281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1152 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3110  50S ribosomal protein L32  100 
 
 		 60 aa  123  8.000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0115825  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1152  50S ribosomal protein L32  100 
 
 		 60 aa  123  8.000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1873  50S ribosomal protein L32  91.67 
 
 		 60 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00104363  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1597  50S ribosomal protein L32  81.67 
 
 		 60 aa  105  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000469826  normal  0.427035 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1599  50S ribosomal protein L32  80 
 
 		 60 aa  102  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.919739  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1740  50S ribosomal protein L32  83.64 
 
 		 61 aa  98.2  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000325807  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1941  50S ribosomal protein L32  76.27 
 
 		 61 aa  97.4  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000297405  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1434  50S ribosomal protein L32  74.14 
 
 		 58 aa  94.7  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000740742  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1904  50S ribosomal protein L32  62.5 
 
 		 61 aa  80.1  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0519443  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1579  50S ribosomal protein L32  62.5 
 
 		 61 aa  80.1  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.146664  normal  0.0105145 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0013  50S ribosomal protein L32  62.26 
 
 		 60 aa  73.9  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1369  50S ribosomal protein L32  55.93 
 
 		 60 aa  72.8  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00758434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0070  ribosomal protein L32  57.63 
 
 		 59 aa  72  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1611  50S ribosomal protein L32  61.82 
 
 		 60 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0069978  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1665  50S ribosomal protein L32  56.9 
 
 		 61 aa  70.5  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0871064  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0952  ribosomal protein L32  55.93 
 
 		 60 aa  69.7  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000023662  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3692  ribosomal protein L32  51.72 
 
 		 64 aa  69.3  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10230  ribosomal protein L32  60 
 
 		 57 aa  68.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000453136  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2936  50S ribosomal protein L32  58.62 
 
 		 59 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2752  50S ribosomal protein L32  58.62 
 
 		 59 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2844  50S ribosomal protein L32  58.62 
 
 		 59 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1058  ribosomal protein L32  51.67 
 
 		 72 aa  68.6  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000694342  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1086  50S ribosomal protein L32  51.67 
 
 		 72 aa  68.2  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3554  50S ribosomal protein L32  51.72 
 
 		 59 aa  67.8  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.873264  normal  0.953551 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1729  ribosomal protein L32  51.67 
 
 		 60 aa  67.8  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000316991  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0656  ribosomal protein L32  55.93 
 
 		 59 aa  67.4  0.00000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000179278  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1786  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 67 aa  67.4  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.213514  normal  0.442946 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11280  LSU ribosomal protein L32P  54.39 
 
 		 64 aa  67.4  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_002936  DET1275  50S ribosomal protein L32  48.33 
 
 		 72 aa  67  0.00000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00245853  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2559  ribosomal protein L32  58.18 
 
 		 60 aa  67  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1667  50S ribosomal protein L32  52.63 
 
 		 64 aa  67  0.00000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.294477  normal  0.0177766 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1355  LSU ribosomal protein L32P  52.63 
 
 		 57 aa  65.9  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000130715  normal  0.0921955 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1340  ribosomal protein L32  60 
 
 		 58 aa  65.9  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.5028  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4144  50S ribosomal protein L32  49.15 
 
 		 62 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1848  50S ribosomal protein L32  55.93 
 
 		 59 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2988  ribosomal protein L32  55.36 
 
 		 61 aa  64.7  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000138033  normal  0.0167419 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1006  50S ribosomal protein L32  56.36 
 
 		 57 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1412  ribosomal protein L32  57.14 
 
 		 62 aa  64.3  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2274  ribosomal protein L32  52.63 
 
 		 64 aa  64.3  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2368  50S ribosomal protein L32  50.91 
 
 		 59 aa  63.9  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0650  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 58 aa  63.9  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2741  50S ribosomal protein L32  51.72 
 
 		 59 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1364  ribosomal protein L32  50.85 
 
 		 59 aa  63.2  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000136875  normal  0.339824 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0718  50S ribosomal protein L32  50.91 
 
 		 57 aa  63.2  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000204019  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0743  ribosomal protein L32  46.55 
 
 		 63 aa  62.8  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2134  50S ribosomal protein L32  51.72 
 
 		 60 aa  63.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000309957  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1859  50S ribosomal protein L32  49.09 
 
 		 68 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.898391  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1878  50S ribosomal protein L32  54.55 
 
 		 58 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1910  50S ribosomal protein L32  47.27 
 
