178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0633 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0633  ribosomal protein L32  100 
 
 		 63 aa  127  4.0000000000000003e-29  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2129  ribosomal protein L32  59.32 
 
 		 59 aa  73.2  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0120071  normal  0.0237649 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4342  50S ribosomal protein L32  55.74 
 
 		 61 aa  68.2  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0708  50S ribosomal protein L32  50.88 
 
 		 57 aa  68.2  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0117733  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3111  50S ribosomal protein L32  54.1 
 
 		 61 aa  67.4  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3119  50S ribosomal protein L32  55.74 
 
 		 61 aa  67.4  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1775  50S ribosomal protein L32  56.9 
 
 		 59 aa  66.6  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4153  50S ribosomal protein L32  54.1 
 
 		 61 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.867327 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3825  50S ribosomal protein L32  54.1 
 
 		 61 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.828831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1710  50S ribosomal protein L32  56.9 
 
 		 59 aa  66.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.142223  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3426  50S ribosomal protein L32  56.9 
 
 		 60 aa  65.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1411  50S ribosomal protein L32P  55.17 
 
 		 60 aa  65.1  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.361798  hitchhiker  0.00000964737 
 
 
-
 
NC_002978  WD0987  50S ribosomal protein L32  55.56 
 
 		 60 aa  64.7  0.0000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5277  50S ribosomal protein L32  54.1 
 
 		 61 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.5638  normal  0.0541919 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0122  50S ribosomal protein L32  55.17 
 
 		 61 aa  64.7  0.0000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1913  50S ribosomal protein L32P  50.88 
 
 		 62 aa  64.3  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5920  50S ribosomal protein L32  54.1 
 
 		 61 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0576  50S ribosomal protein L32  55.56 
 
 		 61 aa  63.9  0.0000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.194083  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3774  50S ribosomal protein L32  55.17 
 
 		 62 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5115  50S ribosomal protein L32  55.17 
 
 		 62 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.637 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0446  50S ribosomal protein L32  55.56 
 
 		 61 aa  63.5  0.000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.735597  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0820  50S ribosomal protein L32  53.33 
 
 		 62 aa  63.2  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177127 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3466  50S ribosomal protein L32  55.17 
 
 		 62 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.357647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1559  ribosomal protein L32  51.67 
 
 		 60 aa  63.5  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3664  50S ribosomal protein L32  55.17 
 
 		 62 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.416645  normal  0.271996 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1207  50S ribosomal protein L32  44.83 
 
 		 64 aa  62.4  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1113  50S ribosomal protein L32  44.83 
 
 		 64 aa  62.4  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1128  ribosomal protein L32  53.45 
 
 		 59 aa  62.8  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.798956  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0868  50S ribosomal protein L32  45 
 
 		 64 aa  62.4  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0499  50S ribosomal protein L32  53.45 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00950666 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3254  ribosomal protein L32  48.33 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000244715  normal  0.0606215 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02705  50S ribosomal protein L32  41.38 
 
 		 62 aa  58.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3078  50S ribosomal protein L32  48.33 
 
 		 60 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0527  50S ribosomal protein L32  51.72 
 
 		 60 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2005  50S ribosomal protein L32  49.12 
 
 		 64 aa  58.5  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0514  50S ribosomal protein L32  51.72 
 
 		 60 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0311  50S ribosomal protein L32  51.72 
 
 		 60 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0625  50S ribosomal protein L32  49.18 
 
 		 61 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19517  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2498  50S ribosomal protein L32  47.27 
 
 		 56 aa  58.2  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000463288  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1808  ribosomal protein L32  45 
 
 		 62 aa  57.8  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.253284  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0497  50S ribosomal protein L32  51.72 
 
 		 61 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3652  50S ribosomal protein L32  48.33 
 
 		 60 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1574  50S ribosomal protein L32  48.15 
 
 		 55 aa  57.4  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000166965  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2812  50S ribosomal protein L32  47.27 
 
 		 56 aa  57.4  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000738596  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1585  50S ribosomal protein L32  49.12 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0810373  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1603  ribosomal protein L32  49.09 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0931242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2507  50S ribosomal protein L32  47.27 
 
 		 56 aa  57.4  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000163859  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0634  50S ribosomal protein L32  46.67 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.307696  normal  0.0979505 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1682  50S ribosomal protein L32  48.15 
 
