105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1666 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1666  50S ribosomal protein L32  100 
 
 		 62 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.650179  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0201  50S ribosomal protein L32  83.87 
 
 		 63 aa  107  6e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0591945  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0171  50S ribosomal protein L32  83.33 
 
 		 63 aa  104  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0135  50S ribosomal protein L32  81.67 
 
 		 63 aa  102  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000114527  normal  0.772153 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2488  50S ribosomal protein L32  83.05 
 
 		 63 aa  102  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0179  50S ribosomal protein L32  76.67 
 
 		 63 aa  97.4  6e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.208303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0184  50S ribosomal protein L32  75.41 
 
 		 63 aa  97.1  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00725165  normal  0.800579 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1625a  50S ribosomal protein L32  48.33 
 
 		 61 aa  58.2  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100343  normal  0.018062 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0233  50S ribosomal protein L32  49.15 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000487517  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1040  50S ribosomal protein L32  53.7 
 
 		 64 aa  55.1  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0647  50S ribosomal protein L32  47.62 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.24173  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1975  50S ribosomal protein L32  43.55 
 
 		 60 aa  52.8  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.536749  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1693  50S ribosomal protein L32  43.55 
 
 		 60 aa  52.8  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1844  50S ribosomal protein L32  44.26 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000000652015  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1006  50S ribosomal protein L32  45.76 
 
 		 57 aa  52.8  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1355  LSU ribosomal protein L32P  46.55 
 
 		 57 aa  52.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000130715  normal  0.0921955 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1878  50S ribosomal protein L32  45.76 
 
 		 58 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0718  50S ribosomal protein L32  44.07 
 
 		 57 aa  51.6  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000204019  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2741  50S ribosomal protein L32  46.43 
 
 		 59 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1434  50S ribosomal protein L32  46.55 
 
 		 58 aa  51.6  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000740742  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2805  ribosomal protein L32  47.62 
 
 		 65 aa  51.2  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1175  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 57 aa  50.8  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000516362 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1285  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 57 aa  50.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.761755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10230  ribosomal protein L32  45.76 
 
 		 57 aa  50.8  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000453136  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1599  50S ribosomal protein L32  49.18 
 
 		 60 aa  50.4  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.919739  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2752  50S ribosomal protein L32  46.43 
 
 		 59 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1740  50S ribosomal protein L32  47.54 
 
 		 61 aa  50.4  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000325807  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2844  50S ribosomal protein L32  46.43 
 
 		 59 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2936  50S ribosomal protein L32  46.43 
 
 		 59 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1597  50S ribosomal protein L32  47.54 
 
 		 60 aa  50.4  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000469826  normal  0.427035 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3969  50S ribosomal protein L32  42.37 
 
 		 57 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00129021  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3774  50S ribosomal protein L32  42.37 
 
 		 57 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000267221  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3665  50S ribosomal protein L32  42.37 
 
 		 57 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.37288e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3682  50S ribosomal protein L32  42.37 
 
 		 57 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000568057  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4062  50S ribosomal protein L32  42.37 
 
 		 57 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000151561  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1369  50S ribosomal protein L32  46.77 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00758434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1026  50S ribosomal protein L32P  48.15 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000147931  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0775  50S ribosomal protein L32  42.62 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000368381  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2573  50S ribosomal protein L32  42.37 
 
 		 57 aa  49.7  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000210481  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3750  50S ribosomal protein L32  42.37 
 
 		 57 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000162679  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0798  50S ribosomal protein L32  42.62 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174048  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3976  50S ribosomal protein L32  42.37 
 
 		 57 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135237  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4024  50S ribosomal protein L32  42.37 
 
 		 57 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000551113  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1217  50S ribosomal protein L32  42.37 
 
 		 57 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000020176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3938  50S ribosomal protein L32  42.37 
 
 		 57 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0656  ribosomal protein L32  43.1 
 
 		 59 aa  50.1  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000179278  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1340  ribosomal protein L32  46.55 
 
 		 58 aa  50.1  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.5028  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1873  50S ribosomal protein L32  44.26 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00104363  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1187  50S ribosomal protein L32  44.07 
 
 		 57 aa  49.7  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000373536  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1209  50S ribosomal protein L32  44.07 
 
 		 57 aa  49.7  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000286453  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1103  ribosomal protein L32  38.71 
 
