63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0206 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0206  50S ribosomal protein L32  100 
 
 		 64 aa  133  7.000000000000001e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02340  50S ribosomal protein L32 (Ribosomal protein I)  75 
 
 		 65 aa  104  5e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0647  50S ribosomal protein L32  73.77 
 
 		 64 aa  98.6  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.24173  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0711  50S ribosomal protein L32  67.24 
 
 		 62 aa  84.3  5e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.282817 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4153  ribosomal protein L32  61.02 
 
 		 64 aa  75.9  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.365847 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3815  ribosomal protein L32  52.46 
 
 		 63 aa  67.4  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5250  ribosomal protein L32  54.24 
 
 		 64 aa  67  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00622213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6298  ribosomal protein L32  51.56 
 
 		 64 aa  67  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.507877 
 
 
-
 
NC_002950  PG2140  50S ribosomal protein L32  56.9 
 
 		 61 aa  65.9  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0718  50S ribosomal protein L32  46.55 
 
 		 57 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000204019  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3599  ribosomal protein L32  47.37 
 
 		 59 aa  48.1  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.590227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1209  50S ribosomal protein L32  48.15 
 
 		 57 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000286453  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1187  50S ribosomal protein L32  48.15 
 
 		 57 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000373536  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1369  50S ribosomal protein L32  43.55 
 
 		 60 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00758434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1434  50S ribosomal protein L32  40.68 
 
 		 58 aa  45.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000740742  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0446  50S ribosomal protein L32  48.39 
 
 		 61 aa  46.2  0.0002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.735597  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1625a  50S ribosomal protein L32  44.83 
 
 		 61 aa  46.2  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100343  normal  0.018062 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1387  50S ribosomal protein L32  38.1 
 
 		 60 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0576  50S ribosomal protein L32  47.54 
 
 		 61 aa  44.7  0.0004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.194083  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1808  ribosomal protein L32  40.35 
 
 		 62 aa  44.7  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.253284  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2628  ribosomal protein L32  39.66 
 
 		 56 aa  45.1  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000100434  hitchhiker  0.00000142207 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2109  50S ribosomal protein L32  40.98 
 
 		 60 aa  44.3  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.11709  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002992  LSU ribosomal protein L32p  39.66 
 
 		 56 aa  44.3  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000126442  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02912  50S ribosomal protein L32  39.66 
 
 		 56 aa  44.3  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0600  50S ribosomal protein L32  42.62 
 
 		 64 aa  43.9  0.0008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113317  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1585  50S ribosomal protein L32  42.62 
 
 		 64 aa  43.9  0.0008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0810373  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1181  50S ribosomal protein L32  36.51 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1006  50S ribosomal protein L32  43.1 
 
 		 57 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3665  50S ribosomal protein L32  41.38 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.37288e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3774  50S ribosomal protein L32  41.38 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000267221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3682  50S ribosomal protein L32  41.38 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000568057  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0201  50S ribosomal protein L32  43.33 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0591945  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3976  50S ribosomal protein L32  41.38 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135237  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4024  50S ribosomal protein L32  41.38 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000551113  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1217  50S ribosomal protein L32  41.38 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000020176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3938  50S ribosomal protein L32  41.38 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2635  50S ribosomal protein L32  34.92 
 
 		 60 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3750  50S ribosomal protein L32  41.38 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000162679  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4062  50S ribosomal protein L32  41.38 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000151561  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2573  50S ribosomal protein L32  41.38 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000210481  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3969  50S ribosomal protein L32  41.38 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00129021  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1611  50S ribosomal protein L32  37.93 
 
 		 56 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000123515  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3282  50S ribosomal protein L32  34.92 
 
 		 60 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5274  50S ribosomal protein L32  39.34 
 
 		 60 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0868  50S ribosomal protein L32  38.1 
 
 		 64 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02705  50S ribosomal protein L32  37.29 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0179  50S ribosomal protein L32  45.9 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.208303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1355  LSU ribosomal protein L32P  37.93 
 
 		 57 aa  41.2  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000130715  normal  0.0921955 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1599  50S ribosomal protein L32  36.21 
 
 		 56 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000342659  hitchhiker  0.00352794 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2488  50S ribosomal protein L32  40 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1728  50S ribosomal protein L32  36.51 
 
 		 60 aa  41.2  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2237  50S ribosomal protein L32  36.21 
 
 		 56 aa  40.8  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0287764  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1941  50S ribosomal protein L32  31.75 
 
 		 61 aa  40.8  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000297405  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1597  50S ribosomal protein L32  36.07 
 
 		 60 aa  40.8  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000469826  normal  0.427035 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1599  50S ribosomal protein L32  36.07 
 
 		 60 aa  40.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.919739  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2498  50S ribosomal protein L32  34.48 
 
 		 56 aa  40.4  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000463288  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1984  50S ribosomal protein L32  36.21 
 
 		 56 aa  40.4  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000709039  decreased coverage  0.000595562 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1953  50S ribosomal protein L32  38.98 
 
 		 60 aa  40.4  0.009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000656252  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0135  50S ribosomal protein L32  40 
 
 		 63 aa  40.4  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000114527  normal  0.772153 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0171  50S ribosomal protein L32  40 
 
 		 63 aa  40  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1113  50S ribosomal protein L32  36.84 
 
 		 64 aa  40  0.01  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1207  50S ribosomal protein L32  36.84 
 
 		 64 aa  40  0.01  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1878  50S ribosomal protein L32  43.1 
 
 		 58 aa  40  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>