254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1611 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1611  50S ribosomal protein L32  100 
 
 		 60 aa  125  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0069978  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1848  50S ribosomal protein L32  85 
 
 		 59 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3103  50S ribosomal protein L32  79.31 
 
 		 59 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113399 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1412  ribosomal protein L32  60 
 
 		 62 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0070  ribosomal protein L32  56.9 
 
 		 59 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3110  50S ribosomal protein L32  61.82 
 
 		 60 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0115825  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1152  50S ribosomal protein L32  61.82 
 
 		 60 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1873  50S ribosomal protein L32  58.18 
 
 		 60 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00104363  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1599  50S ribosomal protein L32  56.36 
 
 		 60 aa  62.8  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.919739  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1941  50S ribosomal protein L32  52.73 
 
 		 61 aa  62.4  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000297405  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0916  50S ribosomal protein L32  52.54 
 
 		 68 aa  61.6  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1740  50S ribosomal protein L32  52.73 
 
 		 61 aa  61.6  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000325807  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1626  50S ribosomal protein L32  50.82 
 
 		 60 aa  60.8  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.904867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1579  50S ribosomal protein L32  51.72 
 
 		 61 aa  60.8  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.146664  normal  0.0105145 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1859  50S ribosomal protein L32  54.24 
 
 		 68 aa  60.8  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.898391  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1904  50S ribosomal protein L32  51.72 
 
 		 61 aa  60.8  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0519443  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1434  50S ribosomal protein L32  50.91 
 
 		 58 aa  60.5  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000740742  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1597  50S ribosomal protein L32  52.73 
 
 		 60 aa  60.5  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000469826  normal  0.427035 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1340  ribosomal protein L32  50 
 
 		 58 aa  58.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.5028  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1006  50S ribosomal protein L32  49.12 
 
 		 57 aa  58.2  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2368  50S ribosomal protein L32  53.57 
 
 		 59 aa  58.5  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2005  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 64 aa  58.2  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2191  50S ribosomal protein L32  52.46 
 
 		 60 aa  57  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25630  50S ribosomal protein L32  52.46 
 
 		 60 aa  57  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000532355  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14890  50S ribosomal protein L32  50.82 
 
 		 60 aa  57  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1878  50S ribosomal protein L32  47.37 
 
 		 58 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1786  50S ribosomal protein L32  47.46 
 
 		 67 aa  56.2  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.213514  normal  0.442946 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1718  50S ribosomal protein L32  49.15 
 
 		 68 aa  56.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.220434  normal  0.0708692 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3291  50S ribosomal protein L32  53.57 
 
 		 67 aa  56.6  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.366938 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1911  50S ribosomal protein L32  50.82 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.361385  unclonable  0.000000174861 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3803  50S ribosomal protein L32  50.82 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1611  50S ribosomal protein L32  47.37 
 
 		 56 aa  55.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000123515  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1420  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 59 aa  55.5  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.640468  normal  0.982205 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1522  50S ribosomal protein L32  49.18 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.484698 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05660  LSU ribosomal protein L32P  55.36 
 
 		 59 aa  55.8  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00609202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1487  50S ribosomal protein L32  50.82 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1625  50S ribosomal protein L32  49.18 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.701038 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2628  ribosomal protein L32  47.37 
 
 		 56 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000100434  hitchhiker  0.00000142207 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2297  50S ribosomal protein L32  47.37 
 
 		 56 aa  55.1  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000139706  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1910  50S ribosomal protein L32  51.79 
 
 		 68 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1495  50S ribosomal protein L32  47.37 
 
 		 56 aa  55.5  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237731  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1870  ribosomal protein L32  49.15 
 
 		 59 aa  55.5  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.819487  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0340  50S ribosomal protein L32  45.61 
 
 		 57 aa  55.1  0.0000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2614  50S ribosomal protein L32  51.79 
 
 		 68 aa  55.1  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.417222  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0396  50S ribosomal protein L32  47.54 
 
