161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1025 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1025  50S ribosomal protein L32  100 
 
 		 62 aa  130  5e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103246  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2078  ribosomal protein L32  51.67 
 
 		 60 aa  72.8  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0182296  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10230  ribosomal protein L32  54.39 
 
 		 57 aa  69.3  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000453136  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1259  50S ribosomal protein L32  45.76 
 
 		 58 aa  62.8  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000760142  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0386  50S ribosomal protein L32  52.73 
 
 		 59 aa  62.8  0.000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0173336  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl396  50S ribosomal protein L32  54.55 
 
 		 59 aa  61.6  0.000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00156688  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1364  ribosomal protein L32  45.76 
 
 		 59 aa  61.6  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000136875  normal  0.339824 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0637  50S ribosomal protein L32  48.33 
 
 		 59 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000000215733  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1229  50S ribosomal protein L32  50.85 
 
 		 59 aa  61.2  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000037109  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1006  50S ribosomal protein L32  50.88 
 
 		 57 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2805  ribosomal protein L32  43.75 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05660  LSU ribosomal protein L32P  45.61 
 
 		 59 aa  59.7  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00609202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2752  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2936  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2844  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1355  LSU ribosomal protein L32P  47.37 
 
 		 57 aa  58.9  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000130715  normal  0.0921955 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3824  50S ribosomal protein L32  47.37 
 
 		 59 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000535994  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1904  50S ribosomal protein L32  46.43 
 
 		 61 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0519443  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1579  50S ribosomal protein L32  46.43 
 
 		 61 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.146664  normal  0.0105145 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0667  50S ribosomal protein L32  45.45 
 
 		 63 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.728717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1329  ribosomal protein L32  52.83 
 
 		 61 aa  58.2  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000150645  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0233  50S ribosomal protein L32  44.07 
 
 		 60 aa  58.2  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000487517  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1878  50S ribosomal protein L32  49.12 
 
 		 58 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1786  50S ribosomal protein L32  43.55 
 
 		 67 aa  57  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.213514  normal  0.442946 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3969  50S ribosomal protein L32  49.12 
 
 		 57 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00129021  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3774  50S ribosomal protein L32  49.12 
 
 		 57 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000267221  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3665  50S ribosomal protein L32  49.12 
 
 		 57 aa  57  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.37288e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3682  50S ribosomal protein L32  49.12 
 
 		 57 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000568057  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4062  50S ribosomal protein L32  49.12 
 
 		 57 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000151561  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3938  50S ribosomal protein L32  49.12 
 
 		 57 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4024  50S ribosomal protein L32  49.12 
 
 		 57 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000551113  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1217  50S ribosomal protein L32  49.12 
 
 		 57 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000020176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3976  50S ribosomal protein L32  49.12 
 
 		 57 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135237  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1873  50S ribosomal protein L32  45.9 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00104363  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1340  ribosomal protein L32  45.61 
 
 		 58 aa  56.6  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.5028  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2573  50S ribosomal protein L32  49.12 
 
 		 57 aa  57  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000210481  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3750  50S ribosomal protein L32  49.12 
 
 		 57 aa  57  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000162679  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0656  ribosomal protein L32  45.61 
 
 		 59 aa  56.6  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000179278  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0952  ribosomal protein L32  45 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000023662  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0855  ribosomal protein L32  44.64 
 
 		 59 aa  55.8  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2134  50S ribosomal protein L32  45.76 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000309957  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1729  ribosomal protein L32  46.43 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000316991  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0916  50S ribosomal protein L32  46.03 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0775  50S ribosomal protein L32  45.61 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000368381  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0798  50S ribosomal protein L32  45.61 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174048  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1941  50S ribosomal protein L32  48.33 
 
 		 61 aa  55.5  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000297405  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1665  50S ribosomal protein L32  45.76 
 
