86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3599 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3599  ribosomal protein L32  100 
 
 		 59 aa  120  7e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.590227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3466  50S ribosomal protein L32  51.72 
 
 		 62 aa  62  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.357647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3664  50S ribosomal protein L32  51.72 
 
 		 62 aa  62  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.416645  normal  0.271996 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3774  50S ribosomal protein L32  51.72 
 
 		 62 aa  62  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5115  50S ribosomal protein L32  51.72 
 
 		 62 aa  62  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.637 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5920  50S ribosomal protein L32  50.85 
 
 		 61 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5277  50S ribosomal protein L32  50.85 
 
 		 61 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.5638  normal  0.0541919 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1710  50S ribosomal protein L32  51.79 
 
 		 59 aa  59.7  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.142223  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1775  50S ribosomal protein L32  51.79 
 
 		 59 aa  59.7  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3825  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 61 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.828831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1128  ribosomal protein L32  50 
 
 		 59 aa  58.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.798956  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3426  50S ribosomal protein L32  51.79 
 
 		 60 aa  58.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4153  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 61 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.867327 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3119  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 61 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0820  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 62 aa  58.5  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177127 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0425  50S ribosomal protein L32  47.46 
 
 		 63 aa  57.8  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.311335 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4342  50S ribosomal protein L32  48.21 
 
 		 61 aa  57.4  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0499  50S ribosomal protein L32  48.21 
 
 		 60 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00950666 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1559  ribosomal protein L32  45.45 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3111  50S ribosomal protein L32  48.21 
 
 		 61 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0122  50S ribosomal protein L32  48.21 
 
 		 61 aa  56.6  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0625  50S ribosomal protein L32  46.55 
 
 		 61 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19517  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0497  50S ribosomal protein L32  46.55 
 
 		 61 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1411  50S ribosomal protein L32P  46.43 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.361798  hitchhiker  0.00000964737 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0311  50S ribosomal protein L32  46.43 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0514  50S ribosomal protein L32  46.43 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0527  50S ribosomal protein L32  46.43 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1873  50S ribosomal protein L32  43.1 
 
 		 60 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00104363  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4144  50S ribosomal protein L32  44.83 
 
 		 62 aa  51.2  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_002950  PG2140  50S ribosomal protein L32  42.37 
 
 		 61 aa  50.4  0.000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2467  ribosomal protein L32  39.66 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000135728  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0633  ribosomal protein L32  47.27 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2988  ribosomal protein L32  44.64 
 
 		 61 aa  48.9  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000138033  normal  0.0167419 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0206  50S ribosomal protein L32  47.37 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1369  50S ribosomal protein L32  48.28 
 
 		 60 aa  48.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00758434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3110  50S ribosomal protein L32  43.1 
 
 		 60 aa  47.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0115825  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1152  50S ribosomal protein L32  43.1 
 
 		 60 aa  47.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2134  50S ribosomal protein L32  41.38 
 
 		 60 aa  47.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000309957  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3692  ribosomal protein L32  45.45 
 
 		 64 aa  47.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7619  50S ribosomal protein L32P  47.5 
 
 		 46 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00560447  normal  0.375625 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1740  50S ribosomal protein L32  42.11 
 
 		 61 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000325807  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1387  50S ribosomal protein L32  41.82 
 
 		 60 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3554  50S ribosomal protein L32  41.38 
 
 		 59 aa  45.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.873264  normal  0.953551 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1259  50S ribosomal protein L32  41.07 
 
 		 58 aa  45.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000760142  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0013  50S ribosomal protein L32  40.74 
 
 		 60 aa  45.1  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1603  ribosomal protein L32  35.59 
 
 		 65 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0931242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1941  50S ribosomal protein L32  42.59 
 
 		 61 aa  44.3  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000297405  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0637  50S ribosomal protein L32  41.07 
 
 		 59 aa  44.3  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000000215733  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1103  ribosomal protein L32  38.98 
 
 		 63 aa  44.3  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000214959  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1181  50S ribosomal protein L32  41.82 
 
 		 60 aa  43.9  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0825  50S ribosomal protein L32  40.35 
 
 		 58 aa  43.9  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369841  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1665  50S ribosomal protein L32  38.98 
 
 		 61 aa  43.9  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0871064  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1728  50S ribosomal protein L32  41.82 
 
 		 60 aa  43.9  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3282  50S ribosomal protein L32  41.82 
 
 		 60 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2635  50S ribosomal protein L32  41.82 
 
 		 60 aa  43.9  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1364  ribosomal protein L32  42.37 
 
 		 59 aa  43.9  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000136875  normal  0.339824 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1025  50S ribosomal protein L32  40.35 
 
 		 62 aa  43.5  0.0009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103246  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5274  50S ribosomal protein L32  41.82 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1355  LSU ribosomal protein L32P  36.84 
 
 		 57 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000130715  normal  0.0921955 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl396  50S ribosomal protein L32  37.93 
 
 		 59 aa  43.1  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00156688  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3254  ribosomal protein L32  41.82 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000244715  normal  0.0606215 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2129  ribosomal protein L32  39.29 
 
 		 59 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0120071  normal  0.0237649 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0743  ribosomal protein L32  40.74 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1599  50S ribosomal protein L32  41.38 
 
 		 60 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.919739  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1137  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 56 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131577  normal  0.0222442 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2559  ribosomal protein L32  40.74 
 
 		 60 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0877  50S ribosomal protein L32  44.64 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000387423 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0600  50S ribosomal protein L32  35.71 
 
 		 64 aa  42  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113317  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1585  50S ribosomal protein L32  35.71 
 
 		 64 aa  42  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0810373  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1598  50S ribosomal protein L32P  35.09 
 
 		 56 aa  41.6  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.208872  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2078  ribosomal protein L32  37.5 
 
 		 60 aa  41.6  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0182296  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02340  50S ribosomal protein L32 (Ribosomal protein I)  41.38 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0798  50S ribosomal protein L32  39.66 
 
 		 60 aa  41.6  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174048  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0775  50S ribosomal protein L32  39.66 
 
 		 60 aa  41.6  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000368381  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1434  50S ribosomal protein L32  37.93 
 
 		 58 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000740742  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4153  ribosomal protein L32  36.84 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.365847 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1026  50S ribosomal protein L32P  37.88 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000147931  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1646  ribosomal protein L32  35.09 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0233  50S ribosomal protein L32  44.26 
 
 		 60 aa  40.8  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000487517  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10230  ribosomal protein L32  37.5 
 
 		 57 aa  40.8  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000453136  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1808  ribosomal protein L32  36.36 
 
 		 62 aa  40.4  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.253284  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2368  50S ribosomal protein L32  40.35 
 
 		 59 aa  40.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1446  50S ribosomal protein L32  39.29 
 
 		 57 aa  40.4  0.009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000360897  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0770  50S ribosomal protein L32  41.82 
 
 		 60 aa  40.4  0.01  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0231992  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1058  ribosomal protein L32  37.93 
 
 		 72 aa  40  0.01  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000694342  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2764  ribosomal protein L32  41.46 
 
 		 46 aa  40  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000122605 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>