 		 59 aa  54.7  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1984  50S ribosomal protein L32  47.37 
 
 		 56 aa  54.7  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000709039  decreased coverage  0.000595562 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3254  ribosomal protein L32  49.09 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000244715  normal  0.0606215 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1272  50S ribosomal protein L32  51.79 
 
 		 68 aa  55.1  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.165805 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3835  ribosomal protein L32  47.54 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.460634  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1644  50S ribosomal protein L32  47.54 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119469  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2267  50S ribosomal protein L32  47.54 
 
 		 59 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2432  50S ribosomal protein L32  47.54 
 
 		 59 aa  54.7  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.716206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1755  50S ribosomal protein L32  47.37 
 
 		 56 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000534053  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2573  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 57 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000210481  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3969  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 57 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00129021  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1578  50S ribosomal protein L32  47.37 
 
 		 56 aa  54.3  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000427195  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2780  50S ribosomal protein L32  47.37 
 
 		 56 aa  54.3  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3774  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 57 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000267221  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3665  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 57 aa  54.3  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.37288e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3682  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 57 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000568057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2652  50S ribosomal protein L32  47.37 
 
 		 56 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000778579  hitchhiker  0.0000333205 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4160  50S ribosomal protein L32  47.54 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3750  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 57 aa  54.3  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000162679  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4062  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 57 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000151561  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1712  50S ribosomal protein L32  47.37 
 
 		 56 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329996  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1217  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 57 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000020176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4024  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 57 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000551113  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2400  50S ribosomal protein L32  47.37 
 
 		 56 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000318296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2470  50S ribosomal protein L32  47.37 
 
 		 56 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000146933  hitchhiker  0.00550798 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3938  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 57 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2562  50S ribosomal protein L32  47.37 
 
 		 56 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000144666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1181  50S ribosomal protein L32  47.27 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1715  50S ribosomal protein L32  47.37 
 
 		 56 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000625062  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3976  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 57 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135237  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1553  50S ribosomal protein L32  50.91 
 
 		 59 aa  53.9  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198496  normal  0.0691397 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1229  50S ribosomal protein L32  45.76 
 
 		 59 aa  53.9  0.0000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000037109  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5274  50S ribosomal protein L32  47.27 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1728  50S ribosomal protein L32  45.45 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3652  50S ribosomal protein L32  45.45 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1387  50S ribosomal protein L32  47.27 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3282  50S ribosomal protein L32  47.27 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2635  50S ribosomal protein L32  47.27 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0271  50S ribosomal protein L32  51.67 
 
 		 67 aa  53.5  0.0000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.750719  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1077  50S ribosomal protein L32  50.82 
 
 		 59 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.990769 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0718  50S ribosomal protein L32  42.11 
 
 		 57 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000204019  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1048  50S ribosomal protein L32  49.18 
 
 		 59 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0403  50S ribosomal protein L32  45.9 
 
 		 59 aa  53.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4231  50S ribosomal protein L32  50.82 
 
 		 59 aa  52.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0358913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1209  50S ribosomal protein L32  42.11 
 
 		 57 aa  52.8  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000286453  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0999  50S ribosomal protein L32  50.82 
 
 		 59 aa  52.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.852349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1070  50S ribosomal protein L32  50.82 
 
 		 59 aa  52.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2914  50S ribosomal protein L32  50.82 
 
 		 59 aa  52.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1187  50S ribosomal protein L32  42.11 
 
 		 57 aa  52.8  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000373536  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10230  ribosomal protein L32  47.37 
 
 		 57 aa  53.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000453136  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0639  50S ribosomal protein L32  50.82 
 
 		 59 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0492807  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1619  50S ribosomal protein L32  52.63 
 
 		 56 aa  53.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000529201  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0995  50S ribosomal protein L32  50.82 
 
 		 59 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1119  50S ribosomal protein L32  50.82 
 
 		 59 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1583  50S ribosomal protein L32  50.88 
 
 		 56 aa  53.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000129748  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1211  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 57 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.3151100000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>