26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5250 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5250  ribosomal protein L32  100 
 
 		 64 aa  134  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00622213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4153  ribosomal protein L32  64.06 
 
 		 64 aa  87.4  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.365847 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02340  50S ribosomal protein L32 (Ribosomal protein I)  61.02 
 
 		 65 aa  75.1  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6298  ribosomal protein L32  55.56 
 
 		 64 aa  73.6  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.507877 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3815  ribosomal protein L32  55.93 
 
 		 63 aa  73.2  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0647  50S ribosomal protein L32  55.93 
 
 		 64 aa  71.2  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.24173  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0206  50S ribosomal protein L32  54.24 
 
 		 64 aa  67  0.00000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0711  50S ribosomal protein L32  52.46 
 
 		 62 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.282817 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1870  ribosomal protein L32  43.1 
 
 		 59 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.819487  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1603  ribosomal protein L32  42.37 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0931242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0868  50S ribosomal protein L32  42.37 
 
 		 64 aa  43.9  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1085  ribosomal protein L32  42.37 
 
 		 57 aa  43.5  0.0009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.444858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02912  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 56 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0708  50S ribosomal protein L32  37.29 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0117733  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002992  LSU ribosomal protein L32p  43.86 
 
 		 56 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000126442  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2140  50S ribosomal protein L32  44.07 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1625a  50S ribosomal protein L32  82.61 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100343  normal  0.018062 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1808  ribosomal protein L32  39.34 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.253284  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1611  50S ribosomal protein L32  42.11 
 
 		 56 aa  42  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000123515  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2129  ribosomal protein L32  40.35 
 
 		 59 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0120071  normal  0.0237649 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2498  50S ribosomal protein L32  36.84 
 
 		 56 aa  40.8  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000463288  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0657  ribosomal protein L32  36.21 
 
 		 68 aa  40.8  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14890  50S ribosomal protein L32  39.66 
 
 		 60 aa  40.4  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02335  50S ribosomal protein L32  36.84 
 
 		 56 aa  40.4  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000084206  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02705  50S ribosomal protein L32  39.62 
 
 		 62 aa  40.4  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1626  50S ribosomal protein L32  39.66 
 
 		 60 aa  40  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.904867  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>