170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1953 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1953  50S ribosomal protein L32  100 
 
 		 60 aa  122  2e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000656252  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2109  50S ribosomal protein L32  91.67 
 
 		 60 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.11709  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0077  50S ribosomal protein L32  86.79 
 
 		 57 aa  98.6  3e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000137918  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0877  50S ribosomal protein L32  62.96 
 
 		 63 aa  71.6  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000387423 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0446  50S ribosomal protein L32  42.37 
 
 		 61 aa  58.9  0.00000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.735597  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0576  50S ribosomal protein L32  38.98 
 
 		 61 aa  57.4  0.00000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.194083  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0633  ribosomal protein L32  47.17 
 
 		 63 aa  56.6  0.0000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0770  50S ribosomal protein L32  46.43 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0231992  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1187  50S ribosomal protein L32  49.09 
 
 		 57 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000373536  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1209  50S ribosomal protein L32  49.09 
 
 		 57 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000286453  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1446  50S ribosomal protein L32  45.28 
 
 		 57 aa  55.1  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000360897  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0718  50S ribosomal protein L32  47.27 
 
 		 57 aa  54.3  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000204019  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10230  ribosomal protein L32  50.91 
 
 		 57 aa  54.3  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000453136  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0633  ribosomal protein L32  48.39 
 
 		 63 aa  53.5  0.0000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1808  ribosomal protein L32  42.62 
 
 		 62 aa  51.2  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.253284  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2129  ribosomal protein L32  39.62 
 
 		 59 aa  51.2  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0120071  normal  0.0237649 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl396  50S ribosomal protein L32  46.3 
 
 		 59 aa  50.8  0.000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00156688  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2988  ribosomal protein L32  43.1 
 
 		 61 aa  50.4  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000138033  normal  0.0167419 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2467  ribosomal protein L32  44.64 
 
 		 61 aa  50.4  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000135728  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1878  50S ribosomal protein L32  45.45 
 
 		 58 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3664  50S ribosomal protein L32  42.62 
 
 		 62 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.416645  normal  0.271996 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3774  50S ribosomal protein L32  42.62 
 
 		 62 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1229  50S ribosomal protein L32  45.45 
 
 		 59 aa  49.3  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000037109  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5115  50S ribosomal protein L32  42.62 
 
 		 62 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.637 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0743  ribosomal protein L32  43.33 
 
 		 63 aa  48.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3466  50S ribosomal protein L32  42.62 
 
 		 62 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.357647  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3969  50S ribosomal protein L32  46.3 
 
 		 57 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00129021  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3774  50S ribosomal protein L32  46.3 
 
 		 57 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000267221  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3665  50S ribosomal protein L32  46.3 
 
 		 57 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.37288e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3682  50S ribosomal protein L32  46.3 
 
 		 57 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000568057  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4062  50S ribosomal protein L32  46.3 
 
 		 57 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000151561  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1217  50S ribosomal protein L32  46.3 
 
 		 57 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000020176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3976  50S ribosomal protein L32  46.3 
 
 		 57 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135237  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1006  50S ribosomal protein L32  45.45 
 
 		 57 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4024  50S ribosomal protein L32  46.3 
 
 		 57 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000551113  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3750  50S ribosomal protein L32  46.3 
 
 		 57 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000162679  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3938  50S ribosomal protein L32  46.3 
 
 		 57 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2573  50S ribosomal protein L32  46.3 
 
 		 57 aa  48.5  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000210481  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1873  50S ribosomal protein L32  47.37 
 
 		 60 aa  47.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00104363  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3554  50S ribosomal protein L32  42.59 
 
 		 59 aa  47.4  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.873264  normal  0.953551 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02335  50S ribosomal protein L32  39.29 
 
 		 56 aa  47.4  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000084206  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0987  50S ribosomal protein L32  36.67 
 
 		 60 aa  47  0.00008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0708  50S ribosomal protein L32  38.18 
 
 		 57 aa  46.2  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0117733  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1626  50S ribosomal protein L32  36.67 
 
 		 60 aa  47  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.904867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1411  50S ribosomal protein L32P  44.44 
 
 		 60 aa  46.6  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.361798  hitchhiker  0.00000964737 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1870  ribosomal protein L32  37.5 
 
 		 59 aa  46.2  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.819487  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1237  50S ribosomal protein L32  35.71 
 
 		 59 aa  46.6  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.409262  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1128  ribosomal protein L32  42.11 
 
 		 59 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.798956  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3652  50S ribosomal protein L32  37.93 
 
