More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0118 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0188  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  86.7 
 
 		 468 aa  851    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03847  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  83.48 
 
 		 466 aa  823    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0805855  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0137  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  100 
 
 		 466 aa  967    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.647839  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4024  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  83.48 
 
 		 466 aa  823    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4502  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  83.48 
 
 		 466 aa  823    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0108138  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4078  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  100 
 
 		 466 aa  967    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4774  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  88.2 
 
 		 465 aa  863    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.125317  hitchhiker  0.00386206 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0334  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  69.96 
 
 		 466 aa  697    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4024  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  83.05 
 
 		 466 aa  823    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.257057  normal  0.0391743 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0128  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  86.48 
 
 		 468 aa  846    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.964966  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03582  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  69.91 
 
 		 473 aa  703    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.747985  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5422  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  83.48 
 
 		 466 aa  823    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.349391 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4531  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  84.55 
 
 		 470 aa  830    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.455944  hitchhiker  0.00000533814 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03796  hypothetical protein  83.48 
 
 		 466 aa  823    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0623556  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4408  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  83.69 
 
 		 466 aa  825    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0258323  normal  0.0356369 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4336  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  84.55 
 
 		 470 aa  829    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4196  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  83.26 
 
 		 466 aa  823    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.194644  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0194  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  86.48 
 
 		 468 aa  848    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00265  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  75.75 
 
 		 476 aa  745    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4457  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  84.55 
 
 		 470 aa  829    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000163377 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4367  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  84.55 
 
 		 470 aa  830    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0118  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  100 
 
 		 466 aa  967    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.483779  normal  0.676164 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2890  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  76.14 
 
 		 471 aa  749    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.784387  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3787  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  86.27 
 
 		 468 aa  842    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4447  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  83.48 
 
 		 466 aa  823    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002152  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  76.36 
 
 		 466 aa  744    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0102006  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4454  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  84.55 
 
 		 470 aa  830    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116536 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4054  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  83.26 
 
 		 466 aa  823    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0478182 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2370  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  76.82 
 
 		 466 aa  753    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000113082  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0118  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  70.11 
 
 		 476 aa  698    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0589234  normal  0.30721 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2169  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  63.2 
 
 		 464 aa  618  1e-176  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25390  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  63.2 
 
 		 464 aa  618  1e-176  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0914  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  65 
 
 		 470 aa  617  1e-175  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.75336  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14670  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  63.64 
 
 		 464 aa  612  9.999999999999999e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2106  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  61.9 
 
 		 464 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1901  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  61.69 
 
 		 477 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.961651  decreased coverage  0.000428846 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1719  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  62.69 
 
 		 464 aa  598  1e-170  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0974339  normal  0.028819 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1603  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  62.34 
 
 		 464 aa  601  1e-170  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.073582  normal  0.0278892 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5091  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  61.61 
 
 		 466 aa  599  1e-170  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1577  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  62.91 
 
 		 463 aa  595  1e-169  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00876863  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2151  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  60.61 
 
 		 464 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148708  decreased coverage  0.00883462 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1923  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  61.16 
 
 		 463 aa  592  1e-168  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3862  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  60.39 
 
 		 464 aa  592  1e-168  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1668  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  60.17 
 
 		 464 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1692  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  60.61 
 
 		 464 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215126 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3591  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  60.61 
 
 		 464 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.343336 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3567  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  60.74 
 
 		 476 aa  573  1.0000000000000001e-162  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.593485  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1805  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  58.57 
 
 		 466 aa  538  1e-151  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1036  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  57.63 
 
 		 547 aa  528  1e-148  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.746079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1333  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  57.2 
 
 		 547 aa  523  1e-147  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.201704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0951  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  57.02 
 
 		 546 aa  521  1e-147  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000560958  hitchhiker  0.00448412 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2047  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  45.99 
 
 		 467 aa  410  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.154966  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3883  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  44.42 
 
 		 470 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.616657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5462  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  43.68 
 
 		 471 aa  398  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0855714  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0212  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  44.25 
 
 		 476 aa  393  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6317  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  44.73 
 
 		 467 aa  393  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419159  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0843  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  44.59 
 
 		 472 aa  392  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2448  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  44.54 
 
 		 471 aa  393  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518866 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12727  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  43.72 
 
 		 468 aa  382  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3223  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  43.38 
 
 		 463 aa  376  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5306  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  43.91 
 
 		 477 aa  371  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3447  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  41.05 
 
 		 501 aa  360  3e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2476  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  39.96 
 
 		 474 aa  357  1.9999999999999998e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1509  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  39.66 
 
 		 469 aa  356  5.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3945  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  40.6 
 
 		 481 aa  355  7.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.332023  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1707  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  39.87 
 
 		 469 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1462  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  38.23 
 
 		 502 aa  350  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0372006 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3831  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  41.29 
 
 		 476 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3972  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  41.08 
 
 		 476 aa  345  7e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0781763  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3894  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  41.08 
 
 		 476 aa  345  7e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.199328  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3303  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  39.7 
 
 		 462 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00106265 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2516  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  37.42 
 
 		 465 aa  296  8e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6035  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.05 
 
 		 466 aa  251  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1532  dihydrolipoamide dehydrogenase  34 
 
 		 460 aa  248  1e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.631051 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.33 
 
 		 458 aa  246  8e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06220  Dihydrolipoyl dehydrogenase  32.4 
 
 		 468 aa  241  2e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.33 
 
 		 467 aa  240  4e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.75 
 
 		 465 aa  239  5.999999999999999e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.12 
 
 		 467 aa  238  2e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0938  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.05 
 
 		 471 aa  236  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.97 
 
 		 467 aa  237  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7124  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.15 
 
 		 467 aa  237  4e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.33 
 
 		 480 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.26 
 
 		 471 aa  236  6e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.578679  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3964  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.62 
 
 		 468 aa  233  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.48 
 
 		 463 aa  233  7.000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2936  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.34 
 
 		 468 aa  231  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.41 
 
 		 467 aa  231  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3309  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.4 
 
 		 462 aa  231  2e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.900179  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.6 
 
 		 458 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.09 
 
 		 459 aa  230  4e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.341599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.19 
 
 		 467 aa  230  5e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0027  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.11 
 
 		 468 aa  229  6e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0425  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.03 
 
 		 467 aa  229  7e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.98 
 
 		 468 aa  229  9e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3360  dihydrolipoyl dehydrogenanse  32.9 
 
 		 466 aa  228  1e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0306833 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.34 
 
 		 468 aa  229  1e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4116  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.12 
 
 		 468 aa  229  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.608117  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3400  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.91 
 
 		 470 aa  228  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.131603  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1264  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.33 
 
 		 472 aa  228  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.71337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>