248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1848 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1848  50S ribosomal protein L32  100 
 
 		 59 aa  123  9e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1611  50S ribosomal protein L32  85 
 
 		 60 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0069978  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3103  50S ribosomal protein L32  86.44 
 
 		 59 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113399 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1412  ribosomal protein L32  63.64 
 
 		 62 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0070  ribosomal protein L32  60 
 
 		 59 aa  72  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1873  50S ribosomal protein L32  55.93 
 
 		 60 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00104363  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1599  50S ribosomal protein L32  55.93 
 
 		 60 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.919739  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1941  50S ribosomal protein L32  57.41 
 
 		 61 aa  67  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000297405  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3110  50S ribosomal protein L32  55.93 
 
 		 60 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0115825  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1597  50S ribosomal protein L32  54.24 
 
 		 60 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000469826  normal  0.427035 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1152  50S ribosomal protein L32  55.93 
 
 		 60 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1740  50S ribosomal protein L32  53.7 
 
 		 61 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000325807  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1434  50S ribosomal protein L32  49.09 
 
 		 58 aa  60.5  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000740742  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1340  ribosomal protein L32  55.56 
 
 		 58 aa  59.7  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.5028  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1579  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 61 aa  60.1  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.146664  normal  0.0105145 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1904  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 61 aa  60.1  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0519443  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0340  50S ribosomal protein L32  52.73 
 
 		 57 aa  60.1  0.00000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1859  50S ribosomal protein L32  51.67 
 
 		 68 aa  60.1  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.898391  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0916  50S ribosomal protein L32  46.67 
 
 		 68 aa  57  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1006  50S ribosomal protein L32  49.12 
 
 		 57 aa  57  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05660  LSU ribosomal protein L32P  54.39 
 
 		 59 aa  55.8  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00609202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1786  50S ribosomal protein L32  48.28 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.213514  normal  0.442946 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1878  50S ribosomal protein L32  47.37 
 
 		 58 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2267  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 59 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5274  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3291  50S ribosomal protein L32  52.73 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.366938 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2432  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 59 aa  54.7  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.716206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1387  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2635  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1181  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3282  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2368  50S ribosomal protein L32  50.91 
 
 		 59 aa  54.3  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1728  50S ribosomal protein L32  48.33 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3652  50S ribosomal protein L32  48.33 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0825  50S ribosomal protein L32  42.86 
 
 		 58 aa  54.3  0.0000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369841  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1229  50S ribosomal protein L32  45.76 
 
 		 59 aa  53.9  0.0000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000037109  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3254  ribosomal protein L32  50 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000244715  normal  0.0606215 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4030  ribosomal protein L32  48.21 
 
 		 59 aa  53.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1420  50S ribosomal protein L32  50.91 
 
 		 59 aa  53.5  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.640468  normal  0.982205 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0396  50S ribosomal protein L32  48.33 
 
 		 59 aa  53.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1048  50S ribosomal protein L32  48.33 
 
 		 59 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0211  ribosomal protein L32  50.91 
 
 		 58 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1626  50S ribosomal protein L32  51.85 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.904867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2988  ribosomal protein L32  49.15 
 
 		 61 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000138033  normal  0.0167419 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0978  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0979958 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0995  50S ribosomal protein L32  48.33 
 
 		 59 aa  52  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3692  ribosomal protein L32  46.3 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1718  50S ribosomal protein L32  46.67 
 
 		 68 aa  52.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.220434  normal  0.0708692 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3078  50S ribosomal protein L32  48.33 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2573  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 57 aa  52  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000210481  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2467  ribosomal protein L32  40.68 
 
 		 61 aa  52  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000135728  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0743  ribosomal protein L32  44.83 
 
 		 63 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3969  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 57 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00129021  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3774  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 57 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000267221  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3665  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 57 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.37288e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3682  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 57 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000568057  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1553  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 59 aa  52  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198496  normal  0.0691397 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3976  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 57 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135237  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4231  50S ribosomal protein L32  48.33 
 
 		 59 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0358913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4062  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 57 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000151561  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0999  50S ribosomal protein L32  48.33 
 
 		 59 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.852349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0403  50S ribosomal protein L32  46.67 
 
 		 59 aa  52  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1665  50S ribosomal protein L32  48.28 
 
 		 61 aa  52  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0871064  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0826  ribosomal protein L32  48.33 
 
 		 59 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.784617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1070  50S ribosomal protein L32  48.33 
 
 		 59 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2914  50S ribosomal protein L32  48.33 
 
 		 59 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1729  ribosomal protein L32  44.07 
 
 		 60 aa  52  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000316991  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3750  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 57 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000162679  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0639  50S ribosomal protein L32  48.33 
 
 		 59 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0492807  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1217  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 57 aa  52  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000020176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4024  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 57 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000551113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3938  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 57 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1119  50S ribosomal protein L32  48.33 
 
 		 59 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2613  ribosomal protein L32  45.76 
 
 		 74 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.737881 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1870  ribosomal protein L32  46.67 
 
 		 59 aa  51.6  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.819487  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2185  50S ribosomal protein L32  48.33 
 
 		 59 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409214  normal  0.0976531 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1077  50S ribosomal protein L32  48.33 
 
 		 59 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.990769 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2005  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 64 aa  51.6  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2013  50S ribosomal protein L32  46.67 
 
 		 59 aa  51.6  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10230  ribosomal protein L32  47.27 
 
 		 57 aa  51.6  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000453136  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0650  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 58 aa  50.8  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2614  50S ribosomal protein L32  47.27 
 
 		 68 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.417222  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1910  50S ribosomal protein L32  47.27 
 
 		 68 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1272  50S ribosomal protein L32  47.27 
 
 		 68 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.165805 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0913  50S ribosomal protein L32  48.33 
 
 		 59 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0957314 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0718  50S ribosomal protein L32  40.35 
 
 		 57 aa  50.8  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000204019  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2936  50S ribosomal protein L32  49.12 
 
 		 59 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2844  50S ribosomal protein L32  49.12 
 
 		 59 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1715  50S ribosomal protein L32  46.67 
 
 		 59 aa  50.8  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2752  50S ribosomal protein L32  49.12 
 
 		 59 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1209  50S ribosomal protein L32  42.59 
 
 		 57 aa  50.4  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000286453  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2430  ribosomal protein L32  48.33 
 
 		 59 aa  50.8  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0972633  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1187  50S ribosomal protein L32  42.59 
 
 		 57 aa  50.4  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000373536  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2909  50S ribosomal protein L32  46.67 
 
 		 59 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.180854  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1364  ribosomal protein L32  45.76 
 
 		 59 aa  50.4  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000136875  normal  0.339824 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2482  50S ribosomal protein L32  46.67 
 
 		 59 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.130811  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2800  50S ribosomal protein L32  46.67 
 
 		 59 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.223415  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2794  50S ribosomal protein L32  46.67 
 
 		 59 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.317349  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2855  50S ribosomal protein L32  46.67 
 
 		 59 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1805  50S ribosomal protein L32  46.67 
 
 		 59 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>