More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2543 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3563  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  100 
 
 
406 aa  851  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5201  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  74.51 
 
 
403 aa  654  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.86768e-21 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2543  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  100 
 
 
406 aa  851  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5047  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  64.56 
 
 
400 aa  552  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3658  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  65.06 
 
 
405 aa  542  1e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108889  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4840  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  62.26 
 
 
439 aa  537  1e-151  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00169429  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0782  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  59.95 
 
 
440 aa  521  1e-146  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00024869  unclonable  7.85266e-08 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0978  ferredoxin-NADP oxidoreductase  62.13 
 
 
403 aa  506  1e-142  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  2.02848e-06  normal  0.0244193 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0749  ferredoxin--NADP reductase (FNR)  55.19 
 
 
398 aa  410  1e-113  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.14944  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1917  ferredoxin--NADP reductase (FNR)  53.59 
 
 
396 aa  387  1e-106  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.484005  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1086  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  57.36 
 
 
370 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.569863  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09411  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  58.84 
 
 
366 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0946789 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11821  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  57.89 
 
 
321 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.140856  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11811  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  57.86 
 
 
326 aa  381  1e-104  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11651  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  60.27 
 
 
384 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11131  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  54.82 
 
 
361 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.93922 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0675  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  56.82 
 
 
381 aa  358  1e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15081  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  57.48 
 
 
387 aa  355  9e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.459762  normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_23717  predicted protein  47 
 
 
340 aa  279  7e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.239668  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12813  predicted protein  46.33 
 
 
298 aa  268  2e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_42018  predicted protein  46.33 
 
 
320 aa  267  2e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.953925  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15777  predicted protein  48.17 
 
 
299 aa  267  3e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.112856  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28333  predicted protein  39.59 
 
 
360 aa  259  7e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0642636  normal  0.462802 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1220  benzoyl-CoA oxygenase subunit A  35.07 
 
 
415 aa  188  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.655891  normal  0.0139439 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1323  benzoyl-CoA oxygenase, component A  35.76 
 
 
417 aa  186  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1538  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  35.42 
 
 
416 aa  179  5e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6638  benzoyl-CoA oxygenase, component A  35.64 
 
 
393 aa  178  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297273  normal  0.0982181 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0095  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  35.99 
 
 
428 aa  176  7e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2694  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  34.72 
 
 
413 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0890  benzoyl-CoA oxygenase, component A  33.68 
 
 
414 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.48377 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1630  benzoyl-CoA oxygenase, component A  37.31 
 
 
426 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170592  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1424  benzoyl-CoA oxygenase, component A  33.33 
 
 
413 aa  169  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3661  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  37.16 
 
 
431 aa  167  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0072  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  32.59 
 
 
439 aa  168  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.860838  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0734  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  30.99 
 
 
424 aa  167  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.197929  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2942  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  36.54 
 
 
427 aa  163  5e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.453854  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0222  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  32.62 
 
 
423 aa  153  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0402  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  36.09 
 
 
613 aa  120  4e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002350  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  32.61 
 
 
623 aa  106  8e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3738  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  32.48 
 
 
607 aa  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00005  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein subunit alpha  33.48 
 
 
631 aa  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1259  molybdopterin oxidoreductase  33.33 
 
 
1257 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.804791  normal  0.0187222 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3807  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  31.62 
 
 
591 aa  105  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0251884 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0932  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.05 
 
 
599 aa  104  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.520918  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0631  FAD-binding domain protein  33.04 
 
 
376 aa  103  4e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.346009 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2795  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  33.04 
 
 
614 aa  103  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0773977  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0855  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  32.05 
 
 
604 aa  103  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.111088  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4039  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.17 
 
 
610 aa  103  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0892  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  32.05 
 
 
604 aa  103  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3193  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.07 
 
 
596 aa  102  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3080  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  32.05 
 
 
604 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274835  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1302  molybdopterin oxidoreductase  32.9 
 
 
1338 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.791008 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0546  molybdopterin oxidoreductase  34.35 
 
