72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0711 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_0711  50S ribosomal protein L32  100 
 
 
62 aa  131  3e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.282817 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0647  50S ribosomal protein L32  60 
 
 
64 aa  86.7  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.24173  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0206  50S ribosomal protein L32  67.24 
 
 
64 aa  84.3  5e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3815  ribosomal protein L32  57.38 
 
 
63 aa  80.9  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170365  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02340  50S ribosomal protein L32 (Ribosomal protein I)  63.79 
 
 
65 aa  78.6  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6298  ribosomal protein L32  58.06 
 
 
64 aa  75.5  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.507877 
 
 
-
 
NC_002950  PG2140  50S ribosomal protein L32  53.23 
 
 
61 aa  66.6  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4153  ribosomal protein L32  55.17 
 
 
64 aa  65.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.365847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5250  ribosomal protein L32  52.46 
 
 
64 aa  64.3  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00622213  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0718  50S ribosomal protein L32  42.37 
 
 
57 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000204019  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1187  50S ribosomal protein L32  52.38 
 
 
57 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000373536  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1209  50S ribosomal protein L32  52.38 
 
 
57 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000286453  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10230  ribosomal protein L32  47.46 
 
 
57 aa  47.4  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000453136  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1369  50S ribosomal protein L32  44.83 
 
 
60 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00758434  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1340  ribosomal protein L32  44.83 
 
 
58 aa  46.2  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.5028  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1434  50S ribosomal protein L32  41.38 
 
 
58 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000740742  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3938  50S ribosomal protein L32  42.37 
 
 
57 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3969  50S ribosomal protein L32  42.37 
 
 
57 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00129021  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2573  50S ribosomal protein L32  42.37 
 
 
57 aa  44.7  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000210481  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3665  50S ribosomal protein L32  42.37 
 
 
57 aa  44.7  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.37288e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1217  50S ribosomal protein L32  42.37 
 
 
57 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000020176  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3750  50S ribosomal protein L32  42.37 
 
 
57 aa  44.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000162679  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4024  50S ribosomal protein L32  42.37 
 
 
57 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000551113  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3976  50S ribosomal protein L32  42.37 
 
 
57 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135237  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3774  50S ribosomal protein L32  42.37 
 
 
57 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000267221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3682  50S ribosomal protein L32  42.37 
 
 
57 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000568057  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4144  50S ribosomal protein L32  43.1 
 
 
62 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4062  50S ribosomal protein L32  42.37 
 
 
57 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000151561  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2628  ribosomal protein L32  41.07 
 
 
56 aa  44.3  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000100434  hitchhiker  0.00000142207 
 
 
-
 
NC_002978  WD0987  50S ribosomal protein L32  42.11 
 
 
60 aa  43.9  0.0008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0825  50S ribosomal protein L32  39.66 
 
 
58 aa  43.9  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369841  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1808  ribosomal protein L32  38.71 
 
 
62 aa  43.9  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.253284  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1006  50S ribosomal protein L32  40.68 
 
 
57 aa  43.9  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0171  50S ribosomal protein L32  39.06 
 
 
63 aa  43.5  0.0009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0446  50S ribosomal protein L32  37.1 
 
 
61 aa  43.5  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.735597  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2134  50S ribosomal protein L32  40.98 
 
 
60 aa  43.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000309957  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1364  ribosomal protein L32  42.37 
 
 
59 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000136875  normal  0.339824 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0135  50S ribosomal protein L32  37.5 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000114527  normal  0.772153 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1625a  50S ribosomal protein L32  40.68 
 
 
61 aa  42.7  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100343  normal  0.018062 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2559  ribosomal protein L32  40.35 
 
 
60 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1984  50S ribosomal protein L32  37.29 
 
 
56 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000709039  decreased coverage  0.000595562 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0233  50S ribosomal protein L32  44.26 
 
 
60 aa  43.5  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000487517  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1355  LSU ribosomal protein L32P  39.66 
 
 
57 aa  42.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000130715  normal  0.0921955 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1495  50S ribosomal protein L32  35.59 
 
 
56 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237731  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1941  50S ribosomal protein L32  41.07 
 
 
61 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000297405  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2297  50S ribosomal protein L32  35.59 
 
 
56 aa  42  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000139706  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1611  50S ribosomal protein L32  37.29 
 
 
56 aa  41.6  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000123515  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1207  50S ribosomal protein L32  37.1 
 
 
64 aa  41.2  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1878  50S ribosomal protein L32  40.68 
 
 
58 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0576  50S ribosomal protein L32  37.1 
 
 
61 aa  41.6  0.004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.194083  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1113  50S ribosomal protein L32  37.1 
 
 
64 aa  41.2  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1603  ribosomal protein L32  34.43 
 
 
65 aa  41.2  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0931242  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1644  50S ribosomal protein L32  36.07 
 
 
60 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119469  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3835  ribosomal protein L32  36.07 
 
 
60 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.460634  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1904  50S ribosomal protein L32  35.59 
 
 
61 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0519443  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0770  50S ribosomal protein L32  44.83 
 
 
56 aa  40.8  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000008111  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1579  50S ribosomal protein L32  35.59 
 
 
61 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.146664  normal  0.0105145 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4160  50S ribosomal protein L32  36.07 
 
 
60 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340521  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1259  50S ribosomal protein L32  38.33 
 
 
58 aa  40.8  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000760142  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2988  ribosomal protein L32  39.66 
 
 
61 aa  40.4  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000138033  normal  0.0167419 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02912  50S ribosomal protein L32  35.59 
 
 
56 aa  40.4  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002992  LSU ribosomal protein L32p  35.59 
 
 
56 aa  40.4  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000126442  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2109  50S ribosomal protein L32  38.33 
 
 
60 aa  40.4  0.008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.11709  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2467  ribosomal protein L32  37.93 
 
 
61 aa  40.4  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000135728  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1599  50S ribosomal protein L32  37.93 
 
 
60 aa  40.4  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.919739  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1597  50S ribosomal protein L32  39.66 
 
 
60 aa  40.4  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000469826  normal  0.427035 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0070  ribosomal protein L32  45 
 
 
59 aa  40  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1715  50S ribosomal protein L32  32.2 
 
 
56 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000625062  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1578  50S ribosomal protein L32  32.2 
 
 
56 aa  40  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000427195  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1712  50S ribosomal protein L32  32.2 
 
 
56 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329996  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1755  50S ribosomal protein L32  32.2 
 
 
56 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000534053  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2652  50S ribosomal protein L32  32.2 
 
 
56 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000778579  hitchhiker  0.0000333205 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>