40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0594 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_13891  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  296  7e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0594  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  296  7e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10991  double-stranded beta-helix domain-containing protein  43.7 
 
 
146 aa  121  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1506  hypothetical protein  35.17 
 
 
141 aa  86.7  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12421  hypothetical protein  33.79 
 
 
141 aa  84.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13991  hypothetical protein  35.04 
 
 
146 aa  78.6  2e-14  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0597  hypothetical protein  35.04 
 
 
146 aa  78.6  3e-14  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.403415  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16041  hypothetical protein  33.91 
 
 
141 aa  75.1  3e-13  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1204  hypothetical protein  30.77 
 
 
156 aa  72.8  2e-12  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.259392  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02199  hypothetical protein  32.33 
 
 
139 aa  71.2  4e-12  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0300  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.8 
 
 
152 aa  70.9  5e-12  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0909  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.66 
 
 
137 aa  70.5  7e-12  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  1.67326e-09  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0998  hypothetical protein  31.11 
 
 
142 aa  70.1  9e-12  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1225  hypothetical protein  31.58 
 
 
140 aa  69.7  1e-11  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04261  hypothetical protein  28.87 
 
 
142 aa  68.9  2e-11  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.648244  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16011  hypothetical protein  33.03 
 
 
155 aa  68.6  3e-11  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8356 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12971  hypothetical protein  29.75 
 
 
140 aa  67  7e-11  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.298883  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13041  hypothetical protein  29.75 
 
 
140 aa  67  8e-11  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1726  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.85 
 
 
150 aa  64.7  4e-10  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.680674  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1250  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.26 
 
 
193 aa  63.2  1e-09  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015051 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2532  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.25 
 
 
178 aa  59.3  2e-08  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3496  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.62 
 
 
140 aa  55.8  2e-07  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2224  hypothetical protein  34.55 
 
 
166 aa  55.5  2e-07  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0868  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.9 
 
 
142 aa  55.1  3e-07  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3175  cupin 2 domain-containing protein  33.68 
 
 
135 aa  54.3  5e-07  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1610  cupin 2, barrel  27.86 
 
 
143 aa  53.5  8e-07  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  3.44419e-05 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1633  hypothetical protein  26.09 
 
 
141 aa  53.5  9e-07  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2628  cupin 2 domain-containing protein  29.91 
 
 
157 aa  53.1  1e-06  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.074736  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1978  cupin 2 domain-containing protein  29.41 
 
 
144 aa  52.4  2e-06  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3656  cupin 2, barrel  28.18 
 
 
148 aa  51.2  4e-06  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110053  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  34.21 
 
 
129 aa  48.5  3e-05  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00650  hypothetical protein  31.33 
 
 
142 aa  48.5  3e-05  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0053  hypothetical protein  29.81 
 
 
142 aa  48.1  4e-05  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1314  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.04 
 
 
166 aa  47.4  6e-05  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  4.42476e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0909  hypothetical protein  37.33 
 
 
125 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0993672  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3293  cupin 2 domain-containing protein  28.06 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.661006 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2157  cupin 2, barrel  25.23 
 
 
147 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0974853 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1831  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.81 
 
 
149 aa  42  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137972  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1350  cupin 2 domain-containing protein  26.12 
 
 
147 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.687777  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1491  cupin:protein of unknown function DUF861  30.12 
 
 
133 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>