 		 61 aa  54.7  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0871064  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0013  50S ribosomal protein L32  46.3 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1643  50S ribosomal protein L32P  45 
 
 		 59 aa  54.7  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000510247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2741  50S ribosomal protein L32  38.6 
 
 		 59 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3110  50S ribosomal protein L32  44.26 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0115825  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1152  50S ribosomal protein L32  44.26 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1103  ribosomal protein L32  36.51 
 
 		 63 aa  53.9  0.0000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000214959  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf408  ribosomal protein L32  49.09 
 
 		 65 aa  53.5  0.0000009  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0940  ribosomal protein L32  46.43 
 
 		 63 aa  53.1  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000379015  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0825  50S ribosomal protein L32  47.37 
 
 		 58 aa  53.1  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369841  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0718  50S ribosomal protein L32  40.35 
 
 		 57 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000204019  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1775  50S ribosomal protein L32  44.83 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0770  50S ribosomal protein L32  42.86 
 
 		 56 aa  52  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000008111  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1369  50S ribosomal protein L32  40.35 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00758434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1859  50S ribosomal protein L32  46.43 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.898391  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1710  50S ribosomal protein L32  44.83 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.142223  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2613  ribosomal protein L32  43.1 
 
 		 74 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.737881 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1804  ribosomal protein L32  42.11 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0657  ribosomal protein L32  42.86 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1434  50S ribosomal protein L32  42.37 
 
 		 58 aa  51.6  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000740742  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3426  50S ribosomal protein L32  44.83 
 
 		 60 aa  51.2  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0271  50S ribosomal protein L32  45 
 
 		 67 aa  51.2  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.750719  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1740  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 61 aa  51.2  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000325807  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4153  50S ribosomal protein L32  43.1 
 
 		 61 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.867327 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3825  50S ribosomal protein L32  43.1 
 
 		 61 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.828831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1187  50S ribosomal protein L32  41.82 
 
 		 57 aa  50.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000373536  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1209  50S ribosomal protein L32  41.82 
 
 		 57 aa  50.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000286453  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3291  50S ribosomal protein L32  43.33 
 
 		 67 aa  50.8  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.366938 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3692  ribosomal protein L32  44.64 
 
 		 64 aa  50.8  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1137  50S ribosomal protein L32  45.61 
 
 		 56 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131577  normal  0.0222442 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3119  50S ribosomal protein L32  41.38 
 
 		 61 aa  50.4  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1718  50S ribosomal protein L32  44.44 
 
 		 68 aa  50.1  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.220434  normal  0.0708692 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1599  50S ribosomal protein L32  39.34 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.919739  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5920  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4144  50S ribosomal protein L32  46.43 
 
 		 62 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4342  50S ribosomal protein L32  43.1 
 
 		 61 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2559  ribosomal protein L32  47.27 
 
 		 60 aa  50.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3774  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 62 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3466  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 62 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.357647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5115  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 62 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.637 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5277  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.5638  normal  0.0541919 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0425  50S ribosomal protein L32  39.66 
 
 		 63 aa  49.7  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.311335 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3664  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 62 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.416645  normal  0.271996 
 
 
-
 
NC_002620  TC0195  50S ribosomal protein L32  43.33 
 
 		 59 aa  49.3  0.00002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.223455  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0820  50S ribosomal protein L32  43.1 
 
 		 62 aa  48.9  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177127 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0724  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0650  50S ribosomal protein L32  43.1 
 
 		 58 aa  48.9  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0514  50S ribosomal protein L32  45.61 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0311  50S ribosomal protein L32  45.61 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1376  50S ribosomal protein L32  45.16 
 
 		 61 aa  49.7  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.179787  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4030  ribosomal protein L32  44.07 
 
 		 59 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1026  50S ribosomal protein L32P  50 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000147931  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3111  50S ribosomal protein L32  41.38 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2614  50S ribosomal protein L32  42.86 
 
 		 68 aa  48.9  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.417222  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>