166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1446 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1446  50S ribosomal protein L32  100 
 
 		 57 aa  117  7e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000360897  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0770  50S ribosomal protein L32  75.93 
 
 		 60 aa  89  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0231992  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0877  50S ribosomal protein L32  58.93 
 
 		 63 aa  72.4  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000387423 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0446  50S ribosomal protein L32  52.73 
 
 		 61 aa  60.8  0.000000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.735597  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1229  50S ribosomal protein L32  55.36 
 
 		 59 aa  60.5  0.000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000037109  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0576  50S ribosomal protein L32  50.91 
 
 		 61 aa  60.1  0.000000009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.194083  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0077  50S ribosomal protein L32  47.37 
 
 		 57 aa  58.5  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000137918  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3835  ribosomal protein L32  46.43 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.460634  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1644  50S ribosomal protein L32  46.43 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119469  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4160  50S ribosomal protein L32  46.43 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1953  50S ribosomal protein L32  45.28 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000656252  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1625  50S ribosomal protein L32  44.64 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.701038 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5274  50S ribosomal protein L32  47.37 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3969  50S ribosomal protein L32  45.61 
 
 		 57 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00129021  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3774  50S ribosomal protein L32  45.61 
 
 		 57 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000267221  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3665  50S ribosomal protein L32  45.61 
 
 		 57 aa  53.9  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.37288e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3682  50S ribosomal protein L32  45.61 
 
 		 57 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000568057  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4062  50S ribosomal protein L32  45.61 
 
 		 57 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000151561  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3750  50S ribosomal protein L32  45.61 
 
 		 57 aa  53.9  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000162679  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4024  50S ribosomal protein L32  45.61 
 
 		 57 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000551113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3938  50S ribosomal protein L32  45.61 
 
 		 57 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3976  50S ribosomal protein L32  45.61 
 
 		 57 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135237  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1217  50S ribosomal protein L32  45.61 
 
 		 57 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000020176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2573  50S ribosomal protein L32  45.61 
 
 		 57 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000210481  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2109  50S ribosomal protein L32  43.4 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.11709  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10230  ribosomal protein L32  45.61 
 
 		 57 aa  53.5  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000453136  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1522  50S ribosomal protein L32  46.43 
 
 		 60 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.484698 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1911  50S ribosomal protein L32  44.64 
 
 		 60 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.361385  unclonable  0.000000174861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1487  50S ribosomal protein L32  44.64 
 
 		 60 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3803  50S ribosomal protein L32  44.64 
 
 		 60 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0633  ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 63 aa  52.4  0.000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3078  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 60 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1878  50S ribosomal protein L32  42.11 
 
 		 58 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1006  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 57 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14890  50S ribosomal protein L32  42.86 
 
 		 60 aa  51.6  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1728  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 60 aa  50.8  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1181  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 60 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0718  50S ribosomal protein L32  42.11 
 
 		 57 aa  50.4  0.000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000204019  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2635  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 60 aa  50.4  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3282  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 60 aa  50.4  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3652  50S ribosomal protein L32  42.11 
 
 		 60 aa  50.4  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1387  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25630  50S ribosomal protein L32  41.07 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000532355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2191  50S ribosomal protein L32  41.07 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2628  ribosomal protein L32  41.07 
 
 		 56 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000100434  hitchhiker  0.00000142207 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1870  ribosomal protein L32  40.35 
 
 		 59 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.819487  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0613  50S ribosomal protein L32  40.35 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000739879 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1187  50S ribosomal protein L32  42.11 
 
 		 57 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000373536  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1209  50S ribosomal protein L32  42.11 
 
 		 57 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000286453  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2297  50S ribosomal protein L32  41.07 
 
 		 56 aa  48.9  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000139706  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3254  ribosomal protein L32  40.35 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000244715  normal  0.0606215 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1755  50S ribosomal protein L32  41.07 
 
 		 56 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000534053  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2780  50S ribosomal protein L32  41.07 
 
 		 56 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2400  50S ribosomal protein L32  41.07 
 
 		 56 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000318296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2470  50S ribosomal protein L32  41.07 
 
