202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0987 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD0987  50S ribosomal protein L32  100 
 
 
60 aa  125  1.0000000000000001e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0633  ribosomal protein L32  55.56 
 
 
63 aa  64.7  0.0000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0446  50S ribosomal protein L32  57.41 
 
 
61 aa  63.2  0.000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.735597  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0576  50S ribosomal protein L32  55.56 
 
 
61 aa  62.4  0.000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.194083  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2297  50S ribosomal protein L32  50 
 
 
56 aa  58.9  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000139706  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1984  50S ribosomal protein L32  50 
 
 
56 aa  59.3  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000709039  decreased coverage  0.000595562 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1495  50S ribosomal protein L32  48.21 
 
 
56 aa  57.4  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237731  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2628  ribosomal protein L32  50 
 
 
56 aa  57.8  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000100434  hitchhiker  0.00000142207 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1712  50S ribosomal protein L32  48.21 
 
 
56 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329996  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2652  50S ribosomal protein L32  48.21 
 
 
56 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000778579  hitchhiker  0.0000333205 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1715  50S ribosomal protein L32  48.21 
 
 
56 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000625062  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1755  50S ribosomal protein L32  48.21 
 
 
56 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000534053  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1578  50S ribosomal protein L32  48.21 
 
 
56 aa  57  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000427195  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2780  50S ribosomal protein L32  48.21 
 
 
56 aa  56.6  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1665  50S ribosomal protein L32  48.33 
 
 
61 aa  56.2  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0871064  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2400  50S ribosomal protein L32  48.21 
 
 
56 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000318296  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2470  50S ribosomal protein L32  48.21 
 
 
56 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000146933  hitchhiker  0.00550798 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2562  50S ribosomal protein L32  48.21 
 
 
56 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000144666  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1626  50S ribosomal protein L32  52.83 
 
 
60 aa  55.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.904867  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3078  50S ribosomal protein L32  48.33 
 
 
60 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1599  50S ribosomal protein L32  46.43 
 
 
56 aa  55.5  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000342659  hitchhiker  0.00352794 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3835  ribosomal protein L32  46.67 
 
 
60 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.460634  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1644  50S ribosomal protein L32  46.67 
 
 
60 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119469  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0708  50S ribosomal protein L32  50 
 
 
57 aa  54.7  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0117733  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2498  50S ribosomal protein L32  46.43 
 
 
56 aa  54.7  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000463288  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1611  50S ribosomal protein L32  46.43 
 
 
56 aa  54.7  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000123515  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4160  50S ribosomal protein L32  46.67 
 
 
60 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340521  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14890  50S ribosomal protein L32  46.67 
 
 
60 aa  54.3  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3554  50S ribosomal protein L32  50 
 
 
59 aa  53.9  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.873264  normal  0.953551 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2126  ribosomal protein L32  48.15 
 
 
56 aa  53.9  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.625409  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25630  50S ribosomal protein L32  46.67 
 
 
60 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000532355  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2191  50S ribosomal protein L32  46.67 
 
 
60 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002992  LSU ribosomal protein L32p  44.64 
 
 
56 aa  53.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000126442  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2237  50S ribosomal protein L32  50 
 
 
56 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0287764  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3652  50S ribosomal protein L32  48.15 
 
 
60 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02912  50S ribosomal protein L32  44.64 
 
 
56 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1625  50S ribosomal protein L32  45 
 
 
60 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.701038 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0634  50S ribosomal protein L32  44.44 
 
 
60 aa  52  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.307696  normal  0.0979505 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5274  50S ribosomal protein L32  46.3 
 
 
60 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3110  50S ribosomal protein L32  47.27 
 
 
60 aa  52  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0115825  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1152  50S ribosomal protein L32  47.27 
 
 
60 aa  52  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1728  50S ribosomal protein L32  46.3 
 
 
60 aa  52  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02335  50S ribosomal protein L32  46.3 
 
 
56 aa  51.6  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000084206  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1181  50S ribosomal protein L32  46.3 
 
 
60 aa  52  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2038  ribosomal protein L32  44.64 
 
 
56 aa  51.6  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000023625  normal  0.0132901 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1522  50S ribosomal protein L32  45 
 
 
60 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.484698 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1740  50S ribosomal protein L32  49.09 
 
 
61 aa  51.6  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000325807  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1911  50S ribosomal protein L32  45 
 
