More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0052 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0052  30S ribosomal protein S12  100 
 
 
123 aa  247  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1539  30S ribosomal protein S12  96.75 
 
 
125 aa  241  2e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1564  30S ribosomal protein S12  96.75 
 
 
125 aa  241  2e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0581883  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1290  30S ribosomal protein S12  94.31 
 
 
127 aa  237  3e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116832  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0711  30S ribosomal protein S12  91.87 
 
 
136 aa  233  5e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305716  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0659  30S ribosomal protein S12  92.68 
 
 
127 aa  233  6e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254594  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0887  30S ribosomal protein S12  91.06 
 
 
124 aa  230  5e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000822603 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0473  30S ribosomal protein S12  88.62 
 
 
124 aa  226  1e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0323  30S ribosomal protein S12  87.8 
 
 
124 aa  223  6e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.436822  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2019  30S ribosomal protein S12  88.62 
 
 
124 aa  223  6e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16341  30S ribosomal protein S12  86.99 
 
 
123 aa  222  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.369961  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23611  30S ribosomal protein S12  86.99 
 
 
125 aa  219  7e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.436727 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1603  30S ribosomal protein S12  85.37 
 
 
124 aa  218  2e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.373494  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17141  30S ribosomal protein S12  85.37 
 
 
124 aa  218  2e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.387317  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16911  30S ribosomal protein S12  85.37 
 
 
125 aa  218  2e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17021  30S ribosomal protein S12  85.37 
 
 
124 aa  218  2e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19521  30S ribosomal protein S12  85.37 
 
 
124 aa  217  5e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1077  30S ribosomal protein S12  84.55 
 
 
124 aa  216  1e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2465  30S ribosomal protein S12  82.93 
 
 
124 aa  214  3e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0122546 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2338  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 
125 aa  214  4e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  5.75958e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2263  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 
123 aa  214  5e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12469  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0075  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 
123 aa  213  7e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392906 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1551  30S ribosomal protein S12  82.93 
 
 
123 aa  213  8e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00133332  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0621  30S ribosomal protein S12  82.11 
 
 
123 aa  211  2e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.30783e-07  decreased coverage  1.90944e-21 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0704  30S ribosomal protein S12  82.93 
 
 
123 aa  210  6e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  7.38801e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1529  ribosomal protein S12  81.3 
 
 
124 aa  210  6e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  2.23739e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1907  30S ribosomal protein S12  82.79 
 
 
123 aa  210  6e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0208943 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1929  30S ribosomal protein S12  83.47 
 
 
123 aa  209  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1950  30S ribosomal protein S12  83.47 
 
 
123 aa  209  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.913755  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2014  30S ribosomal protein S12  83.47 
 
 
123 aa  209  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2071  30S ribosomal protein S12  82.11 
 
 
123 aa  209  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.944717  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1341  30S ribosomal protein S12  82.11 
 
 
123 aa  208  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  3.69822e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0210  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 
124 aa  208  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000110555  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4009  ribosomal protein S12  82.11 
 
 
123 aa  208  3e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0866702  normal  0.990626 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1426  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 
126 aa  207  3e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0159812  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0675  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 
123 aa  207  4e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00545662  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0220  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 
124 aa  207  4e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  6.30102e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1063  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 
123 aa  207  4e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.1853e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0296  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 
135 aa  207  5e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0842  30S ribosomal protein S12  82.11 
 
 
123 aa  207  5e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  1.17432e-05  hitchhiker  0.000366661 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2069  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 
128 aa  206  8e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  5.94982e-05  normal  0.793383 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2693  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 
123 aa  206  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315059  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2428  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 
135 aa  206  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0584234  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0364  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 
126 aa  204  2e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0389  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 
126 aa  204  2e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0175  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 
129 aa  205  2e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  1.8595e-11  normal  0.463989 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0284  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 
136 aa  204  3e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  3.09063e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2955  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 
125 aa  204  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0353473  hitchhiker  0.000186229 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3302  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 
125 aa  204  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  1.19116e-07  hitchhiker  0.00857233 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0355  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 
126 aa  204  3e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3024  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 
125 aa  204  3e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000203236  decreased coverage  0.00243586 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1221  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 
124 aa  204  4e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  7.86754e-06  hitchhiker  0.00402882 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0389  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 
124 aa  203  5e-52  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1856  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 
137 aa  203  5e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0880493  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0355  ribosomal protein S12  78.86 
 
 
125 aa  203  6e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  7.59048e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0281  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 
124 aa  203  7e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.03953e-07  decreased coverage  9.87169e-06 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0393  ribosomal protein S12  81.3 
 
 
123 aa  203  7e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.844601  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0540  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 
128 aa  202  9e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0511  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 
128 aa  202  9e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.288912  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0451  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 
127 aa  202  9e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1444  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 
128 aa  202  9e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2719  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 
126 aa  202  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0011677  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0401  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 
127 aa  202  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2405  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 
126 aa  202  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  8.79391e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0696  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 
123 aa  202  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.85077e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3185  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 
125 aa  202  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0661629  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2845  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 
126 aa  201  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.904067  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1770  30S ribosomal protein S12  84.55 
 
 
123 aa  201  2e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0593417  normal  0.388424 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3751  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 
126 aa  202  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0182749  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3809  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 
126 aa  202  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2301  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 
128 aa  201  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  7.03033e-07  decreased coverage  0.000703335 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1660  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 
124 aa  201  2e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.106297  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0595  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 
137 aa  202  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121004  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2234  30S ribosomal protein S12  80.17 
 
 
135 aa  201  2e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000995166  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3861  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 
125 aa  202  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1313  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 
127 aa  201  2e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00377072  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0274  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 
125 aa  202  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  1.34966e-11  unclonable  8.17173e-08 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0309  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 
126 aa  201  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0102814  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1047  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 
124 aa  202  2e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  6.71738e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3782  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 
126 aa  202  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00172098  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3073  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 
126 aa  202  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0733593  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0301  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 
124 aa  201  3e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000933242 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2764  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 
126 aa  201  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0416814  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3327  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 
125 aa  201  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.716206  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0322  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 
126 aa  201  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46074  normal  0.0169836 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0244  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 
126 aa  201  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240123  normal  0.127892 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2731  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 
123 aa  201  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0048  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 
126 aa  201  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  4.2248e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0271  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 
126 aa  201  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.635943 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3442  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 
126 aa  201  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  3.94059e-07  normal  0.236546 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0343  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 
126 aa  201  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0262  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 
126 aa  201  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.822385  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3649  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 
126 aa  201  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  1.11216e-08  hitchhiker  9.29733e-10 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3473  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 
126 aa  201  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0860232  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3914  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 
123 aa  200  4e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.455657  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0045  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 
126 aa  200  4e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  9.13228e-14  hitchhiker  7.76086e-21 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2637  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 
126 aa  201  4e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.419489  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1919  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 
126 aa  201  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000102606  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3174  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 
126 aa  201  4e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00103484  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1180  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 
124 aa  200  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275804  normal  0.0539297 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>