173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0770 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0770  50S ribosomal protein L32  100 
 
 
60 aa  123  1e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0231992  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1446  50S ribosomal protein L32  75.93 
 
 
57 aa  89  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000360897  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0877  50S ribosomal protein L32  58.33 
 
 
63 aa  71.2  0.000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000387423 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3835  ribosomal protein L32  51.85 
 
 
60 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.460634  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1644  50S ribosomal protein L32  51.85 
 
 
60 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119469  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4160  50S ribosomal protein L32  51.85 
 
 
60 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340521  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1625  50S ribosomal protein L32  50 
 
 
60 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.701038 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14890  50S ribosomal protein L32  50 
 
 
60 aa  58.2  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25630  50S ribosomal protein L32  51.85 
 
 
60 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000532355  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2191  50S ribosomal protein L32  51.85 
 
 
60 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1181  50S ribosomal protein L32  51.85 
 
 
60 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3282  50S ribosomal protein L32  51.85 
 
 
60 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2635  50S ribosomal protein L32  51.85 
 
 
60 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1728  50S ribosomal protein L32  51.85 
 
 
60 aa  57.4  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5274  50S ribosomal protein L32  51.85 
 
 
60 aa  57  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1911  50S ribosomal protein L32  51.85 
 
 
60 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.361385  unclonable  0.000000174861 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1387  50S ribosomal protein L32  51.85 
 
 
60 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1487  50S ribosomal protein L32  51.85 
 
 
60 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1522  50S ribosomal protein L32  50 
 
 
60 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.484698 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3803  50S ribosomal protein L32  51.85 
 
 
60 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0446  50S ribosomal protein L32  51.85 
 
 
61 aa  55.8  0.0000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.735597  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3652  50S ribosomal protein L32  50 
 
 
60 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1953  50S ribosomal protein L32  46.43 
 
 
60 aa  55.5  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000656252  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3078  50S ribosomal protein L32  50 
 
 
60 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3254  ribosomal protein L32  48.15 
 
 
60 aa  55.5  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000244715  normal  0.0606215 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2129  ribosomal protein L32  50 
 
 
59 aa  55.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0120071  normal  0.0237649 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0576  50S ribosomal protein L32  50 
 
 
61 aa  55.1  0.0000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.194083  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1870  ribosomal protein L32  48.21 
 
 
59 aa  55.5  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.819487  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1626  50S ribosomal protein L32  48.15 
 
 
60 aa  54.7  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.904867  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1598  50S ribosomal protein L32P  46.3 
 
 
56 aa  53.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.208872  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2109  50S ribosomal protein L32  41.67 
 
 
60 aa  52.4  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.11709  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0613  50S ribosomal protein L32  46.3 
 
 
60 aa  52.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000739879 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1553  50S ribosomal protein L32  46.43 
 
 
59 aa  51.6  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198496  normal  0.0691397 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0600  50S ribosomal protein L32  44.07 
 
 
64 aa  52  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113317  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0633  ribosomal protein L32  45 
 
 
63 aa  52  0.000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1585  50S ribosomal protein L32  44.07 
 
 
64 aa  52  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0810373  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2005  50S ribosomal protein L32  44.83 
 
 
64 aa  51.6  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2812  50S ribosomal protein L32  43.64 
 
 
56 aa  51.2  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000738596  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1682  50S ribosomal protein L32  41.82 
 
 
55 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000176962  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1619  50S ribosomal protein L32  47.27 
 
 
56 aa  51.6  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000529201  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3503  50S ribosomal protein L32  41.82 
 
 
55 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000266571  hitchhiker  0.00520609 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0077  50S ribosomal protein L32  47.17 
 
 
57 aa  51.6  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000137918  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1574  50S ribosomal protein L32  41.82 
 
 
55 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000166965  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2507  50S ribosomal protein L32  43.64 
 
 
56 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000163859  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1583  50S ribosomal protein L32  45.45 
 
 
56 aa  51.2  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000129748  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1913  50S ribosomal protein L32P  42.37 
 
 
62 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0403  50S ribosomal protein L32  46.3 
 
 
59 aa  50.4  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0634  50S ribosomal protein L32  44.44 
 
 
60 aa  50.4  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.307696  normal  0.0979505 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1603  ribosomal protein L32  42.59 
 
 
65 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0931242  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2628  ribosomal protein L32  40.74 
 
 
56 aa  49.7  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000100434  hitchhiker  0.00000142207 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1808  ribosomal protein L32  41.82 
 
