169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_05660 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_05660  LSU ribosomal protein L32P  100 
 
 		 59 aa  120  5e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00609202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1364  ribosomal protein L32  81.03 
 
 		 59 aa  102  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000136875  normal  0.339824 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0855  ribosomal protein L32  65.52 
 
 		 59 aa  84  7e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1729  ribosomal protein L32  55.17 
 
 		 60 aa  69.7  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000316991  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0825  50S ribosomal protein L32  51.72 
 
 		 58 aa  67.4  0.00000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369841  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1873  50S ribosomal protein L32  56.14 
 
 		 60 aa  67  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00104363  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1599  50S ribosomal protein L32  55.17 
 
 		 60 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.919739  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1904  50S ribosomal protein L32  52.54 
 
 		 61 aa  66.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0519443  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1579  50S ribosomal protein L32  52.54 
 
 		 61 aa  66.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.146664  normal  0.0105145 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1740  50S ribosomal protein L32  50.85 
 
 		 61 aa  65.1  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000325807  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1369  50S ribosomal protein L32  52.63 
 
 		 60 aa  64.7  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00758434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1597  50S ribosomal protein L32  53.45 
 
 		 60 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000469826  normal  0.427035 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1941  50S ribosomal protein L32  50.85 
 
 		 61 aa  63.5  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000297405  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1786  50S ribosomal protein L32  53.57 
 
 		 67 aa  62  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.213514  normal  0.442946 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0775  50S ribosomal protein L32  48.33 
 
 		 60 aa  62.4  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000368381  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0798  50S ribosomal protein L32  48.33 
 
 		 60 aa  62.4  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174048  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1844  50S ribosomal protein L32  47.46 
 
 		 60 aa  62  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000000652015  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1259  50S ribosomal protein L32  47.37 
 
 		 58 aa  61.6  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000760142  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10230  ribosomal protein L32  51.79 
 
 		 57 aa  61.2  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000453136  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1152  50S ribosomal protein L32  50.88 
 
 		 60 aa  60.5  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3110  50S ribosomal protein L32  50.88 
 
 		 60 aa  60.5  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0115825  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1434  50S ribosomal protein L32  49.12 
 
 		 58 aa  60.5  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000740742  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1025  50S ribosomal protein L32  45.61 
 
 		 62 aa  59.7  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103246  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3692  ribosomal protein L32  53.57 
 
 		 64 aa  60.1  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1859  50S ribosomal protein L32  50.85 
 
 		 68 aa  60.1  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.898391  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0473  50S ribosomal protein L32  51.67 
 
 		 60 aa  60.1  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000488467  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1718  50S ribosomal protein L32  50.85 
 
 		 68 aa  58.2  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.220434  normal  0.0708692 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0233  50S ribosomal protein L32  43.33 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000487517  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0650  50S ribosomal protein L32  49.15 
 
 		 58 aa  57.4  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0718  50S ribosomal protein L32  48.21 
 
 		 57 aa  57  0.00000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000204019  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2614  50S ribosomal protein L32  48.21 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.417222  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1611  50S ribosomal protein L32  55.36 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0069978  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1848  50S ribosomal protein L32  54.39 
 
 		 59 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1272  50S ribosomal protein L32  48.21 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.165805 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1910  50S ribosomal protein L32  48.21 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1187  50S ribosomal protein L32  49.09 
 
 		 57 aa  55.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000373536  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1209  50S ribosomal protein L32  49.09 
 
 		 57 aa  55.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000286453  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0836  50S ribosomal protein L32  45.76 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000369284  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1006  50S ribosomal protein L32  47.37 
 
 		 57 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1665  50S ribosomal protein L32  51.79 
 
 		 61 aa  54.7  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0871064  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0916  50S ribosomal protein L32  42.37 
 
 		 68 aa  55.1  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0770  50S ribosomal protein L32  41.07 
 
 		 56 aa  55.1  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000008111  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2078  ribosomal protein L32  41.07 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0182296  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1355  LSU ribosomal protein L32P  47.37 
 
