278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1904 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1579  50S ribosomal protein L32  100 
 
 		 61 aa  128  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.146664  normal  0.0105145 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1904  50S ribosomal protein L32  100 
 
 		 61 aa  128  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0519443  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1740  50S ribosomal protein L32  63.64 
 
 		 61 aa  82  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000325807  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1859  50S ribosomal protein L32  60 
 
 		 68 aa  81.3  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.898391  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1152  50S ribosomal protein L32  62.5 
 
 		 60 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1786  50S ribosomal protein L32  59.65 
 
 		 67 aa  79.3  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.213514  normal  0.442946 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3110  50S ribosomal protein L32  62.5 
 
 		 60 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0115825  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1873  50S ribosomal protein L32  62.5 
 
 		 60 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00104363  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1941  50S ribosomal protein L32  55.74 
 
 		 61 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000297405  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1599  50S ribosomal protein L32  62.5 
 
 		 60 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.919739  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1597  50S ribosomal protein L32  60.71 
 
 		 60 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000469826  normal  0.427035 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0916  50S ribosomal protein L32  58.33 
 
 		 68 aa  77.4  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1910  50S ribosomal protein L32  56.67 
 
 		 68 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2614  50S ribosomal protein L32  56.67 
 
 		 68 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.417222  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1272  50S ribosomal protein L32  56.67 
 
 		 68 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.165805 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1434  50S ribosomal protein L32  60 
 
 		 58 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000740742  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1665  50S ribosomal protein L32  57.38 
 
 		 61 aa  73.2  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0871064  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1718  50S ribosomal protein L32  55 
 
 		 68 aa  72.8  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.220434  normal  0.0708692 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3291  50S ribosomal protein L32  60 
 
 		 67 aa  70.9  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.366938 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0013  50S ribosomal protein L32  52.83 
 
 		 60 aa  70.1  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0271  50S ribosomal protein L32  56.36 
 
 		 67 aa  66.2  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.750719  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05660  LSU ribosomal protein L32P  52.54 
 
 		 59 aa  66.2  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00609202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0855  ribosomal protein L32  58.93 
 
 		 59 aa  65.9  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0386  50S ribosomal protein L32  54.1 
 
 		 59 aa  65.1  0.0000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0173336  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1364  ribosomal protein L32  52.63 
 
 		 59 aa  65.1  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000136875  normal  0.339824 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3554  50S ribosomal protein L32  55.74 
 
 		 59 aa  64.7  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.873264  normal  0.953551 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl396  50S ribosomal protein L32  55.56 
 
 		 59 aa  64.3  0.0000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00156688  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2368  50S ribosomal protein L32  54.55 
 
 		 59 aa  63.5  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1420  50S ribosomal protein L32  54.55 
 
 		 59 aa  63.2  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.640468  normal  0.982205 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10230  ribosomal protein L32  50.88 
 
 		 57 aa  62.4  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000453136  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0070  ribosomal protein L32  51.72 
 
 		 59 aa  62  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0403  50S ribosomal protein L32  53.57 
 
 		 59 aa  61.6  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2191  50S ribosomal protein L32  51.67 
 
 		 60 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25630  50S ribosomal protein L32  51.67 
 
 		 60 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000532355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1611  50S ribosomal protein L32  51.72 
 
 		 60 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0069978  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1729  ribosomal protein L32  47.37 
 
 		 60 aa  60.8  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000316991  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0657  ribosomal protein L32  50 
 
 		 68 aa  60.8  0.000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1625  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 60 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.701038 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3835  ribosomal protein L32  50 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.460634  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1644  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119469  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4160  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 60 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1626  50S ribosomal protein L32  51.72 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.904867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14890  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 60 aa  60.1  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1848  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 59 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1911  50S ribosomal protein L32  51.67 
 
 		 60 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.361385  unclonable  0.000000174861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1487  50S ribosomal protein L32  51.67 
 
 		 60 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1522  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 60 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.484698 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0233  50S ribosomal protein L32  44.07 
 
 		 60 aa  59.3  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000487517  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3803  50S ribosomal protein L32  51.67 
 
 		 60 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1369  50S ribosomal protein L32  46.43 
 
