174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0877 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0877  50S ribosomal protein L32  100 
 
 		 63 aa  132  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000387423 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1446  50S ribosomal protein L32  58.93 
 
 		 57 aa  72.4  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000360897  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1953  50S ribosomal protein L32  62.96 
 
 		 60 aa  71.6  0.000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000656252  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0770  50S ribosomal protein L32  58.33 
 
 		 60 aa  71.2  0.000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0231992  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2109  50S ribosomal protein L32  56.9 
 
 		 60 aa  69.7  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.11709  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0077  50S ribosomal protein L32  64.15 
 
 		 57 aa  69.3  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000137918  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1229  50S ribosomal protein L32  60.34 
 
 		 59 aa  68.9  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000037109  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1878  50S ribosomal protein L32  52.63 
 
 		 58 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1006  50S ribosomal protein L32  52.63 
 
 		 57 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10230  ribosomal protein L32  50.88 
 
 		 57 aa  57  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000453136  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0446  50S ribosomal protein L32  49.06 
 
 		 61 aa  56.2  0.0000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.735597  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1187  50S ribosomal protein L32  50.91 
 
 		 57 aa  55.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000373536  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1209  50S ribosomal protein L32  50.91 
 
 		 57 aa  55.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000286453  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0576  50S ribosomal protein L32  47.17 
 
 		 61 aa  54.7  0.0000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.194083  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0718  50S ribosomal protein L32  47.37 
 
 		 57 aa  54.3  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000204019  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3969  50S ribosomal protein L32  49.12 
 
 		 57 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00129021  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3774  50S ribosomal protein L32  49.12 
 
 		 57 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000267221  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3665  50S ribosomal protein L32  49.12 
 
 		 57 aa  54.3  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.37288e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3682  50S ribosomal protein L32  49.12 
 
 		 57 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000568057  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4062  50S ribosomal protein L32  49.12 
 
 		 57 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000151561  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3976  50S ribosomal protein L32  49.12 
 
 		 57 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135237  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2573  50S ribosomal protein L32  49.12 
 
 		 57 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000210481  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3750  50S ribosomal protein L32  49.12 
 
 		 57 aa  54.3  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000162679  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4024  50S ribosomal protein L32  49.12 
 
 		 57 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000551113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3938  50S ribosomal protein L32  49.12 
 
 		 57 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1217  50S ribosomal protein L32  49.12 
 
 		 57 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000020176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2628  ribosomal protein L32  44.64 
 
 		 56 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000100434  hitchhiker  0.00000142207 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1495  50S ribosomal protein L32  44.64 
 
 		 56 aa  52.8  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237731  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1603  ribosomal protein L32  39.68 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0931242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2297  50S ribosomal protein L32  44.64 
 
 		 56 aa  52.8  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000139706  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1728  50S ribosomal protein L32  47.17 
 
 		 60 aa  52  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2780  50S ribosomal protein L32  42.86 
 
 		 56 aa  51.2  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1755  50S ribosomal protein L32  42.86 
 
 		 56 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000534053  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2400  50S ribosomal protein L32  42.86 
 
 		 56 aa  51.2  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000318296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2470  50S ribosomal protein L32  42.86 
 
 		 56 aa  51.2  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000146933  hitchhiker  0.00550798 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2562  50S ribosomal protein L32  42.86 
 
 		 56 aa  51.2  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000144666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1870  ribosomal protein L32  47.17 
 
 		 59 aa  51.2  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.819487  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2652  50S ribosomal protein L32  42.86 
 
 		 56 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000778579  hitchhiker  0.0000333205 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1715  50S ribosomal protein L32  42.86 
 
 		 56 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000625062  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1578  50S ribosomal protein L32  42.86 
 
 		 56 aa  51.2  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000427195  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1712  50S ribosomal protein L32  42.86 
 
 		 56 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329996  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1387  50S ribosomal protein L32  47.17 
 
 		 60 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0403  50S ribosomal protein L32  45.61 
 
 		 59 aa  50.8  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1984  50S ribosomal protein L32  42.86 
 
 		 56 aa  50.8  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000709039  decreased coverage  0.000595562 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1181  50S ribosomal protein L32  47.17 
 
 		 60 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3254  ribosomal protein L32  47.17 
 
 		 60 aa  50.8  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000244715  normal  0.0606215 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25630  50S ribosomal protein L32  40 
 