 		 63 aa  48.9  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000214959  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0473  50S ribosomal protein L32  44.26 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000488467  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1729  ribosomal protein L32  42.62 
 
 		 60 aa  48.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000316991  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1665  50S ribosomal protein L32  45.76 
 
 		 61 aa  47.8  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0871064  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1579  50S ribosomal protein L32  46.03 
 
 		 61 aa  47.8  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.146664  normal  0.0105145 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1904  50S ribosomal protein L32  46.03 
 
 		 61 aa  47.8  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0519443  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2134  50S ribosomal protein L32  42.11 
 
 		 60 aa  47.4  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000309957  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0940  ribosomal protein L32  39.68 
 
 		 63 aa  47  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000379015  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02340  50S ribosomal protein L32 (Ribosomal protein I)  45 
 
 		 65 aa  47  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1941  50S ribosomal protein L32  43.55 
 
 		 61 aa  47  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000297405  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1058  ribosomal protein L32  41.38 
 
 		 72 aa  47  0.00009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000694342  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1275  50S ribosomal protein L32  41.38 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00245853  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1086  50S ribosomal protein L32  46.55 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0211  ribosomal protein L32  46.67 
 
 		 58 aa  47  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3434  ribosomal protein L32  45 
 
 		 58 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.976937  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0650  50S ribosomal protein L32  43.33 
 
 		 58 aa  45.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0825  50S ribosomal protein L32  37.93 
 
 		 58 aa  46.2  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369841  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1259  50S ribosomal protein L32  42.37 
 
 		 58 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000760142  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3110  50S ribosomal protein L32  45.9 
 
 		 60 aa  45.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0115825  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1152  50S ribosomal protein L32  45.9 
 
 		 60 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4030  ribosomal protein L32  43.33 
 
 		 59 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0657  ribosomal protein L32  38.71 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2988  ribosomal protein L32  42.11 
 
 		 61 aa  45.1  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000138033  normal  0.0167419 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11280  LSU ribosomal protein L32P  48.15 
 
 		 64 aa  45.1  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1608  50S ribosomal protein L32  46.3 
 
 		 66 aa  44.3  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2274  ribosomal protein L32  46.3 
 
 		 64 aa  44.7  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0667  50S ribosomal protein L32  41.82 
 
 		 63 aa  44.3  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.728717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1718  50S ribosomal protein L32  41.54 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.220434  normal  0.0708692 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2615  ribosomal protein L32  44.83 
 
 		 59 aa  43.9  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.499524 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0335  ribosomal protein L32  44.44 
 
 		 64 aa  43.9  0.0008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0770  50S ribosomal protein L32  36.84 
 
 		 56 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000008111  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1329  ribosomal protein L32  41.38 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000150645  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0637  50S ribosomal protein L32  38.98 
 
 		 59 aa  43.5  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000000215733  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3824  50S ribosomal protein L32  40 
 
 		 59 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000535994  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1025  50S ribosomal protein L32  39.66 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103246  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl396  50S ribosomal protein L32  42.86 
 
 		 59 aa  42.7  0.002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00156688  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1575  50S ribosomal protein L32  41.38 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0654579 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0836  50S ribosomal protein L32  40.98 
 
 		 60 aa  42.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000369284  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05660  LSU ribosomal protein L32P  41.67 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00609202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1364  ribosomal protein L32  41.38 
 
 		 59 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000136875  normal  0.339824 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1420  50S ribosomal protein L32  41.38 
 
 		 59 aa  41.6  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.640468  normal  0.982205 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1804  ribosomal protein L32  38.6 
 
 		 65 aa  41.6  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3291  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 67 aa  41.6  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.366938 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3554  50S ribosomal protein L32  44.83 
 
 		 59 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.873264  normal  0.953551 
 
 
-
 
NC_002950  PG2140  50S ribosomal protein L32  37.29 
 
 		 61 aa  41.2  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2781  50S ribosomal protein L32  40.98 
 
 		 59 aa  41.2  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.147785  normal  0.143209 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2613  ribosomal protein L32  38.6 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.737881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4144  50S ribosomal protein L32  42.11 
 
 		 62 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1412  ribosomal protein L32  42.59 
 
 		 62 aa  40.8  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3692  ribosomal protein L32  42.11 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>