84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3815 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3815  ribosomal protein L32  100 
 
 		 63 aa  132  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170365  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02340  50S ribosomal protein L32 (Ribosomal protein I)  62.3 
 
 		 65 aa  83.6  8e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0711  50S ribosomal protein L32  57.38 
 
 		 62 aa  80.9  0.000000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.282817 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0647  50S ribosomal protein L32  59.02 
 
 		 64 aa  80.1  0.000000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.24173  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5250  ribosomal protein L32  55.93 
 
 		 64 aa  73.2  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00622213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0206  50S ribosomal protein L32  52.46 
 
 		 64 aa  67.4  0.00000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6298  ribosomal protein L32  52.46 
 
 		 64 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.507877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4153  ribosomal protein L32  54.24 
 
 		 64 aa  63.5  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.365847 
 
 
-
 
NC_002950  PG2140  50S ribosomal protein L32  56.67 
 
 		 61 aa  58.9  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1625a  50S ribosomal protein L32  52.54 
 
 		 61 aa  57  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100343  normal  0.018062 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1369  50S ribosomal protein L32  44.83 
 
 		 60 aa  51.6  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00758434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2134  50S ribosomal protein L32  41.38 
 
 		 60 aa  51.2  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000309957  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1340  ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 58 aa  50.8  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.5028  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1329  ribosomal protein L32  46.3 
 
 		 61 aa  50.4  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000150645  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2559  ribosomal protein L32  48.21 
 
 		 60 aa  50.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0718  50S ribosomal protein L32  42.11 
 
 		 57 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000204019  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10230  ribosomal protein L32  42.11 
 
 		 57 aa  48.5  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000453136  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1187  50S ribosomal protein L32  42.86 
 
 		 57 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000373536  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1209  50S ribosomal protein L32  42.86 
 
 		 57 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000286453  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0987  50S ribosomal protein L32  47.37 
 
 		 60 aa  47.8  0.00006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1434  50S ribosomal protein L32  43.1 
 
 		 58 aa  47.8  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000740742  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0184  50S ribosomal protein L32  46.03 
 
 		 63 aa  47.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00725165  normal  0.800579 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1597  50S ribosomal protein L32  41.94 
 
 		 60 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000469826  normal  0.427035 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1873  50S ribosomal protein L32  43.1 
 
 		 60 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00104363  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3554  50S ribosomal protein L32  40.35 
 
 		 59 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.873264  normal  0.953551 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2488  50S ribosomal protein L32  43.08 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0171  50S ribosomal protein L32  41.27 
 
 		 63 aa  45.4  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1941  50S ribosomal protein L32  46.43 
 
 		 61 aa  45.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000297405  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2109  50S ribosomal protein L32  44.83 
 
 		 60 aa  45.4  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.11709  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1667  50S ribosomal protein L32  43.1 
 
 		 64 aa  45.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.294477  normal  0.0177766 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0952  ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 60 aa  45.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000023662  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1217  50S ribosomal protein L32  38.98 
 
 		 57 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000020176  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3682  50S ribosomal protein L32  38.98 
 
 		 57 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000568057  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl396  50S ribosomal protein L32  42.86 
 
 		 59 aa  45.1  0.0004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00156688  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0825  50S ribosomal protein L32  43.1 
 
 		 58 aa  44.7  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369841  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0135  50S ribosomal protein L32  41.27 
 
 		 63 aa  44.7  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000114527  normal  0.772153 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4062  50S ribosomal protein L32  38.98 
 
 		 57 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000151561  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3750  50S ribosomal protein L32  38.98 
 
 		 57 aa  45.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000162679  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3976  50S ribosomal protein L32  38.98 
 
 		 57 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135237  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4024  50S ribosomal protein L32  38.98 
 
 		 57 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000551113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3938  50S ribosomal protein L32  38.98 
 
 		 57 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2573  50S ribosomal protein L32  38.98 
 
 		 57 aa  45.1  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000210481  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2613  ribosomal protein L32  43.33 
 
 		 74 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.737881 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3665  50S ribosomal protein L32  38.98 
 
 		 57 aa  45.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.37288e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3774  50S ribosomal protein L32  38.98 
 
 		 57 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000267221  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3969  50S ribosomal protein L32  38.98 
 
 		 57 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00129021  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1006  50S ribosomal protein L32  36.84 
 
 		 57 aa  44.3  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0201  50S ribosomal protein L32  44.07 
 
 		 63 aa  44.3  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0591945  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2368  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 59 aa  44.3  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1599  50S ribosomal protein L32  38.71 
 
 		 60 aa  43.9  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.919739  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1953  50S ribosomal protein L32  42.62 
 
 		 60 aa  43.9  0.0008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000656252  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1175  50S ribosomal protein L32  39.66 
 
 		 57 aa  43.9  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000516362 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2129  ribosomal protein L32  40.35 
 
 		 59 aa  43.5  0.0009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0120071  normal  0.0237649 
 
 
-
 
NC_002936  DET1275  50S ribosomal protein L32  34.92 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00245853  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1878  50S ribosomal protein L32  36.84 
 
 		 58 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1804  ribosomal protein L32  40 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0667  50S ribosomal protein L32  44.64 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.728717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0179  50S ribosomal protein L32  41.54 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.208303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1086  50S ribosomal protein L32  36.51 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1285  50S ribosomal protein L32  39.66 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.761755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1355  LSU ribosomal protein L32P  37.93 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000130715  normal  0.0921955 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0386  50S ribosomal protein L32  42.86 
 
 		 59 aa  42  0.003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0173336  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1103  ribosomal protein L32  43.33 
 
 		 63 aa  42  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000214959  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1665  50S ribosomal protein L32  38.6 
 
 		 61 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0871064  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1259  50S ribosomal protein L32  38.6 
 
 		 58 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000760142  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0446  50S ribosomal protein L32  42.62 
 
 		 61 aa  42  0.003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.735597  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1420  50S ribosomal protein L32  38.6 
 
 		 59 aa  42  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.640468  normal  0.982205 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0227  ribosomal protein L32  46.81 
 
 		 50 aa  41.2  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0576  50S ribosomal protein L32  39.68 
 
 		 61 aa  41.2  0.005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.194083  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0013  50S ribosomal protein L32  40.74 
 
 		 60 aa  41.2  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3434  ribosomal protein L32  43.33 
 
 		 58 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.976937  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1628  50S ribosomal protein L32  52.38 
 
 		 48 aa  40.8  0.006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.901218  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1152  50S ribosomal protein L32  37.93 
 
 		 60 aa  40.4  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0375  50S ribosomal protein L32  52.38 
 
 		 48 aa  40.4  0.007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1058  ribosomal protein L32  34.92 
 
 		 72 aa  40.4  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000694342  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0352  50S ribosomal protein L32  52.38 
 
 		 48 aa  40.4  0.007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3110  50S ribosomal protein L32  37.93 
 
 		 60 aa  40.4  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0115825  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf408  ribosomal protein L32  40 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14890  50S ribosomal protein L32  37.7 
 
 		 60 aa  40.4  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2628  ribosomal protein L32  38.6 
 
 		 56 aa  40.4  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000100434  hitchhiker  0.00000142207 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0637  50S ribosomal protein L32  42.11 
 
 		 59 aa  40.4  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000000215733  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2988  ribosomal protein L32  38.6 
 
 		 61 aa  40.4  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000138033  normal  0.0167419 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1490  50S ribosomal protein L32  51.22 
 
 		 48 aa  40  0.01  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.334451  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0868  50S ribosomal protein L32  38.98 
 
 		 64 aa  40  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>