 		 60 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000532355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2191  50S ribosomal protein L32  40 
 
 		 60 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1553  50S ribosomal protein L32  46.3 
 
 		 59 aa  49.7  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198496  normal  0.0691397 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1626  50S ribosomal protein L32  41.82 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.904867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2635  50S ribosomal protein L32  45.28 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2430  ribosomal protein L32  48.15 
 
 		 59 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0972633  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3282  50S ribosomal protein L32  45.28 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1911  50S ribosomal protein L32  43.64 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.361385  unclonable  0.000000174861 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14890  50S ribosomal protein L32  40 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02912  50S ribosomal protein L32  41.07 
 
 		 56 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1913  50S ribosomal protein L32P  42.37 
 
 		 62 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1808  ribosomal protein L32  42.86 
 
 		 62 aa  48.9  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.253284  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1487  50S ribosomal protein L32  43.64 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3652  50S ribosomal protein L32  45.28 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002992  LSU ribosomal protein L32p  41.07 
 
 		 56 aa  49.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000126442  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2237  50S ribosomal protein L32  44.64 
 
 		 56 aa  49.3  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0287764  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1369  50S ribosomal protein L32  46.3 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00758434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3078  50S ribosomal protein L32  45.28 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0613  50S ribosomal protein L32  47.17 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000739879 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2498  50S ribosomal protein L32  42.86 
 
 		 56 aa  48.9  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000463288  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3803  50S ribosomal protein L32  43.64 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2013  50S ribosomal protein L32  45.28 
 
 		 59 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1522  50S ribosomal protein L32  43.64 
 
 		 60 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.484698 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0396  50S ribosomal protein L32  46.3 
 
 		 59 aa  48.9  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2129  ribosomal protein L32  45.28 
 
 		 59 aa  48.5  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0120071  normal  0.0237649 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1025  50S ribosomal protein L32  45 
 
 		 62 aa  48.1  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103246  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2005  50S ribosomal protein L32  43.4 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2038  ribosomal protein L32  42.86 
 
 		 56 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000023625  normal  0.0132901 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5274  50S ribosomal protein L32  45.28 
 
 		 60 aa  47.8  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3835  ribosomal protein L32  41.82 
 
 		 60 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.460634  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1644  50S ribosomal protein L32  41.82 
 
 		 60 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119469  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1599  50S ribosomal protein L32  41.07 
 
 		 56 aa  47  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000342659  hitchhiker  0.00352794 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4160  50S ribosomal protein L32  41.82 
 
 		 60 aa  47  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0633  ribosomal protein L32  47.17 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1411  50S ribosomal protein L32P  46.3 
 
 		 60 aa  46.2  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.361798  hitchhiker  0.00000964737 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0634  50S ribosomal protein L32  45.28 
 
 		 60 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.307696  normal  0.0979505 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1611  50S ribosomal protein L32  37.5 
 
 		 56 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000123515  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1941  50S ribosomal protein L32  41.67 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000297405  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0600  50S ribosomal protein L32  41.51 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113317  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1048  50S ribosomal protein L32  44.44 
 
 		 59 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1585  50S ribosomal protein L32  41.51 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0810373  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1574  50S ribosomal protein L32  41.51 
 
 		 55 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000166965  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1509  50S ribosomal protein L32  43.4 
 
 		 59 aa  45.4  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0171128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1682  50S ribosomal protein L32  41.51 
 
 		 55 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000176962  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3503  50S ribosomal protein L32  41.51 
 
 		 55 aa  45.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000266571  hitchhiker  0.00520609 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1625  50S ribosomal protein L32  40 
 
 		 60 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.701038 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1873  50S ribosomal protein L32  46.3 
 
 		 60 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00104363  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1579  50S ribosomal protein L32  43.64 
 
 		 61 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.146664  normal  0.0105145 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1583  50S ribosomal protein L32  43.4 
 
 		 56 aa  45.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000129748  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0913  50S ribosomal protein L32  44.44 
 
 		 59 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0957314 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1619  50S ribosomal protein L32  42.59 
 
 		 56 aa  45.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000529201  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1904  50S ribosomal protein L32  43.64 
 
 		 61 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0519443  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2126  ribosomal protein L32  39.62 
 
 		 56 aa  45.1  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.625409  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2267  50S ribosomal protein L32  43.4 
 
 		 59 aa  44.3  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>