 
60 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.361385  unclonable  0.000000174861 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3803  50S ribosomal protein L32  45 
 
 
60 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1487  50S ribosomal protein L32  45 
 
 
60 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1387  50S ribosomal protein L32  46.3 
 
 
60 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0613  50S ribosomal protein L32  44.44 
 
 
60 aa  50.8  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000739879 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3254  ribosomal protein L32  44.44 
 
 
60 aa  50.8  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000244715  normal  0.0606215 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2005  50S ribosomal protein L32  40 
 
 
64 aa  50.8  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3282  50S ribosomal protein L32  44.44 
 
 
60 aa  50.4  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2635  50S ribosomal protein L32  44.44 
 
 
60 aa  50.4  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2467  ribosomal protein L32  47.27 
 
 
61 aa  50.1  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000135728  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0868  50S ribosomal protein L32  44.44 
 
 
64 aa  50.4  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1048  50S ribosomal protein L32  47.17 
 
 
59 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2812  50S ribosomal protein L32  42.86 
 
 
56 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000738596  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1597  50S ribosomal protein L32  44.07 
 
 
60 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000469826  normal  0.427035 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2507  50S ribosomal protein L32  42.86 
 
 
56 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000163859  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0271  50S ribosomal protein L32  49.09 
 
 
67 aa  50.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.750719  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl396  50S ribosomal protein L32  50 
 
 
59 aa  48.9  0.00002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00156688  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1434  50S ribosomal protein L32  48.15 
 
 
58 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000740742  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1808  ribosomal protein L32  42.11 
 
 
62 aa  49.3  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.253284  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0913  50S ribosomal protein L32  47.17 
 
 
59 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0957314 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0978  50S ribosomal protein L32  47.17 
 
 
59 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0979958 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1603  ribosomal protein L32  41.67 
 
 
65 aa  49.7  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0931242  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1873  50S ribosomal protein L32  45.45 
 
 
60 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00104363  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0600  50S ribosomal protein L32  38.98 
 
 
64 aa  48.5  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113317  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1585  50S ribosomal protein L32  38.98 
 
 
64 aa  48.5  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0810373  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1583  50S ribosomal protein L32  42.86 
 
 
56 aa  48.5  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000129748  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2914  50S ribosomal protein L32  47.17 
 
 
59 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161302  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0999  50S ribosomal protein L32  47.17 
 
 
59 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.852349  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0528  50S ribosomal protein L32  45.28 
 
 
59 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2013  50S ribosomal protein L32  47.17 
 
 
59 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2267  50S ribosomal protein L32  46.3 
 
 
59 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2909  50S ribosomal protein L32  45.28 
 
 
59 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.180854  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4231  50S ribosomal protein L32  47.17 
 
 
59 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0358913  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1682  50S ribosomal protein L32  40.74 
 
 
55 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000176962  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0403  50S ribosomal protein L32  43.4 
 
 
59 aa  48.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1070  50S ribosomal protein L32  47.17 
 
 
59 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793355  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2432  50S ribosomal protein L32  46.3 
 
 
59 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.716206  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0826  ribosomal protein L32  45.28 
 
 
59 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.784617  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3503  50S ribosomal protein L32  40.74 
 
 
55 aa  48.1  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000266571  hitchhiker  0.00520609 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0639  50S ribosomal protein L32  47.17 
 
 
59 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0492807  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1574  50S ribosomal protein L32  40.74 
 
 
55 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000166965  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0995  50S ribosomal protein L32  47.17 
 
 
59 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1077  50S ribosomal protein L32  47.17 
 
 
59 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.990769 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1119  50S ribosomal protein L32  47.17 
 
 
59 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1412  ribosomal protein L32  47.17 
 
 
62 aa  48.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2482  50S ribosomal protein L32  45.28 
 
 
59 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.130811  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2800  50S ribosomal protein L32  45.28 
 
 
59 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.223415  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2794  50S ribosomal protein L32  45.28 
 
 
59 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.317349  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2855  50S ribosomal protein L32  45.28 
 
 
59 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1805  50S ribosomal protein L32  45.28 
 
 
59 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1207  50S ribosomal protein L32  42.59 
 
 
64 aa  47.8  0.00005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1113  50S ribosomal protein L32  42.59 
 
 
64 aa  47.8  0.00005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1619  50S ribosomal protein L32  42.86 
 
 
56 aa  47.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000529201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>