 		 56 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000146933  hitchhiker  0.00550798 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1495  50S ribosomal protein L32  41.07 
 
 		 56 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237731  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2562  50S ribosomal protein L32  41.07 
 
 		 56 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000144666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1984  50S ribosomal protein L32  41.07 
 
 		 56 aa  48.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000709039  decreased coverage  0.000595562 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1715  50S ribosomal protein L32  41.07 
 
 		 56 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000625062  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2652  50S ribosomal protein L32  41.07 
 
 		 56 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000778579  hitchhiker  0.0000333205 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1578  50S ribosomal protein L32  41.07 
 
 		 56 aa  48.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000427195  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1712  50S ribosomal protein L32  41.07 
 
 		 56 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329996  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1808  ribosomal protein L32  40.35 
 
 		 62 aa  47.8  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.253284  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1626  50S ribosomal protein L32  38.18 
 
 		 60 aa  47.4  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.904867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2129  ribosomal protein L32  42.11 
 
 		 59 aa  47  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0120071  normal  0.0237649 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2013  50S ribosomal protein L32  40.35 
 
 		 59 aa  47  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2430  ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 59 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0972633  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0634  50S ribosomal protein L32  38.6 
 
 		 60 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.307696  normal  0.0979505 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2498  50S ribosomal protein L32  39.29 
 
 		 56 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000463288  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0987  50S ribosomal protein L32  40.35 
 
 		 60 aa  45.4  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2467  ribosomal protein L32  42.86 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000135728  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1603  ribosomal protein L32  40.74 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0931242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1598  50S ribosomal protein L32P  36.36 
 
 		 56 aa  45.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.208872  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0403  50S ribosomal protein L32  38.89 
 
 		 59 aa  45.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0396  50S ribosomal protein L32  38.6 
 
 		 59 aa  45.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1611  50S ribosomal protein L32  37.5 
 
 		 56 aa  45.4  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000123515  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1873  50S ribosomal protein L32  41.82 
 
 		 60 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00104363  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1553  50S ribosomal protein L32  38.6 
 
 		 59 aa  44.7  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198496  normal  0.0691397 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1599  50S ribosomal protein L32  39.29 
 
 		 56 aa  45.1  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000342659  hitchhiker  0.00352794 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2267  50S ribosomal protein L32  42.11 
 
 		 59 aa  44.3  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2432  50S ribosomal protein L32  42.11 
 
 		 59 aa  44.3  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.716206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0708  50S ribosomal protein L32  38.6 
 
 		 57 aa  43.5  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0117733  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0826  ribosomal protein L32  38.6 
 
 		 59 aa  43.5  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.784617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3503  50S ribosomal protein L32  35.19 
 
 		 55 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000266571  hitchhiker  0.00520609 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2005  50S ribosomal protein L32  36.84 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002992  LSU ribosomal protein L32p  35.71 
 
 		 56 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000126442  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1346  50S ribosomal protein L32  42.11 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1342  50S ribosomal protein L32  42.11 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1434  50S ribosomal protein L32  42.86 
 
 		 58 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000740742  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1682  50S ribosomal protein L32  35.19 
 
 		 55 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000176962  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0913  50S ribosomal protein L32  40.35 
 
 		 59 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0957314 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0978  50S ribosomal protein L32  40.35 
 
 		 59 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0979958 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1583  50S ribosomal protein L32  37.5 
 
 		 56 aa  43.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000129748  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2126  ribosomal protein L32  37.04 
 
 		 56 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.625409  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1411  50S ribosomal protein L32P  37.93 
 
 		 60 aa  42.7  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.361798  hitchhiker  0.00000964737 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1740  50S ribosomal protein L32  39.29 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000325807  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2038  ribosomal protein L32  39.29 
 
 		 56 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000023625  normal  0.0132901 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1604  50S ribosomal protein L32  38.6 
 
 		 57 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000354666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2812  50S ribosomal protein L32  35.71 
 
 		 56 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000738596  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1574  50S ribosomal protein L32  35.19 
 
 		 55 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000166965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>