 		 60 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1598  50S ribosomal protein L32P  38.89 
 
 		 56 aa  45.4  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.208872  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0403  50S ribosomal protein L32  41.82 
 
 		 59 aa  45.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3426  50S ribosomal protein L32  41.67 
 
 		 60 aa  46.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1425  50S ribosomal protein L32  37.5 
 
 		 59 aa  46.2  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.249628  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1603  ribosomal protein L32  36.36 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0931242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3825  50S ribosomal protein L32  42.59 
 
 		 61 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.828831  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4153  50S ribosomal protein L32  42.59 
 
 		 61 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.867327 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2635  50S ribosomal protein L32  36.21 
 
 		 60 aa  45.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0820  50S ribosomal protein L32  42.62 
 
 		 62 aa  45.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177127 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1553  50S ribosomal protein L32  39.29 
 
 		 59 aa  45.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198496  normal  0.0691397 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0497  50S ribosomal protein L32  40.68 
 
 		 61 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0625  50S ribosomal protein L32  40.68 
 
 		 61 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19517  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3282  50S ribosomal protein L32  36.21 
 
 		 60 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1941  50S ribosomal protein L32  44.83 
 
 		 61 aa  45.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000297405  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4342  50S ribosomal protein L32  42.59 
 
 		 61 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1913  50S ribosomal protein L32P  37.5 
 
 		 62 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2507  50S ribosomal protein L32  39.62 
 
 		 56 aa  45.1  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000163859  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5920  50S ribosomal protein L32  40.35 
 
 		 61 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5277  50S ribosomal protein L32  40.35 
 
 		 61 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.5638  normal  0.0541919 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1181  50S ribosomal protein L32  36.21 
 
 		 60 aa  45.1  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1599  50S ribosomal protein L32  37.74 
 
 		 56 aa  45.1  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000342659  hitchhiker  0.00352794 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0396  50S ribosomal protein L32  41.82 
 
 		 59 aa  44.7  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3119  50S ribosomal protein L32  42.59 
 
 		 61 aa  45.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2812  50S ribosomal protein L32  39.62 
 
 		 56 aa  45.1  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000738596  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2628  ribosomal protein L32  35.85 
 
 		 56 aa  44.7  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000100434  hitchhiker  0.00000142207 
 
 
-
 
NC_004310  BR1775  50S ribosomal protein L32  40.74 
 
 		 59 aa  44.3  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0386  50S ribosomal protein L32  42.59 
 
 		 59 aa  44.3  0.0006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0173336  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3078  50S ribosomal protein L32  36.36 
 
 		 60 aa  44.3  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0425  50S ribosomal protein L32  44.44 
 
 		 63 aa  44.3  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.311335 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1710  50S ribosomal protein L32  40.74 
 
 		 59 aa  44.3  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.142223  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02340  50S ribosomal protein L32 (Ribosomal protein I)  42.86 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1611  50S ribosomal protein L32  35.85 
 
 		 56 aa  43.9  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000123515  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2430  ribosomal protein L32  39.29 
 
 		 59 aa  43.9  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0972633  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2498  50S ribosomal protein L32  35.85 
 
 		 56 aa  43.9  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000463288  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0978  50S ribosomal protein L32  41.82 
 
 		 59 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0979958 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3692  ribosomal protein L32  39.34 
 
 		 64 aa  43.9  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3815  ribosomal protein L32  42.62 
 
 		 63 aa  43.9  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0122  50S ribosomal protein L32  42.59 
 
 		 61 aa  43.9  0.0009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1619  50S ribosomal protein L32  38.89 
 
 		 56 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000529201  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0514  50S ribosomal protein L32  40 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1728  50S ribosomal protein L32  34.48 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0499  50S ribosomal protein L32  41.07 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00950666 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1509  50S ribosomal protein L32  39.29 
 
 		 59 aa  43.5  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0171128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0311  50S ribosomal protein L32  40 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1387  50S ribosomal protein L32  34.48 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14890  50S ribosomal protein L32  35 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0634  50S ribosomal protein L32  36.36 
 
 		 60 aa  42.7  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.307696  normal  0.0979505 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1583  50S ribosomal protein L32  39.62 
 
 		 56 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000129748  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3111  50S ribosomal protein L32  41.07 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3835  ribosomal protein L32  35 
 
 		 60 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.460634  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1984  50S ribosomal protein L32  35.85 
 
 		 56 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000709039  decreased coverage  0.000595562 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>