51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_62621 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009046  PICST_62621  predicted protein  100 
 
 
310 aa  650    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.15027  normal  0.247728 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03879  histone acetylase (Eurofung)  48.87 
 
 
533 aa  319  3e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0406003  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47700  predicted protein  45.88 
 
 
240 aa  187  2e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.106047  normal  0.135513 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02102  acetyltransferase, GNAT family, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05085)  44.81 
 
 
217 aa  148  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.413597  normal  0.539659 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02770  conserved hypothetical protein  36.65 
 
 
220 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3278  GCN5-related N-acetyltransferase  39.74 
 
 
182 aa  109  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0231  putative acetyltransferase  37.39 
 
 
174 aa  82  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.329835 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4611  GCN5-related N-acetyltransferase  35.88 
 
 
162 aa  80.9  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3478  GCN5-related N-acetyltransferase  42.35 
 
 
164 aa  73.6  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1269  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  30.2 
 
 
338 aa  72.8  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000955314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7386  GCN5-related N-acetyltransferase  36.67 
 
 
165 aa  70.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10460  sortase-like acyltransferase  42.5 
 
 
160 aa  70.1  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.81082  hitchhiker  0.0000000159699 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0542  GCN5-related N-acetyltransferase  34.31 
 
 
173 aa  68.2  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.2131e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2307  putative acetyltransferase  28.67 
 
 
139 aa  67.8  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.646329  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1964  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
159 aa  67  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0200321 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13010  sortase-like acyltransferase  29.69 
 
 
177 aa  66.6  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1604  GCN5-related N-acetyltransferase  29.31 
 
 
165 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.386581  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1769  acetyltransferase  29.31 
 
 
165 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000686927  normal  0.0139792 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0047  GCN5-related N-acetyltransferase  34.26 
 
 
165 aa  64.3  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.66941  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5083  GCN5-related N-acetyltransferase  30.88 
 
 
161 aa  64.3  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1499  acetyltransferase  28.74 
 
 
165 aa  63.5  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.02186e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0403  GCN5-related N-acetyltransferase  34.62 
 
 
161 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3341  GCN5-related N-acetyltransferase  32.22 
 
 
166 aa  62.4  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5882  GCN5-related N-acetyltransferase  28.67 
 
 
160 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3077  GCN5-related N-acetyltransferase  25.19 
 
 
189 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4429  GCN5-related N-acetyltransferase  29.01 
 
 
185 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.644059 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1711  GCN5-related N-acetyltransferase  34.48 
 
 
163 aa  61.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000345793  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0047  GCN5-related protein N-acetyltransferase  38.1 
 
 
174 aa  61.2  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1377  GCN5-related N-acetyltransferase  30.22 
 
 
168 aa  60.8  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000971374  normal  0.678083 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2343  GCN5-related N-acetyltransferase  25.98 
 
 
191 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.632249  normal  0.0872678 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0018  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
173 aa  61.6  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3954  GCN5-related N-acetyltransferase  29.93 
 
 
163 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6796  GCN5-related N-acetyltransferase  28 
 
 
160 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2421  acetyltransferase  25.93 
 
 
183 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.966349  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5025  GCN5-related N-acetyltransferase  34.52 
 
 
162 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5341  GCN5-related N-acetyltransferase  30.61 
 
 
169 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.495041 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3509  GCN5-related N-acetyltransferase  33.73 
 
 
169 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.475191  normal  0.0883622 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4459  GCN5-related N-acetyltransferase  34.12 
 
 
162 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2061  GCN5-related N-acetyltransferase  25.19 
 
 
189 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0996042  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5091  GCN5-related N-acetyltransferase  29.59 
 
 
167 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.839368 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4322  GCN5-related N-acetyltransferase  29.2 
 
 
163 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.21987 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2533  acetyltransferase, GNAT family  25.93 
 
 
191 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177465  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0410  GCN5-related N-acetyltransferase  27.4 
 
 
171 aa  57.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.539427  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2511  GCN5-related N-acetyltransferase  32.53 
 
 
169 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.232061  normal  0.976863 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3917  GCN5-related N-acetyltransferase  29.59 
 
 
169 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.93894 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2527  GCN5-related N-acetyltransferase  33.73 
 
 
173 aa  56.6  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0524  GCN5-related N-acetyltransferase  29.01 
 
 
160 aa  54.7  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.610284  normal  0.0661869 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3274  GCN5-related N-acetyltransferase  27.41 
 
 
189 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0303  GCN5-related N-acetyltransferase  25.95 
 
 
160 aa  49.7  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0653192 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3603  GCN5-related N-acetyltransferase  29.52 
 
 
193 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2899  GCN5-related N-acetyltransferase  28.74 
 
 
178 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>