158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0633 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0633  ribosomal protein L32  100 
 
 		 63 aa  128  3e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2467  ribosomal protein L32  69.09 
 
 		 61 aa  90.5  7e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000135728  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5115  50S ribosomal protein L32  50.82 
 
 		 62 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.637 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5277  50S ribosomal protein L32  51.67 
 
 		 61 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.5638  normal  0.0541919 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5920  50S ribosomal protein L32  51.67 
 
 		 61 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3664  50S ribosomal protein L32  50.82 
 
 		 62 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.416645  normal  0.271996 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3774  50S ribosomal protein L32  50.82 
 
 		 62 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3466  50S ribosomal protein L32  50.82 
 
 		 62 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.357647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3111  50S ribosomal protein L32  51.67 
 
 		 61 aa  68.2  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3825  50S ribosomal protein L32  56.36 
 
 		 61 aa  67.4  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.828831  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4153  50S ribosomal protein L32  56.36 
 
 		 61 aa  67.4  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.867327 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1128  ribosomal protein L32  54.39 
 
 		 59 aa  67.4  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.798956  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3119  50S ribosomal protein L32  54.55 
 
 		 61 aa  67  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3426  50S ribosomal protein L32  56.36 
 
 		 60 aa  67  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4342  50S ribosomal protein L32  56.36 
 
 		 61 aa  67  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0625  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 61 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19517  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1411  50S ribosomal protein L32P  48.21 
 
 		 60 aa  66.2  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.361798  hitchhiker  0.00000964737 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0497  50S ribosomal protein L32  48.33 
 
 		 61 aa  65.5  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0122  50S ribosomal protein L32  54.55 
 
 		 61 aa  65.5  0.0000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1775  50S ribosomal protein L32  52.73 
 
 		 59 aa  64.7  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1710  50S ribosomal protein L32  52.73 
 
 		 59 aa  64.7  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.142223  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0425  50S ribosomal protein L32  45.9 
 
 		 63 aa  63.2  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.311335 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0527  50S ribosomal protein L32  51.79 
 
 		 60 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1873  50S ribosomal protein L32  50.88 
 
 		 60 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00104363  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0820  50S ribosomal protein L32  47.54 
 
 		 62 aa  62  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177127 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0499  50S ribosomal protein L32  48.21 
 
 		 60 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00950666 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1599  50S ribosomal protein L32  51.61 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.919739  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0514  50S ribosomal protein L32  46.43 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0311  50S ribosomal protein L32  46.43 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1559  ribosomal protein L32  43.33 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1941  50S ribosomal protein L32  46.67 
 
 		 61 aa  58.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000297405  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3110  50S ribosomal protein L32  46.77 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0115825  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1152  50S ribosomal protein L32  46.77 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1434  50S ribosomal protein L32  47.37 
 
 		 58 aa  56.2  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000740742  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1597  50S ribosomal protein L32  46.77 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000469826  normal  0.427035 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1420  50S ribosomal protein L32  47.46 
 
 		 59 aa  55.1  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.640468  normal  0.982205 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2368  50S ribosomal protein L32  47.27 
 
 		 59 aa  54.3  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1740  50S ribosomal protein L32  47.27 
 
 		 61 aa  53.9  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000325807  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1953  50S ribosomal protein L32  48.39 
 
 		 60 aa  53.5  0.0000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000656252  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1579  50S ribosomal protein L32  43.33 
 
 		 61 aa  52.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.146664  normal  0.0105145 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3554  50S ribosomal protein L32  44.07 
 
 		 59 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.873264  normal  0.953551 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1904  50S ribosomal protein L32  43.33 
 
 		 61 aa  52.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0519443  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0070  ribosomal protein L32  42.11 
 
 		 59 aa  52.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1412  ribosomal protein L32  36.67 
 
 		 62 aa  52  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1665  50S ribosomal protein L32  43.64 
 
 		 61 aa  51.6  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0871064  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3291  50S ribosomal protein L32  42.11 
 
 		 67 aa  50.1  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.366938 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7619  50S ribosomal protein L32P  52.38 
 
 		 46 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00560447  normal  0.375625 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1490  50S ribosomal protein L32  47.92 
 
 		 48 aa  49.7  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.334451  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2109  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.11709  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1355  LSU ribosomal protein L32P  45.31 
 