 
1409 aa  100  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3491  molybdopterin oxidoreductase  33.64 
 
 
1312 aa  100  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.421 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0776  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.91 
 
 
594 aa  99.8  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03589  sulfite reductase, alpha subunit (flavoprotein)  32.2 
 
 
608 aa  99  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0827  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  33.19 
 
 
607 aa  99.4  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4016  molybdopterin oxidoreductase  33.76 
 
 
1341 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.115945  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0992  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  32.48 
 
 
245 aa  98.2  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0107588 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1395  molybdopterin oxidoreductase  32.48 
 
 
1384 aa  97.4  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.427794  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1703  molybdopterin oxidoreductase  33.76 
 
 
1357 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3748  sulfite reductase  35.32 
 
 
540 aa  96.7  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0282506 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3527  sulfite reductase subunit alpha  32.34 
 
 
609 aa  96.3  8e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.400097  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0953  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.34 
 
 
599 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0653  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.6 
 
 
598 aa  95.9  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.988648  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0810  sulfite reductase subunit alpha  32.13 
 
 
599 aa  95.1  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3416  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.34 
 
 
599 aa  94.4  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1906  FAD-binding domain protein  31.49 
 
 
628 aa  94.7  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0858  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.34 
 
 
605 aa  94.7  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0919  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.34 
 
 
599 aa  94.7  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0944  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.34 
 
 
599 aa  94.7  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3016  molybdopterin oxidoreductase  32.72 
 
 
1317 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.253668  normal  0.632425 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3365  sulfite reductase subunit alpha  31.36 
 
 
609 aa  94  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.834699  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3102  sulfite reductase subunit alpha  31.06 
 
 
599 aa  94  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0271703  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0924  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.79 
 
 
599 aa  93.6  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0948  sulfite reductase subunit alpha  29.79 
 
 
599 aa  93.6  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.404353 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3066  sulfite reductase subunit alpha  29.79 
 
 
599 aa  93.6  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.944096  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0157  CpcD phycobilisome linker domain protein  66.67 
 
 
79 aa  92.8  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00508163 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0665  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.91 
 
 
594 aa  92.4  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000314937 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3111  sulfite reductase subunit alpha  29.79 
 
 
599 aa  92.8  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3121  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha component  26.78 
 
 
588 aa  91.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.500128  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4122  molybdopterin oxidoreductase  31.88 
 
 
1405 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0706903  normal  0.0956254 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3078  CpcD phycobilisome linker domain protein  62.32 
 
 
78 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4018  sulfite reductase subunit alpha  29.36 
 
 
599 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.104123  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2720  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.78 
 
 
588 aa  91.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.893392  unclonable  7.26752e-11 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3078  sulfite reductase subunit alpha  30.64 
 
 
599 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.282259  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3056  FAD-binding domain protein  32.91 
 
 
554 aa  92  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3159  sulfite reductase subunit alpha  30.64 
 
 
599 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.87087  normal  0.534662 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02609  sulfite reductase, alpha subunit, flavoprotein  29.36 
 
 
599 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2892  sulfite reductase subunit alpha  29.36 
 
 
599 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3790  FAD-binding domain-containing protein  34.48 
 
 
388 aa  91.7  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.146822  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5007  sulfite reductase  33.48 
 
 
535 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.125173  normal  0.198772 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02572  hypothetical protein  29.36 
 
 
599 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2904  sulfite reductase subunit alpha  29.36 
 
 
599 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3260  sulfite reductase subunit alpha  30.64 
 
 
599 aa  91.3  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.25406 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0773  molybdopterin oxidoreductase  31.3 
 
 
1407 aa  90.9  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1985  molybdopterin oxidoreductase  31 
 
 
1403 aa  90.5  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.279834 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0317  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  33.05 
 
 
1383 aa  90.5  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3064  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.06 
 
 
599 aa  90.5  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.286269  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2733  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  33.85 
 
 
584 aa  90.5  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.461724  hitchhiker  3.24313e-06 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>