126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2078 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2078  ribosomal protein L32  100 
 
 		 60 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0182296  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0637  50S ribosomal protein L32  60 
 
 		 59 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000000215733  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1025  50S ribosomal protein L32  51.67 
 
 		 62 aa  72.8  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103246  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1364  ribosomal protein L32  55.36 
 
 		 59 aa  69.3  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000136875  normal  0.339824 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10230  ribosomal protein L32  56.14 
 
 		 57 aa  69.3  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000453136  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0952  ribosomal protein L32  59.65 
 
 		 60 aa  68.2  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000023662  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0940  ribosomal protein L32  54.24 
 
 		 63 aa  67.8  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000379015  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1259  50S ribosomal protein L32  50.85 
 
 		 58 aa  67.4  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000760142  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1729  ribosomal protein L32  53.57 
 
 		 60 aa  64.7  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000316991  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0386  50S ribosomal protein L32  52.73 
 
 		 59 aa  64.3  0.0000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0173336  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3692  ribosomal protein L32  50.85 
 
 		 64 aa  63.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1369  50S ribosomal protein L32  51.79 
 
 		 60 aa  62.8  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00758434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1873  50S ribosomal protein L32  51.67 
 
 		 60 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00104363  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3824  50S ribosomal protein L32  54.39 
 
 		 59 aa  62.8  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000535994  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0855  ribosomal protein L32  50 
 
 		 59 aa  62  0.000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2134  50S ribosomal protein L32  48.21 
 
 		 60 aa  61.6  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000309957  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1941  50S ribosomal protein L32  51.67 
 
 		 61 aa  61.6  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000297405  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0770  50S ribosomal protein L32  48.21 
 
 		 56 aa  59.7  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000008111  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0657  ribosomal protein L32  46.67 
 
 		 68 aa  59.7  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2752  50S ribosomal protein L32  42.37 
 
 		 59 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2844  50S ribosomal protein L32  42.37 
 
 		 59 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2936  50S ribosomal protein L32  42.37 
 
 		 59 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1229  50S ribosomal protein L32  44.07 
 
 		 59 aa  57  0.00000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000037109  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3110  50S ribosomal protein L32  46.67 
 
 		 60 aa  57  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0115825  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1152  50S ribosomal protein L32  46.67 
 
 		 60 aa  57  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0825  50S ribosomal protein L32  51.79 
 
 		 58 aa  57  0.00000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369841  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0013  50S ribosomal protein L32  48.21 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1975  50S ribosomal protein L32  40 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.536749  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1693  50S ribosomal protein L32  40 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0667  50S ribosomal protein L32  44.44 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.728717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0233  50S ribosomal protein L32  43.1 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000487517  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0211  ribosomal protein L32  48.21 
 
 		 58 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1786  50S ribosomal protein L32  46.67 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.213514  normal  0.442946 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1174  ribosomal protein L32  42.86 
 
 		 57 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000264274  normal  0.0273197 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1340  ribosomal protein L32  45.76 
 
 		 58 aa  56.2  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.5028  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1740  50S ribosomal protein L32  45 
 
 		 61 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000325807  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1599  50S ribosomal protein L32  48.21 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.919739  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl396  50S ribosomal protein L32  45.45 
 
 		 59 aa  54.7  0.0000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00156688  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05660  LSU ribosomal protein L32P  41.07 
 
 		 59 aa  54.7  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00609202  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2559  ribosomal protein L32  48.15 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2781  50S ribosomal protein L32  47.27 
 
 		 59 aa  54.3  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.147785  normal  0.143209 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2741  50S ribosomal protein L32  37.29 
 
 		 59 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1329  ribosomal protein L32  49.09 
 
 		 61 aa  54.7  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000150645  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2988  ribosomal protein L32  44.44 
 
 		 61 aa  54.3  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000138033  normal  0.0167419 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1355  LSU ribosomal protein L32P  46.43 
 
 		 57 aa  53.9  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000130715  normal  0.0921955 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1434  50S ribosomal protein L32  42.37 
 
 		 58 aa  53.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000740742  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1597  50S ribosomal protein L32  45 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000469826  normal  0.427035 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1285  50S ribosomal protein L32  46.43 
 
 		 57 aa  52.8  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.761755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1175  50S ribosomal protein L32  46.43 
 