 		 60 aa  58.9  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00758434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1006  50S ribosomal protein L32  50.88 
 
 		 57 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1603  ribosomal protein L32  45 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0931242  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1025  50S ribosomal protein L32  46.43 
 
 		 62 aa  58.5  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103246  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0656  ribosomal protein L32  51.72 
 
 		 59 aa  58.5  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000179278  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2013  50S ribosomal protein L32  48.33 
 
 		 59 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0396  50S ribosomal protein L32  51.79 
 
 		 59 aa  58.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0825  50S ribosomal protein L32  44.64 
 
 		 58 aa  58.2  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369841  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1229  50S ribosomal protein L32  45.45 
 
 		 59 aa  58.2  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000037109  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2005  50S ribosomal protein L32  49.09 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1878  50S ribosomal protein L32  49.12 
 
 		 58 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2297  50S ribosomal protein L32  49.12 
 
 		 56 aa  57.4  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000139706  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0438  ribosomal protein L32  52.63 
 
 		 56 aa  57.8  0.00000006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4144  50S ribosomal protein L32  44.64 
 
 		 62 aa  57.8  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1495  50S ribosomal protein L32  49.12 
 
 		 56 aa  57.4  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237731  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0718  50S ribosomal protein L32  45.61 
 
 		 57 aa  57.4  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000204019  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1625a  50S ribosomal protein L32  47.46 
 
 		 61 aa  57  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100343  normal  0.018062 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1048  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 59 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2780  50S ribosomal protein L32  47.37 
 
 		 56 aa  56.6  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0743  ribosomal protein L32  46.43 
 
 		 63 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1755  50S ribosomal protein L32  47.37 
 
 		 56 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000534053  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3503  50S ribosomal protein L32  47.27 
 
 		 55 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000266571  hitchhiker  0.00520609 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1712  50S ribosomal protein L32  47.37 
 
 		 56 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329996  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1553  50S ribosomal protein L32  48.33 
 
 		 59 aa  56.6  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198496  normal  0.0691397 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1574  50S ribosomal protein L32  47.27 
 
 		 55 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000166965  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1715  50S ribosomal protein L32  47.37 
 
 		 56 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000625062  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2652  50S ribosomal protein L32  47.37 
 
 		 56 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000778579  hitchhiker  0.0000333205 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0798  50S ribosomal protein L32  45.61 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174048  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0775  50S ribosomal protein L32  45.61 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000368381  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2400  50S ribosomal protein L32  47.37 
 
 		 56 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000318296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2470  50S ribosomal protein L32  47.37 
 
 		 56 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000146933  hitchhiker  0.00550798 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2562  50S ribosomal protein L32  47.37 
 
 		 56 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000144666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1984  50S ribosomal protein L32  47.37 
 
 		 56 aa  56.2  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000709039  decreased coverage  0.000595562 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1682  50S ribosomal protein L32  47.27 
 
 		 55 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000176962  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1578  50S ribosomal protein L32  47.37 
 
 		 56 aa  56.6  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000427195  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1902  50S ribosomal protein L32  47.27 
 
 		 55 aa  55.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000663482  hitchhiker  0.00000521877 
 
 
-
 
NC_002620  TC0195  50S ribosomal protein L32  43.64 
 
 		 59 aa  55.8  0.0000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.223455  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2812  50S ribosomal protein L32  47.37 
 
 		 56 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000738596  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1583  50S ribosomal protein L32  50.88 
 
 		 56 aa  55.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000129748  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2844  50S ribosomal protein L32  49.12 
 
 		 59 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2752  50S ribosomal protein L32  49.12 
 
 		 59 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0499  50S ribosomal protein L32  47.37 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00950666 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2936  50S ribosomal protein L32  49.12 
 
 		 59 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0913  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 59 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0957314 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1619  50S ribosomal protein L32  52.63 
 
 		 56 aa  56.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000529201  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1209  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 57 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000286453  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1070  50S ribosomal protein L32  46.43 
 
 		 59 aa  55.1  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.772826  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1728  50S ribosomal protein L32  45.9 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2559  ribosomal protein L32  44.44 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1187  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 57 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000373536  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0171  50S ribosomal protein L32  46.03 
 
 		 63 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>