24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_41189 on replicon NC_011696
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011696  PHATRDRAFT_41189  predicted protein  100 
 
 
307 aa  632  1e-180  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43046  predicted protein  30.04 
 
 
301 aa  99.8  5e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43034  predicted protein  28.19 
 
 
493 aa  96.3  6e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34956  predicted protein  24.84 
 
 
349 aa  94.7  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.349779  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42423  predicted protein  30.04 
 
 
320 aa  89  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.126266  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32087  predicted protein  29.82 
 
 
297 aa  77.4  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.930891  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31942  predicted protein  25 
 
 
330 aa  76.3  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49894  predicted protein  31.18 
 
 
303 aa  74.3  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.380598  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49373  predicted protein  25.93 
 
 
362 aa  68.6  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.483156  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02137  G2/mitotic-specific cyclin (Clb3), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16150)  27.98 
 
 
629 aa  63.2  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.528656  normal  0.726877 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00160  g2/mitotic-specific cyclin cdc13, putative  26.95 
 
 
534 aa  62  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.131083  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82085  B-type cyclin  27.49 
 
 
317 aa  60.8  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81868  G2/mitotic-specific cyclin  27.67 
 
 
464 aa  60.1  0.00000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.361476  normal  0.530711 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31939  predicted protein  31.67 
 
 
261 aa  59.3  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.469173  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03648  G2/mitotic-specific cyclin-B [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P30284]  27.22 
 
 
490 aa  56.6  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40753  predicted protein  23.57 
 
 
385 aa  54.3  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.987836  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39570  predicted protein  23.86 
 
 
338 aa  53.9  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00503372  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_91093  predicted protein  19.85 
 
 
457 aa  50.8  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.018658  normal  0.046308 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38865  predicted protein  23.53 
 
 
394 aa  47  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00990  conserved hypothetical protein  25.95 
 
 
427 aa  47  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.179742  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04400  cyclin-dependent protein kinase regulator, putative  25.37 
 
 
479 aa  45.8  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28367  predicted protein  25.44 
 
 
319 aa  43.1  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0208891  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119556  predicted protein  22.73 
 
 
331 aa  42.4  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.470219  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_37002  predicted protein  21.95 
 
 
467 aa  42.4  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0120231  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>