 
62 aa  50.1  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.253284  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1509  50S ribosomal protein L32  44.64 
 
 
59 aa  49.7  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0171128  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0396  50S ribosomal protein L32  46.3 
 
 
59 aa  50.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2013  50S ribosomal protein L32  42.59 
 
 
59 aa  49.7  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2430  ribosomal protein L32  44.44 
 
 
59 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0972633  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1902  50S ribosomal protein L32  40 
 
 
55 aa  49.7  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000663482  hitchhiker  0.00000521877 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1229  50S ribosomal protein L32  49.09 
 
 
59 aa  49.3  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000037109  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01085  50S ribosomal protein L32  44.64 
 
 
57 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000124601  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2558  ribosomal protein L32  44.64 
 
 
57 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  3.21504e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01093  hypothetical protein  44.64 
 
 
57 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000104927  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2267  50S ribosomal protein L32  46.3 
 
 
59 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1878  50S ribosomal protein L32  47.27 
 
 
58 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0913  50S ribosomal protein L32  48.15 
 
 
59 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0957314 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2297  50S ribosomal protein L32  40.74 
 
 
56 aa  48.5  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000139706  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2432  50S ribosomal protein L32  46.3 
 
 
59 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.716206  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1468  50S ribosomal protein L32  44.64 
 
 
57 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000009475  hitchhiker  0.0000000000113971 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2126  ribosomal protein L32  41.82 
 
 
56 aa  48.5  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.625409  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1425  50S ribosomal protein L32  44.44 
 
 
59 aa  48.5  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.249628  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2235  50S ribosomal protein L32  44.64 
 
 
57 aa  48.9  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  4.5686e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1211  50S ribosomal protein L32  44.64 
 
 
57 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.3151100000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2512  50S ribosomal protein L32  44.64 
 
 
57 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454704  hitchhiker  0.0000514777 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0978  50S ribosomal protein L32  48.15 
 
 
59 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0979958 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2038  50S ribosomal protein L32  44.64 
 
 
57 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000393303  hitchhiker  0.0000254001 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2780  50S ribosomal protein L32  40.74 
 
 
56 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1340  ribosomal protein L32  44.64 
 
 
58 aa  48.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.5028  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0438  ribosomal protein L32  40.74 
 
 
56 aa  48.1  0.00004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1755  50S ribosomal protein L32  40.74 
 
 
56 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000534053  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2400  50S ribosomal protein L32  40.74 
 
 
56 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000318296  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2470  50S ribosomal protein L32  40.74 
 
 
56 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000146933  hitchhiker  0.00550798 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2562  50S ribosomal protein L32  40.74 
 
 
56 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000144666  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1715  50S ribosomal protein L32  40.74 
 
 
56 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000625062  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1578  50S ribosomal protein L32  40.74 
 
 
56 aa  48.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000427195  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2652  50S ribosomal protein L32  40.74 
 
 
56 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000778579  hitchhiker  0.0000333205 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1712  50S ribosomal protein L32  40.74 
 
 
56 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329996  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1048  50S ribosomal protein L32  48.15 
 
 
59 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1611  50S ribosomal protein L32  50 
 
 
60 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0069978  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10230  ribosomal protein L32  44.64 
 
 
57 aa  47.4  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000453136  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1669  ribosomal protein S32  39.29 
 
 
65 aa  47.4  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.545135  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1984  50S ribosomal protein L32  40.74 
 
 
56 aa  47.4  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000709039  decreased coverage  0.000595562 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02335  50S ribosomal protein L32  41.07 
 
 
56 aa  47.4  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000084206  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1495  50S ribosomal protein L32  38.89 
 
 
56 aa  47.4  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237731  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1006  50S ribosomal protein L32  47.27 
 
 
57 aa  47.4  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1604  50S ribosomal protein L32  41.82 
 
 
57 aa  47  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000354666  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0987  50S ribosomal protein L32  44.44 
 
 
60 aa  46.2  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0708  50S ribosomal protein L32  42.59 
 
 
57 aa  46.6  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0117733  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2498  50S ribosomal protein L32  40.74 
 
 
56 aa  46.6  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000463288  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1025  50S ribosomal protein L32  44.64 
 
 
62 aa  45.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103246  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1342  50S ribosomal protein L32  44.64 
 
 
63 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3426  50S ribosomal protein L32  46.67 
 
 
60 aa  45.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1599  50S ribosomal protein L32  40.74 
 
 
56 aa  45.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000342659  hitchhiker  0.00352794 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>