40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_36743 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011679  PHATR_36743  predicted protein  100 
 
 		 149 aa  299  8.000000000000001e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.931628  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79967  predicted protein  57.04 
 
 		 154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01710  nucleolar protein family A member 2, putative  58.82 
 
 		 225 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00695  small nuclear ribonucleoprotein complex protein Nhp2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13570)  50.36 
 
 		 224 aa  106  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17769  predicted protein  52.38 
 
 		 171 aa  103  8e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000637772  hitchhiker  0.00579454 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01500  snRNP subunit, putative  37.08 
 
 		 127 aa  79.7  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53138  predicted protein  38.2 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9983  predicted protein  39.33 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1068  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  36.08 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.0039063  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2132  50S ribosomal protein L7Ae  33.65 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00358351  hitchhiker  0.0000558661 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0219  50S ribosomal protein L7Ae  36.9 
 
 		 117 aa  67  0.00000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000043194  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41236  predicted protein  41.94 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0081  50S ribosomal protein L7Ae  32.95 
 
 		 117 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.309731  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1846  50S ribosomal protein L7Ae  35 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0589  50S ribosomal protein L7Ae  40 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.962005  hitchhiker  0.000204671 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1580  50S ribosomal protein L7Ae  39.47 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0963  50S ribosomal protein L7Ae  32.97 
 
 		 136 aa  62  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1553  50S ribosomal protein L7Ae  34.07 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.751058  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1759  50S ribosomal protein L7Ae  39.47 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0217268  hitchhiker  0.000585072 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0248  50S ribosomal protein L7Ae  32.97 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.182406  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1665  50S ribosomal protein L7Ae  32.97 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0339872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1236  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  35.53 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0443  50S ribosomal protein L7Ae  39.44 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0331  50S ribosomal protein L7Ae  33.71 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0493  50S ribosomal protein L7Ae  37.08 
 
 		 129 aa  60.1  0.000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0225  50S ribosomal protein L7Ae  36.92 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1601  50S ribosomal protein L7Ae  31.11 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.718255 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01319  snRNP and snoRNP protein (Snu13), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05950)  39.33 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.010186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3388  50S ribosomal protein L7Ae  30 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000000732492  normal  0.0682764 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2621  50S ribosomal protein L7Ae  33.87 
 
 		 120 aa  57  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302096  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0750  50S ribosomal protein L7Ae  32.5 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.897962  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1842  50S ribosomal protein L7Ae  32.53 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00104534  normal  0.186642 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0690  50S ribosomal protein L7Ae  32 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.197581 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2527  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  32.86 
 
 		 120 aa  53.5  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1497  50S ribosomal protein L7Ae  31.43 
 
 		 122 aa  53.5  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.122049 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0451  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  31.43 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.202723  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0523  50S ribosomal protein L7Ae  28 
 
 		 122 aa  50.8  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.535144 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0721  50S ribosomal protein L7Ae  25.84 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0318706  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41276  Ribosomal protein L7a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  27.63 
 
 		 254 aa  47  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_23079  predicted protein  24.24 
 
 		 259 aa  40.8  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.740425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>