52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_02340 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_02340  50S ribosomal protein L32 (Ribosomal protein I)  100 
 
 		 65 aa  135  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0206  50S ribosomal protein L32  75 
 
 		 64 aa  104  5e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0647  50S ribosomal protein L32  71.43 
 
 		 64 aa  100  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.24173  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3815  ribosomal protein L32  62.3 
 
 		 63 aa  83.6  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0711  50S ribosomal protein L32  63.79 
 
 		 62 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.282817 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5250  ribosomal protein L32  61.02 
 
 		 64 aa  75.1  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00622213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6298  ribosomal protein L32  56.25 
 
 		 64 aa  75.1  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.507877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4153  ribosomal protein L32  54.84 
 
 		 64 aa  70.9  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.365847 
 
 
-
 
NC_002950  PG2140  50S ribosomal protein L32  52.38 
 
 		 61 aa  58.9  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1625a  50S ribosomal protein L32  49.21 
 
 		 61 aa  54.7  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100343  normal  0.018062 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0135  50S ribosomal protein L32  49.15 
 
 		 63 aa  51.2  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000114527  normal  0.772153 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0718  50S ribosomal protein L32  43.1 
 
 		 57 aa  50.8  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000204019  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0201  50S ribosomal protein L32  46.67 
 
 		 63 aa  50.8  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0591945  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0171  50S ribosomal protein L32  49.15 
 
 		 63 aa  50.4  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1369  50S ribosomal protein L32  45.16 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00758434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0179  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 63 aa  48.9  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.208303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1187  50S ribosomal protein L32  46.3 
 
 		 57 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000373536  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1209  50S ribosomal protein L32  46.3 
 
 		 57 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000286453  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10230  ribosomal protein L32  44.83 
 
 		 57 aa  48.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000453136  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2488  50S ribosomal protein L32  45.31 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1666  50S ribosomal protein L32  45 
 
 		 62 aa  47  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.650179  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0184  50S ribosomal protein L32  43.75 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00725165  normal  0.800579 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1603  ribosomal protein L32  40.62 
 
 		 65 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0931242  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2109  50S ribosomal protein L32  44.64 
 
 		 60 aa  45.8  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.11709  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1340  ribosomal protein L32  43.1 
 
 		 58 aa  45.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.5028  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0446  50S ribosomal protein L32  42.86 
 
 		 61 aa  45.1  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.735597  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1006  50S ribosomal protein L32  39.66 
 
 		 57 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3774  50S ribosomal protein L32  41.38 
 
 		 57 aa  44.3  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000267221  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3750  50S ribosomal protein L32  41.38 
 
 		 57 aa  44.3  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000162679  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2573  50S ribosomal protein L32  41.38 
 
 		 57 aa  44.3  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000210481  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3665  50S ribosomal protein L32  41.38 
 
 		 57 aa  44.3  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.37288e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4062  50S ribosomal protein L32  41.38 
 
 		 57 aa  44.3  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000151561  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3976  50S ribosomal protein L32  41.38 
 
 		 57 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135237  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4024  50S ribosomal protein L32  41.38 
 
 		 57 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000551113  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1217  50S ribosomal protein L32  41.38 
 
 		 57 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000020176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3938  50S ribosomal protein L32  41.38 
 
 		 57 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3682  50S ribosomal protein L32  41.38 
 
 		 57 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000568057  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3969  50S ribosomal protein L32  41.38 
 
 		 57 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00129021  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0576  50S ribosomal protein L32  42.86 
 
 		 61 aa  44.7  0.0005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.194083  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1953  50S ribosomal protein L32  42.86 
 
 		 60 aa  43.9  0.0007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000656252  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1808  ribosomal protein L32  41.54 
 
 		 62 aa  43.9  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.253284  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1355  LSU ribosomal protein L32P  39.66 
 
 		 57 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000130715  normal  0.0921955 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1878  50S ribosomal protein L32  39.66 
 
 		 58 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2129  ribosomal protein L32  40.35 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0120071  normal  0.0237649 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3434  ribosomal protein L32  42.37 
 
 		 58 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.976937  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1434  50S ribosomal protein L32  39.66 
 
 		 58 aa  41.2  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000740742  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2134  50S ribosomal protein L32  39.66 
 
 		 60 aa  41.2  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000309957  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3599  ribosomal protein L32  41.38 
 
 		 59 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.590227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0077  50S ribosomal protein L32  41.38 
 
 		 57 aa  41.2  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000137918  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0600  50S ribosomal protein L32  42.11 
 
 		 64 aa  40.4  0.008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113317  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1585  50S ribosomal protein L32  42.11 
 
 		 64 aa  40.4  0.008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0810373  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2988  ribosomal protein L32  36.07 
 
 		 61 aa  40  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000138033  normal  0.0167419 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>