 		 57 aa  49.3  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000130715  normal  0.0921955 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0227  ribosomal protein L32  44.9 
 
 		 50 aa  49.3  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3599  ribosomal protein L32  47.27 
 
 		 59 aa  48.5  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.590227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2614  50S ribosomal protein L32  37.5 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.417222  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3078  50S ribosomal protein L32  43.33 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1272  50S ribosomal protein L32  37.5 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.165805 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1910  50S ribosomal protein L32  37.5 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl396  50S ribosomal protein L32  44.44 
 
 		 59 aa  48.1  0.00004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00156688  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0743  ribosomal protein L32  38.33 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1848  50S ribosomal protein L32  38.98 
 
 		 59 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2988  ribosomal protein L32  40.68 
 
 		 61 aa  47.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000138033  normal  0.0167419 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0077  50S ribosomal protein L32  46.3 
 
 		 57 aa  47.4  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000137918  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0952  ribosomal protein L32  41.82 
 
 		 60 aa  47.4  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000023662  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3692  ribosomal protein L32  42.62 
 
 		 64 aa  47  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0235  50S ribosomal protein L32  45.83 
 
 		 48 aa  47  0.00008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1085  ribosomal protein L32  44.64 
 
 		 57 aa  46.6  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.444858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1237  50S ribosomal protein L32  40 
 
 		 59 aa  46.6  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.409262  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1913  50S ribosomal protein L32P  42.62 
 
 		 62 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0271  50S ribosomal protein L32  36.67 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.750719  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0988  50S ribosomal protein L32  45.83 
 
 		 48 aa  46.6  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2628  ribosomal protein L32  41.82 
 
 		 56 aa  46.2  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000100434  hitchhiker  0.00000142207 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2005  50S ribosomal protein L32  45.45 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0613  50S ribosomal protein L32  41.67 
 
 		 60 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000739879 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1369  50S ribosomal protein L32  40 
 
 		 60 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00758434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0634  50S ribosomal protein L32  40 
 
 		 60 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.307696  normal  0.0979505 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4160  50S ribosomal protein L32  40.98 
 
 		 60 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0013  50S ribosomal protein L32  43.4 
 
 		 60 aa  45.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1859  50S ribosomal protein L32  40.32 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.898391  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1599  50S ribosomal protein L32  40 
 
 		 56 aa  45.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000342659  hitchhiker  0.00352794 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1625  50S ribosomal protein L32  40.98 
 
 		 60 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.701038 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1229  50S ribosomal protein L32  40 
 
 		 59 aa  45.1  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000037109  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0987  50S ribosomal protein L32  42.62 
 
 		 60 aa  45.1  0.0004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3835  ribosomal protein L32  39.34 
 
 		 60 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.460634  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1644  50S ribosomal protein L32  39.34 
 
 		 60 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119469  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1336  50S ribosomal protein L32  43.75 
 
 		 48 aa  44.7  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2559  ribosomal protein L32  39.62 
 
 		 60 aa  45.1  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1611  50S ribosomal protein L32  33.33 
 
 		 60 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0069978  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1628  50S ribosomal protein L32  45.83 
 
 		 48 aa  44.7  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.901218  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2498  50S ribosomal protein L32  40 
 
 		 56 aa  44.7  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000463288  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0375  50S ribosomal protein L32  43.75 
 
 		 48 aa  44.3  0.0005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1808  ribosomal protein L32  41.94 
 
 		 62 aa  44.7  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.253284  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0352  50S ribosomal protein L32  43.75 
 
 		 48 aa  44.3  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2038  ribosomal protein L32  41.82 
 
 		 56 aa  44.3  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000023625  normal  0.0132901 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1425  50S ribosomal protein L32  40.35 
 
 		 59 aa  44.3  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.249628  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0386  50S ribosomal protein L32  38.89 
 
 		 59 aa  43.9  0.0007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0173336  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3652  50S ribosomal protein L32  40 
 
 		 60 aa  43.9  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0868  50S ribosomal protein L32  35.94 
 
 		 64 aa  43.9  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2780  50S ribosomal protein L32  40 
 
 		 56 aa  43.9  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1786  50S ribosomal protein L32  41.82 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.213514  normal  0.442946 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2400  50S ribosomal protein L32  40 
 
 		 56 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000318296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2470  50S ribosomal protein L32  40 
 
 		 56 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000146933  hitchhiker  0.00550798 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>