15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6298 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6298  ribosomal protein L32  100 
 
 		 64 aa  133  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.507877 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0711  50S ribosomal protein L32  58.06 
 
 		 62 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.282817 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02340  50S ribosomal protein L32 (Ribosomal protein I)  56.25 
 
 		 65 aa  75.1  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5250  ribosomal protein L32  55.56 
 
 		 64 aa  73.6  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00622213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0647  50S ribosomal protein L32  52.38 
 
 		 64 aa  70.5  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.24173  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0206  50S ribosomal protein L32  51.56 
 
 		 64 aa  67  0.00000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3815  ribosomal protein L32  52.46 
 
 		 63 aa  66.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4153  ribosomal protein L32  50.79 
 
 		 64 aa  61.2  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.365847 
 
 
-
 
NC_002950  PG2140  50S ribosomal protein L32  42.86 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4144  50S ribosomal protein L32  40.62 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02705  50S ribosomal protein L32  43.1 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0868  50S ribosomal protein L32  41.94 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1611  50S ribosomal protein L32  40.68 
 
 		 56 aa  41.2  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000123515  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1207  50S ribosomal protein L32  39.68 
 
 		 64 aa  40  0.01  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1113  50S ribosomal protein L32  39.68 
 
 		 64 aa  40  0.01  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>