 		 68 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2614  50S ribosomal protein L32  47.27 
 
 		 68 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.417222  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1229  50S ribosomal protein L32  49.15 
 
 		 59 aa  62.4  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000037109  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1175  50S ribosomal protein L32  53.57 
 
 		 57 aa  62.4  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000516362 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1420  50S ribosomal protein L32  50.91 
 
 		 59 aa  62  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.640468  normal  0.982205 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1272  50S ribosomal protein L32  47.27 
 
 		 68 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.165805 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1187  50S ribosomal protein L32  51.85 
 
 		 57 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000373536  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1209  50S ribosomal protein L32  51.85 
 
 		 57 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000286453  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1285  50S ribosomal protein L32  53.57 
 
 		 57 aa  62.8  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.761755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3291  50S ribosomal protein L32  50.88 
 
 		 67 aa  62  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.366938 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0825  50S ribosomal protein L32  50.88 
 
 		 58 aa  61.6  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369841  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0916  50S ribosomal protein L32  45.9 
 
 		 68 aa  61.6  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05660  LSU ribosomal protein L32P  50.88 
 
 		 59 aa  60.5  0.000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00609202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1718  50S ribosomal protein L32  45.9 
 
 		 68 aa  60.5  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.220434  normal  0.0708692 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0271  50S ribosomal protein L32  50.88 
 
 		 67 aa  60.1  0.000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.750719  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1646  ribosomal protein L32  43.1 
 
 		 63 aa  59.7  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0855  ribosomal protein L32  52.54 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0211  ribosomal protein L32  50 
 
 		 58 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1040  50S ribosomal protein L32  47.46 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3938  50S ribosomal protein L32  50.91 
 
 		 57 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3969  50S ribosomal protein L32  50.91 
 
 		 57 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00129021  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4024  50S ribosomal protein L32  50.91 
 
 		 57 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000551113  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3774  50S ribosomal protein L32  50.91 
 
 		 57 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000267221  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3665  50S ribosomal protein L32  50.91 
 
 		 57 aa  58.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.37288e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3682  50S ribosomal protein L32  50.91 
 
 		 57 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000568057  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3750  50S ribosomal protein L32  50.91 
 
 		 57 aa  58.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000162679  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0637  50S ribosomal protein L32  47.46 
 
 		 59 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000000215733  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4062  50S ribosomal protein L32  50.91 
 
 		 57 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000151561  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2573  50S ribosomal protein L32  50.91 
 
 		 57 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000210481  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3976  50S ribosomal protein L32  50.91 
 
 		 57 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135237  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1217  50S ribosomal protein L32  50.91 
 
 		 57 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000020176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1259  50S ribosomal protein L32  46.55 
 
 		 58 aa  58.9  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000760142  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2781  50S ribosomal protein L32  49.09 
 
 		 59 aa  58.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.147785  normal  0.143209 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3824  50S ribosomal protein L32  50.85 
 
 		 59 aa  58.9  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000535994  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0195  50S ribosomal protein L32  44.07 
 
 		 59 aa  57.8  0.00000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.223455  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2568  ribosomal protein L32  52.54 
 
 		 62 aa  57.8  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0633  ribosomal protein L32  46.77 
 
 		 63 aa  57.4  0.00000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2078  ribosomal protein L32  46.67 
 
 		 60 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0182296  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2467  ribosomal protein L32  42.37 
 
 		 61 aa  57  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000135728  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1608  50S ribosomal protein L32  47.37 
 
 		 66 aa  57  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3103  50S ribosomal protein L32  58.18 
 
 		 59 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113399 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0233  50S ribosomal protein L32  45.76 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000487517  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2140  50S ribosomal protein L32  43.1 
 
 		 61 aa  55.8  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0473  50S ribosomal protein L32  50.82 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000488467  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0497  50S ribosomal protein L32  46.55 
 
 		 61 aa  55.5  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0625  50S ribosomal protein L32  46.55 
 
 		 61 aa  55.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19517  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf408  ribosomal protein L32  46.43 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl396  50S ribosomal protein L32  45.76 
 
 		 59 aa  55.5  0.0000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00156688  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0386  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 59 aa  55.5  0.0000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0173336  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0499  50S ribosomal protein L32  47.46 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00950666 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1643  50S ribosomal protein L32P  50.85 
 
 		 59 aa  55.1  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000510247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4030  ribosomal protein L32  49.12 
 
 		 59 aa  55.1  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>