 
 
 
464 aa  879  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1692  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  99.14 
 
 
464 aa  955  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.215126 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3862  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  96.12 
 
 
464 aa  931  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25390  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  85.34 
 
 
464 aa  843  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2169  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  85.13 
 
 
464 aa  843  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1719  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  68.75 
 
 
464 aa  684  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0974339  normal  0.028819 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1923  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  69.61 
 
 
463 aa  681  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3591  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  100 
 
 
464 aa  962  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.343336 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2151  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  100 
 
 
464 aa  962  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148708  decreased coverage  0.00883462 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14670  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  84.91 
 
 
464 aa  832  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1668  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  98.28 
 
 
464 aa  950  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1901  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  90.09 
 
 
477 aa  877  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.961651  decreased coverage  0.000428846 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1577  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  70.26 
 
 
463 aa  689  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00876863  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1603  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  87.72 
 
 
464 aa  860  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.073582  normal  0.0278892 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0194  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  61.9 
 
 
468 aa  608  1e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4502  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  60.39 
 
 
466 aa  604  1e-172  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0108138  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0188  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  61.69 
 
 
468 aa  605  1e-172  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4054  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  60.61 
 
 
466 aa  605  1e-172  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0478182 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4196  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  60.61 
 
 
466 aa  605  1e-172  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.194644  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4024  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  60.39 
 
 
466 aa  604  1e-172  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5422  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  60.39 
 
 
466 aa  604  1e-172  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.349391 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0118  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  61.9 
 
 
476 aa  604  1e-172  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0589234  normal  0.30721 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4336  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  60.82 
 
 
470 aa  603  1e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4531  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  61.04 
 
 
470 aa  604  1e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.455944  hitchhiker  5.33814e-06 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4457  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  60.82 
 
 
470 aa  603  1e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  1.63377e-07 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4408  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  60.39 
 
 
466 aa  603  1e-171  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0258323  normal  0.0356369 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0128  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  61.47 
 
 
468 aa  603  1e-171  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.964966  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4024  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  60.82 
 
 
466 aa  603  1e-171  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.257057  normal  0.0391743 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4454  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  60.82 
 
 
470 aa  604  1e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116536 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4447  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  60.39 
 
 
466 aa  603  1e-171  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4367  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  60.82 
 
 
470 aa  604  1e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03847  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  60.17 
 
 
466 aa  600  1e-170  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0805855  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0334  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  61.04 
 
 
466 aa  598  1e-170  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03796  hypothetical protein  60.17 
 
 
466 aa  600  1e-170  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0623556  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4774  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  60.78 
 
 
465 aa  598  1e-169  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.125317  hitchhiker  0.00386206 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0914  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  62.83 
 
 
470 aa  597  1e-169  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.75336  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4078  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  60.61 
 
 
466 aa  593  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0118  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  60.61 
 
 
466 aa  593  1e-168  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.483779  normal  0.676164 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3787  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  60.82 
 
 
468 aa  594  1e-168  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03582  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  61.26 
 
 
473 aa  591  1e-168  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.747985  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0137  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  60.61 
 
 
466 aa  593  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.647839  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00265  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  60.95 
 
 
476 aa  588  1e-167  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002152  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  60.04 
 
 
466 aa  586  1e-166  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0102006  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1805  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  61.99 
 
 
466 aa  587  1e-166  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2370  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  59.65 
 
 
466 aa  583  1e-165  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.13082e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2890  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  59.44 
 
 
471 aa  575  1e-163  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.784387  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5091  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  58.06 
 
 
466 aa  569  1e-161  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412969  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3567  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  57.48 
 
 
476 aa  556  1e-157  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.593485  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1036  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  59.65 
 
 
547 aa  546  1e-154  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.746079  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1333  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  59.87 
 
 
547 aa  548  1e-154  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.201704  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0951  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  60.39 
 
 
546 aa  544  1e-153  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  5.60958e-06  hitchhiker  0.00448412 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2047  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  45.22 
 
 
467 aa  399  1e-110  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.154966  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5462  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  43.94 
 
 
471 aa  388  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0855714  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3223  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  44.28 
 
 
463 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2448  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  44.03 
 
 
471 aa  382  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.518866 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12727  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  43.94 
 
 
468 aa  380  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6317  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  43.51 
 
 
467 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419159  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0212  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  42.61 
 
 
476 aa  372  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0843  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  43.53 
 
 
472 aa  374  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3883  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  42.27 
 
 
470 aa  366  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.616657  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2476  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  41.04 
 
 
474 aa  357  2e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5306  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  42.3 
 
 
477 aa  353  5e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1707  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  39.87 
 
 
469 aa  351  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3945  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  41.15 
 
 
481 aa  351  2e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.332023  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1509  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  39.22 
 
 
469 aa  351  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1462  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  39.91 
 
 
502 aa  348  8e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0372006 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3831  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  40.56 
 
 
476 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3447  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  38.96 
 
 
501 aa  343  3e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3894  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  40.13 
 
 
476 aa  342  1e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.199328  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3972  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  40.13 
 
 
476 aa  341  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0781763  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3303  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  39.09 
 
 
462 aa  338  1e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00106265 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2516  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  38.07 
 
 
465 aa  293  4e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.05 
 
 
467 aa  252  8e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.29 
 
 
458 aa  251  3e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.84 
 
 
467 aa  250  3e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0938  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.19 
 
 
471 aa  247  4e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.15 
 
 
458 aa  243  8e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1532  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.97 
 
 
460 aa  241  2e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.631051 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3964  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.55 
 
 
468 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321391  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.05 
 
 
480 aa  241  2e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.55 
 
 
471 aa  241  3e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.578679  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0274  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.62 
 
 
467 aa  239  8e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.05 
 
 
468 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.47 
 
 
467 aa  238  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4116  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.61 
 
 
468 aa  233  4e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.608117  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0550  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.47 
 
 
467 aa  233  4e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00865571  normal  0.262982 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0180  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.47 
 
 
467 aa  233  5e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0425  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.03 
 
 
467 aa  232  1e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6035  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.94 
 
 
466 aa  231  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0837  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.78 
 
 
462 aa  230  4e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0629808 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2936  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.09 
 
 
468 aa  228  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.13 
 
 
473 aa  227  3e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.737232  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0926  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.54 
 
 
467 aa  228  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.566278  normal  0.378334 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3400  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.32 
 
 
470 aa  227  4e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.131603  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.74 
 
 
469 aa  226  5e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3360  dihydrolipoyl dehydrogenanse  32.47 
 
 
466 aa  226  8e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0306833 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2397  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.09 
 
 
468 aa  224  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00706968 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0183  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.74 
 
 
467 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5671  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.25 
 
 
466 aa  224  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.11 
 
 
467 aa  224  3e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>