121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0855 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0855  ribosomal protein L32  100 
 
 		 59 aa  123  7e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1364  ribosomal protein L32  71.19 
 
 		 59 aa  91.3  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000136875  normal  0.339824 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05660  LSU ribosomal protein L32P  65.52 
 
 		 59 aa  84  7e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00609202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1729  ribosomal protein L32  52.54 
 
 		 60 aa  70.5  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000316991  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0825  50S ribosomal protein L32  55.36 
 
 		 58 aa  67.4  0.00000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369841  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1873  50S ribosomal protein L32  55.93 
 
 		 60 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00104363  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1579  50S ribosomal protein L32  58.93 
 
 		 61 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.146664  normal  0.0105145 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1904  50S ribosomal protein L32  58.93 
 
 		 61 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0519443  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1599  50S ribosomal protein L32  57.63 
 
 		 60 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.919739  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0473  50S ribosomal protein L32  55.36 
 
 		 60 aa  64.3  0.0000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000488467  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1844  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 60 aa  64.3  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000000652015  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2078  ribosomal protein L32  50 
 
 		 60 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0182296  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1740  50S ribosomal protein L32  53.57 
 
 		 61 aa  61.6  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000325807  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1730  ribosomal protein L32  52.73 
 
 		 64 aa  61.2  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00544421  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1040  50S ribosomal protein L32  58.49 
 
 		 64 aa  61.2  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1597  50S ribosomal protein L32  52.54 
 
 		 60 aa  60.5  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000469826  normal  0.427035 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0657  ribosomal protein L32  51.79 
 
 		 68 aa  60.1  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3692  ribosomal protein L32  50.88 
 
 		 64 aa  60.1  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1259  50S ribosomal protein L32  51.79 
 
 		 58 aa  59.7  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000760142  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1786  50S ribosomal protein L32  50.85 
 
 		 67 aa  58.9  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.213514  normal  0.442946 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1941  50S ribosomal protein L32  51.79 
 
 		 61 aa  59.3  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000297405  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3110  50S ribosomal protein L32  52.54 
 
 		 60 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0115825  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1152  50S ribosomal protein L32  52.54 
 
 		 60 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0836  50S ribosomal protein L32  48.21 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000369284  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1434  50S ribosomal protein L32  50.85 
 
 		 58 aa  57.8  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000740742  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0386  50S ribosomal protein L32  50.85 
 
 		 59 aa  57.4  0.00000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0173336  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0775  50S ribosomal protein L32  44.64 
 
 		 60 aa  57  0.00000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000368381  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0798  50S ribosomal protein L32  44.64 
 
 		 60 aa  57  0.00000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174048  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1369  50S ribosomal protein L32  47.46 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00758434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0656  ribosomal protein L32  44.07 
 
 		 59 aa  56.2  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000179278  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1025  50S ribosomal protein L32  44.64 
 
 		 62 aa  55.8  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103246  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1667  50S ribosomal protein L32  53.7 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.294477  normal  0.0177766 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3824  50S ribosomal protein L32  46.43 
 
 		 59 aa  53.9  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000535994  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2781  50S ribosomal protein L32  52.73 
 
 		 59 aa  53.5  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.147785  normal  0.143209 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0650  50S ribosomal protein L32  48.21 
 
 		 58 aa  53.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1665  50S ribosomal protein L32  47.46 
 
 		 61 aa  53.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0871064  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1859  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 68 aa  53.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.898391  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1285  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 57 aa  52.8  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.761755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1175  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 57 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000516362 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0335  ribosomal protein L32  47.17 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11280  LSU ribosomal protein L32P  50 
 
 		 64 aa  53.5  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10230  ribosomal protein L32  48.21 
 
 		 57 aa  52.8  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000453136  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1646  ribosomal protein L32  44.83 
 
 		 63 aa  52.4  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2274  ribosomal protein L32  48.21 
 
 		 64 aa  52  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4030  ribosomal protein L32  50 
 
 		 59 aa  51.6  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1910  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 68 aa  50.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0211  ribosomal protein L32  49.15 
 
 		 58 aa  50.8  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0233  50S ribosomal protein L32  39.66 
 
 		 60 aa  50.4  0.000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000487517  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1718  50S ribosomal protein L32  48.21 
 