 		 57 aa  54.3  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000130715  normal  0.0921955 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1730  ribosomal protein L32  45.45 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00544421  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4144  50S ribosomal protein L32  45.61 
 
 		 62 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1667  50S ribosomal protein L32  49.12 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.294477  normal  0.0177766 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1040  50S ribosomal protein L32  51.85 
 
 		 64 aa  53.5  0.0000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0657  ribosomal protein L32  42.37 
 
 		 68 aa  53.5  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3554  50S ribosomal protein L32  48.21 
 
 		 59 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.873264  normal  0.953551 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1229  50S ribosomal protein L32  41.38 
 
 		 59 aa  53.1  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000037109  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2805  ribosomal protein L32  44.26 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2085  ribosomal protein L32  60.47 
 
 		 45 aa  53.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000287258  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1420  50S ribosomal protein L32  45.76 
 
 		 59 aa  52.8  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.640468  normal  0.982205 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2134  50S ribosomal protein L32  44.83 
 
 		 60 aa  52.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000309957  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1340  ribosomal protein L32  44.64 
 
 		 58 aa  52.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.5028  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1412  ribosomal protein L32  49.15 
 
 		 62 aa  52.4  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2368  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 59 aa  52  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1376  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 61 aa  52  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.179787  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1878  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 58 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0271  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.750719  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2274  ribosomal protein L32  47.37 
 
 		 64 aa  51.6  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1285  50S ribosomal protein L32  45.61 
 
 		 57 aa  51.2  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.761755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1175  50S ribosomal protein L32  45.61 
 
 		 57 aa  51.2  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000516362 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2613  ribosomal protein L32  51.79 
 
 		 74 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.737881 
 
 
-
 
NC_002620  TC0195  50S ribosomal protein L32  44.64 
 
 		 59 aa  50.8  0.000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.223455  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2140  50S ribosomal protein L32  42.11 
 
 		 61 aa  50.8  0.000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0211  ribosomal protein L32  44.07 
 
 		 58 aa  50.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0013  50S ribosomal protein L32  44.44 
 
 		 60 aa  50.8  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0335  ribosomal protein L32  48.15 
 
 		 64 aa  50.8  0.000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4030  ribosomal protein L32  47.46 
 
 		 59 aa  50.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1329  ribosomal protein L32  42.86 
 
 		 61 aa  50.8  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000150645  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0656  ribosomal protein L32  40.35 
 
 		 59 aa  50.8  0.000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000179278  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0201  50S ribosomal protein L32  46.55 
 
 		 63 aa  50.8  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0591945  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3969  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 57 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00129021  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3774  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 57 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000267221  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3665  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 57 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.37288e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3682  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 57 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000568057  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4062  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 57 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000151561  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1217  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 57 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000020176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3291  50S ribosomal protein L32  48.21 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.366938 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3976  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 57 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135237  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4024  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 57 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000551113  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2988  ribosomal protein L32  43.1 
 
 		 61 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000138033  normal  0.0167419 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3938  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 57 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1890  ribosomal protein L32  43.33 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2573  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 57 aa  50.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000210481  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3750  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 57 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000162679  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0171  50S ribosomal protein L32  45.61 
 
 		 63 aa  48.9  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1103  ribosomal protein L32  36.67 
 
 		 63 aa  49.3  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000214959  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2488  50S ribosomal protein L32  45.61 
 
 		 63 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1804  ribosomal protein L32  48.21 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11280  LSU ribosomal protein L32P  45.61 
 
 		 64 aa  49.7  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0135  50S ribosomal protein L32  45.61 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000114527  normal  0.772153 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0952  ribosomal protein L32  39.29 
 
 		 60 aa  48.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000023662  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3824  50S ribosomal protein L32  37.29 
 
 		 59 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000535994  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0184  50S ribosomal protein L32  44.83 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00725165  normal  0.800579 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2844  50S ribosomal protein L32  38.98 
 
 		 59 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2752  50S ribosomal protein L32  38.98 
 
 		 59 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3103  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 59 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113399 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>