50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_03270 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3697  hypothetical protein  54.36 
 
 		 694 aa  689    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000334148 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03270  hypothetical protein  100 
 
 		 1045 aa  2115    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000014033  unclonable  1.7381799999999998e-20 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49810  hypothetical protein  92.44 
 
 		 979 aa  1841    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0875  hypothetical protein  68.13 
 
 		 462 aa  625  1e-177  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3696  hypothetical protein  61.44 
 
 		 406 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000237881 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3162  putative ATP-binding protein  27.09 
 
 		 1124 aa  242  2.9999999999999997e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0868  hypothetical protein  23.83 
 
 		 1137 aa  225  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4003  hypothetical protein  24.79 
 
 		 1126 aa  223  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.417635  normal  0.020693 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22910  hypothetical protein  26.96 
 
 		 1118 aa  219  2e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03539  putative ATP-binding protein  25.48 
 
 		 1143 aa  214  4.9999999999999996e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12714  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26370  hypothetical protein  23.91 
 
 		 1128 aa  205  4e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2294  hypothetical protein  24.98 
 
 		 1125 aa  204  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237724 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0735  hypothetical protein  24.75 
 
 		 1122 aa  201  5e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640704 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1809  hypothetical protein  25.35 
 
 		 1121 aa  194  7e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3738  putative ATP-binding protein  25.8 
 
 		 1153 aa  191  5.999999999999999e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0516  hypothetical protein  25.49 
 
 		 1121 aa  187  8e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.536264 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0892  hypothetical protein  25.81 
 
 		 1121 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0015  conserved hypothetical cytosolic protein  24.64 
 
 		 1124 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0843  hypothetical protein  25.43 
 
 		 1125 aa  179  2e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1444  hypothetical protein  24 
 
 		 1121 aa  180  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2280  hypothetical protein  24.59 
 
 		 1144 aa  178  5e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2187  hypothetical protein  24.08 
 
 		 1143 aa  174  6.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.671764  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1628  conserved hypothetical cytosolic protein  24.24 
 
 		 1130 aa  174  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0224  hypothetical protein  25.84 
 
 		 1133 aa  174  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00190066 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5159  hypothetical protein  24.19 
 
 		 1126 aa  171  8e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.236742  normal  0.119537 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0782  hypothetical protein  23.47 
 
 		 1121 aa  171  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3940  putative ATP-binding protein  25.18 
 
 		 1154 aa  169  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0051  conserved hypothetical cytosolic protein  24.77 
 
 		 1140 aa  163  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.609156  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1133  hypothetical protein  23.78 
 
 		 1123 aa  162  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802022 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0063  putative ATP-binding protein  22.52 
 
 		 1136 aa  162  4e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2064  hypothetical protein  23.14 
 
 		 1120 aa  160  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.203107  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0863  hypothetical protein  23.57 
 
 		 1120 aa  160  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0880  hypothetical protein  23.57 
 
 		 1120 aa  160  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1172  hypothetical protein  23.9 
 
 		 1120 aa  158  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0869  hypothetical protein  23.57 
 
 		 1118 aa  158  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1125  conserved hypothetical cytosolic protein  22.79 
 
 		 1133 aa  153  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.371233 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2031  hypothetical protein  24.77 
 
 		 1125 aa  152  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2513  hypothetical protein  23.36 
 
 		 1121 aa  149  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.844396  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2220  hypothetical protein  25.03 
 
 		 1120 aa  147  7.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0950228  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1565  hypothetical protein  23.69 
 
 		 1151 aa  134  9e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.184188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17240  hypothetical protein  22.09 
 
 		 1114 aa  132  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03620  hypothetical protein  24.92 
 
 		 1166 aa  95.5  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.688607 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0273  hypothetical protein  23.54 
 
 		 1146 aa  92  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.930301  decreased coverage  0.00283769 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0741  hypothetical protein  31.37 
 
 		 352 aa  87  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0424  hypothetical protein  22.8 
 
 		 1181 aa  75.5  0.000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.924929  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2223  hypothetical protein  22.22 
 
 		 1138 aa  52  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.651164 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3062  hypothetical protein  28.92 
 
 		 1140 aa  51.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2729  hypothetical protein  28.48 
 
 		 1141 aa  48.9  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0775  MukB N-terminal domain/M protein repeat protein  20.89 
 
 		 1113 aa  47  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0308162 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0795  hypothetical protein  26.05 
 
 		 1145 aa  44.7  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.517535 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>