 		 68 aa  50.4  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.220434  normal  0.0708692 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2614  50S ribosomal protein L32  48.21 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.417222  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0013  50S ribosomal protein L32  44.44 
 
 		 60 aa  50.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0916  50S ribosomal protein L32  44.64 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1272  50S ribosomal protein L32  48.21 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.165805 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1355  LSU ribosomal protein L32P  44.64 
 
 		 57 aa  50.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000130715  normal  0.0921955 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2752  50S ribosomal protein L32  41.07 
 
 		 59 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4144  50S ribosomal protein L32  42.37 
 
 		 62 aa  48.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1376  50S ribosomal protein L32  49.15 
 
 		 61 aa  48.9  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.179787  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3554  50S ribosomal protein L32  45.76 
 
 		 59 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.873264  normal  0.953551 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0171  50S ribosomal protein L32  44.83 
 
 		 63 aa  49.7  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2844  50S ribosomal protein L32  41.07 
 
 		 59 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2936  50S ribosomal protein L32  41.07 
 
 		 59 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0135  50S ribosomal protein L32  43.1 
 
 		 63 aa  48.9  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000114527  normal  0.772153 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0770  50S ribosomal protein L32  37.5 
 
 		 56 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000008111  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3291  50S ribosomal protein L32  48.21 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.366938 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2134  50S ribosomal protein L32  44.07 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000309957  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1575  50S ribosomal protein L32  45.61 
 
 		 59 aa  48.1  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0654579 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0271  50S ribosomal protein L32  48.21 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.750719  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0637  50S ribosomal protein L32  44.64 
 
 		 59 aa  48.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000000215733  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1608  50S ribosomal protein L32  47.17 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0952  ribosomal protein L32  42.37 
 
 		 60 aa  47.4  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000023662  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2085  ribosomal protein L32  51.16 
 
 		 45 aa  47.4  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000287258  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1229  50S ribosomal protein L32  40.68 
 
 		 59 aa  47  0.00008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000037109  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3434  ribosomal protein L32  46.43 
 
 		 58 aa  47  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.976937  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0718  50S ribosomal protein L32  42.86 
 
 		 57 aa  47  0.00009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000204019  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1420  50S ribosomal protein L32  48.21 
 
 		 59 aa  47  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.640468  normal  0.982205 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1340  ribosomal protein L32  42.86 
 
 		 58 aa  46.2  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.5028  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2294  ribosomal protein L32  46.43 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252255  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2741  50S ribosomal protein L32  35.71 
 
 		 59 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1890  ribosomal protein L32  40.32 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0195  50S ribosomal protein L32  40.68 
 
 		 59 aa  45.8  0.0002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.223455  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1058  ribosomal protein L32  43.55 
 
 		 72 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000694342  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1975  50S ribosomal protein L32  40.68 
 
 		 60 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.536749  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1693  50S ribosomal protein L32  40.68 
 
 		 60 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2805  ribosomal protein L32  38.71 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0184  50S ribosomal protein L32  42.11 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00725165  normal  0.800579 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0940  ribosomal protein L32  42.86 
 
 		 63 aa  46.2  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000379015  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1006  50S ribosomal protein L32  44.64 
 
 		 57 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl396  50S ribosomal protein L32  45.45 
 
 		 59 aa  45.1  0.0003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00156688  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1187  50S ribosomal protein L32  41.82 
 
 		 57 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000373536  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1209  50S ribosomal protein L32  41.82 
 
 		 57 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000286453  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1275  50S ribosomal protein L32  42.37 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00245853  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3969  50S ribosomal protein L32  41.07 
 
 		 57 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00129021  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3774  50S ribosomal protein L32  41.07 
 
 		 57 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000267221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3682  50S ribosomal protein L32  41.07 
 
 		 57 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000568057  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2573  50S ribosomal protein L32  41.07 
 
 		 57 aa  44.7  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000210481  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3750  50S ribosomal protein L32  41.07 
 
 		 57 aa  44.7  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000162679  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3976  50S ribosomal protein L32  41.07 
 
 		 57 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135237  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4024  50S ribosomal protein L32  41.07 
 
 		 57 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000551113  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1217  50S ribosomal protein L32  41.07 
 
 		 57 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000020176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3938  50S ribosomal protein L32  41.07 
 
 		 57 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>