 		 57 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000516362 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0656  ribosomal protein L32  42.86 
 
 		 59 aa  53.1  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000179278  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0650  50S ribosomal protein L32  46.43 
 
 		 58 aa  52.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1103  ribosomal protein L32  37.7 
 
 		 63 aa  52.8  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000214959  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2613  ribosomal protein L32  44.44 
 
 		 74 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.737881 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1718  50S ribosomal protein L32  47.37 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.220434  normal  0.0708692 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1006  50S ribosomal protein L32  44.64 
 
 		 57 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1137  50S ribosomal protein L32  44.64 
 
 		 56 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131577  normal  0.0222442 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1667  50S ribosomal protein L32  44.83 
 
 		 64 aa  52  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.294477  normal  0.0177766 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1376  50S ribosomal protein L32  49.15 
 
 		 61 aa  51.2  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.179787  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1579  50S ribosomal protein L32  42.86 
 
 		 61 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.146664  normal  0.0105145 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1904  50S ribosomal protein L32  42.86 
 
 		 61 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0519443  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4144  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 62 aa  51.2  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1026  50S ribosomal protein L32P  49.06 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000147931  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1665  50S ribosomal protein L32  40.68 
 
 		 61 aa  50.8  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0871064  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11280  LSU ribosomal protein L32P  43.1 
 
 		 64 aa  50.4  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1804  ribosomal protein L32  40.74 
 
 		 65 aa  50.4  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf408  ribosomal protein L32  48.15 
 
 		 65 aa  50.4  0.000009  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3291  50S ribosomal protein L32  46.03 
 
 		 67 aa  50.1  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.366938 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1878  50S ribosomal protein L32  42.86 
 
 		 58 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2614  50S ribosomal protein L32  40.35 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.417222  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0942  ribosomal protein L32  61.76 
 
 		 38 aa  48.9  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000123212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1420  50S ribosomal protein L32  44.83 
 
 		 59 aa  48.9  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.640468  normal  0.982205 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1643  50S ribosomal protein L32P  43.86 
 
 		 59 aa  48.9  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000510247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1272  50S ribosomal protein L32  40.35 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.165805 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1910  50S ribosomal protein L32  40.35 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1730  ribosomal protein L32  50.88 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00544421  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2274  ribosomal protein L32  41.38 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2805  ribosomal protein L32  44.07 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3969  50S ribosomal protein L32  42.11 
 
 		 57 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00129021  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3774  50S ribosomal protein L32  42.11 
 
 		 57 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000267221  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3665  50S ribosomal protein L32  42.11 
 
 		 57 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.37288e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3682  50S ribosomal protein L32  42.11 
 
 		 57 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000568057  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4062  50S ribosomal protein L32  42.11 
 
 		 57 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000151561  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0916  50S ribosomal protein L32  40.35 
 
 		 68 aa  48.9  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1859  50S ribosomal protein L32  40.35 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.898391  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2294  ribosomal protein L32  43.1 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252255  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0271  50S ribosomal protein L32  43.33 
 
 		 67 aa  48.9  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.750719  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3554  50S ribosomal protein L32  42.11 
 
 		 59 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.873264  normal  0.953551 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2573  50S ribosomal protein L32  42.11 
 
 		 57 aa  48.5  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000210481  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3750  50S ribosomal protein L32  42.11 
 
 		 57 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000162679  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3976  50S ribosomal protein L32  42.11 
 
 		 57 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135237  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4024  50S ribosomal protein L32  42.11 
 
 		 57 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000551113  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1217  50S ribosomal protein L32  42.11 
 
 		 57 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000020176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3938  50S ribosomal protein L32  42.11 
 
 		 57 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4030  ribosomal protein L32  42.37 
 
 		 59 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1608  50S ribosomal protein L32  41.38 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0836  50S ribosomal protein L32  38.33 
 
 		 60 aa  47.8  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000369284  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3434  ribosomal protein L32  45.61 
 
 		 58 aa  47.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.976937  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1646  ribosomal protein L32  38.89 
 
 		 63 aa  47  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0718  50S ribosomal protein L32  36.84 
 
 		 57 aa  47  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000204019  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2615  ribosomal protein L32  46.67 
 
 		 59 aa  47.4  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.499524 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>