 		 55 aa  57.4  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000176962  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3503  50S ribosomal protein L32  48.15 
 
 		 55 aa  57.4  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000266571  hitchhiker  0.00520609 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0600  50S ribosomal protein L32  49.12 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113317  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0425  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 63 aa  57.4  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.311335 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2368  50S ribosomal protein L32  53.57 
 
 		 59 aa  57.4  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3282  50S ribosomal protein L32  48.33 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2635  50S ribosomal protein L32  48.33 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3291  50S ribosomal protein L32  53.57 
 
 		 67 aa  57  0.00000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.366938 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1728  50S ribosomal protein L32  46.67 
 
 		 60 aa  57  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1599  50S ribosomal protein L32  45.45 
 
 		 56 aa  57  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000342659  hitchhiker  0.00352794 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1870  ribosomal protein L32  44.07 
 
 		 59 aa  57  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.819487  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1387  50S ribosomal protein L32  48.33 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1553  50S ribosomal protein L32  49.15 
 
 		 59 aa  56.6  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198496  normal  0.0691397 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1619  50S ribosomal protein L32  47.27 
 
 		 56 aa  56.2  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000529201  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02335  50S ribosomal protein L32  44.44 
 
 		 56 aa  56.2  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000084206  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1420  50S ribosomal protein L32  53.57 
 
 		 59 aa  56.6  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.640468  normal  0.982205 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2126  ribosomal protein L32  47.27 
 
 		 56 aa  56.6  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.625409  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1953  50S ribosomal protein L32  47.17 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000656252  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1181  50S ribosomal protein L32  48.33 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1583  50S ribosomal protein L32  47.27 
 
 		 56 aa  56.6  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000129748  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2652  50S ribosomal protein L32  45.45 
 
 		 56 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000778579  hitchhiker  0.0000333205 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1048  50S ribosomal protein L32  49.12 
 
 		 59 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2780  50S ribosomal protein L32  45.45 
 
 		 56 aa  55.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2038  ribosomal protein L32  47.27 
 
 		 56 aa  56.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000023625  normal  0.0132901 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1626  50S ribosomal protein L32  49.09 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.904867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1509  50S ribosomal protein L32  49.15 
 
 		 59 aa  55.5  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0171128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2297  50S ribosomal protein L32  45.45 
 
 		 56 aa  55.8  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000139706  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0438  ribosomal protein L32  44.44 
 
 		 56 aa  55.8  0.0000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1902  50S ribosomal protein L32  46.3 
 
 		 55 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000663482  hitchhiker  0.00000521877 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2400  50S ribosomal protein L32  45.45 
 
 		 56 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000318296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2470  50S ribosomal protein L32  45.45 
 
 		 56 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000146933  hitchhiker  0.00550798 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1425  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 59 aa  55.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.249628  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1755  50S ribosomal protein L32  45.45 
 
 		 56 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000534053  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2562  50S ribosomal protein L32  45.45 
 
 		 56 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000144666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1085  ribosomal protein L32  47.27 
 
 		 57 aa  55.5  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.444858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1237  50S ribosomal protein L32  47.17 
 
 		 59 aa  55.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.409262  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1715  50S ribosomal protein L32  45.45 
 
 		 56 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000625062  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0613  50S ribosomal protein L32  46.67 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000739879 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1578  50S ribosomal protein L32  45.45 
 
 		 56 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000427195  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14890  50S ribosomal protein L32  51.85 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1712  50S ribosomal protein L32  45.45 
 
 		 56 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329996  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0978  50S ribosomal protein L32  49.12 
 
 		 59 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0979958 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1495  50S ribosomal protein L32  45.45 
 
 		 56 aa  55.5  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237731  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25630  50S ribosomal protein L32  51.85 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000532355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2191  50S ribosomal protein L32  51.85 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2109  50S ribosomal protein L32  47.17 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.11709  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0913  50S ribosomal protein L32  49.12 
 
 		 59 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0957314 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1984  50S ribosomal protein L32  43.64 
 
 		 56 aa  54.7  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000709039  decreased coverage  0.000595562 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5274  50S ribosomal protein L32  46.67 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2628  ribosomal protein L32  47.27 
 
 		 56 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000100434  hitchhiker  0.00000142207 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1644  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119469  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0077  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 57 aa  53.9  0.0000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000137918  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>