209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1559 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1559  ribosomal protein L32  100 
 
 		 60 aa  124  6e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3111  50S ribosomal protein L32  83.33 
 
 		 61 aa  107  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5277  50S ribosomal protein L32  78.33 
 
 		 61 aa  102  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.5638  normal  0.0541919 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5920  50S ribosomal protein L32  78.33 
 
 		 61 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3426  50S ribosomal protein L32  81.03 
 
 		 60 aa  101  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3774  50S ribosomal protein L32  79.31 
 
 		 62 aa  100  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3466  50S ribosomal protein L32  79.31 
 
 		 62 aa  100  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.357647  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1775  50S ribosomal protein L32  79.31 
 
 		 59 aa  100  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3825  50S ribosomal protein L32  79.31 
 
 		 61 aa  100  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.828831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3664  50S ribosomal protein L32  79.31 
 
 		 62 aa  100  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.416645  normal  0.271996 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1710  50S ribosomal protein L32  79.31 
 
 		 59 aa  100  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.142223  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5115  50S ribosomal protein L32  79.31 
 
 		 62 aa  100  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.637 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4153  50S ribosomal protein L32  79.31 
 
 		 61 aa  100  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.867327 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3119  50S ribosomal protein L32  77.59 
 
 		 61 aa  100  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1411  50S ribosomal protein L32P  78.33 
 
 		 60 aa  100  6e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.361798  hitchhiker  0.00000964737 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0122  50S ribosomal protein L32  79.31 
 
 		 61 aa  100  8e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1128  ribosomal protein L32  79.31 
 
 		 59 aa  99.8  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.798956  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4342  50S ribosomal protein L32  77.59 
 
 		 61 aa  99.4  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0820  50S ribosomal protein L32  76.67 
 
 		 62 aa  97.8  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177127 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0527  50S ribosomal protein L32  74.14 
 
 		 60 aa  97.1  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0499  50S ribosomal protein L32  74.14 
 
 		 60 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00950666 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0625  50S ribosomal protein L32  70 
 
 		 61 aa  96.3  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19517  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0497  50S ribosomal protein L32  68.33 
 
 		 61 aa  95.1  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0514  50S ribosomal protein L32  72.41 
 
 		 60 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0311  50S ribosomal protein L32  72.41 
 
 		 60 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0425  50S ribosomal protein L32  74.14 
 
 		 63 aa  94.7  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.311335 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7619  50S ribosomal protein L32P  72.73 
 
 		 46 aa  74.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00560447  normal  0.375625 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1420  50S ribosomal protein L32  58.18 
 
 		 59 aa  70.5  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.640468  normal  0.982205 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3291  50S ribosomal protein L32  56.36 
 
 		 67 aa  68.2  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.366938 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1913  50S ribosomal protein L32P  56.9 
 
 		 62 aa  67  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0271  50S ribosomal protein L32  56.36 
 
 		 67 aa  67  0.00000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.750719  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2368  50S ribosomal protein L32  54.55 
 
 		 59 aa  65.9  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1665  50S ribosomal protein L32  56.36 
 
 		 61 aa  65.1  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0871064  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2764  ribosomal protein L32  68.18 
 
 		 46 aa  65.1  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000122605 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3554  50S ribosomal protein L32  54.55 
 
 		 59 aa  65.1  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.873264  normal  0.953551 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2129  ribosomal protein L32  55 
 
 		 59 aa  65.1  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0120071  normal  0.0237649 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3254  ribosomal protein L32  53.33 
 
 		 60 aa  63.5  0.0000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000244715  normal  0.0606215 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0633  ribosomal protein L32  51.67 
 
 		 63 aa  63.5  0.000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1669  ribosomal protein S32  53.33 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.545135  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2467  ribosomal protein L32  48.21 
 
 		 61 aa  61.2  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000135728  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0708  50S ribosomal protein L32  51.72 
 
 		 57 aa  60.5  0.000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0117733  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1553  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 59 aa  60.5  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198496  normal  0.0691397 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0633  ribosomal protein L32  43.33 
 
 		 63 aa  59.7  0.00000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1870  ribosomal protein L32  50 
 
 		 59 aa  59.7  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.819487  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2635  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 60 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5274  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 60 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2430  ribosomal protein L32  53.33 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0972633  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1425  50S ribosomal protein L32  53.57 
 
 		 59 aa  58.9  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.249628  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1181  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 60 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3282  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 60 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1387  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1509  50S ribosomal protein L32  51.67 
 
 		 59 aa  58.2  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0171128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0868  50S ribosomal protein L32  46.55 
 
 		 64 aa  58.2  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0634  50S ribosomal protein L32  46.67 
 
 		 60 aa  58.2  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.307696  normal  0.0979505 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1786  50S ribosomal protein L32  52.73 
 
 		 67 aa  57.8  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.213514  normal  0.442946 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0613  50S ribosomal protein L32  46.67 
 
 		 60 aa  57.8  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000739879 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3078  50S ribosomal protein L32  46.67 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1603  ribosomal protein L32  48.33 
 
 		 65 aa  57  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0931242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3599  ribosomal protein L32  45.45 
 
 		 59 aa  56.6  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.590227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2988  ribosomal protein L32  50.85 
 
 		 61 aa  56.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000138033  normal  0.0167419 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1237  50S ribosomal protein L32  46.43 
 
 		 59 aa  56.2  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.409262  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2614  50S ribosomal protein L32  45 
 
 		 68 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.417222  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3652  50S ribosomal protein L32  46.67 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1272  50S ribosomal protein L32  45 
 
 		 68 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.165805 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1910  50S ribosomal protein L32  45 
 
 		 68 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1585  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0810373  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1728  50S ribosomal protein L32  46.67 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1718  50S ribosomal protein L32  46.67 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.220434  normal  0.0708692 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0600  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113317  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1085  ribosomal protein L32  52.63 
 
 		 57 aa  54.7  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.444858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1207  50S ribosomal protein L32  49.15 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1113  50S ribosomal protein L32  49.15 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2005  50S ribosomal protein L32  48.28 
 
 		 64 aa  52.8  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2013  50S ribosomal protein L32  46.67 
 
 		 59 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2498  50S ribosomal protein L32  49.09 
 
 		 56 aa  52.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000463288  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0528  50S ribosomal protein L32  45 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2909  50S ribosomal protein L32  45 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.180854  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2914  50S ribosomal protein L32  46.67 
 
 		 59 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4231  50S ribosomal protein L32  46.67 
 
 		 59 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0358913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1077  50S ribosomal protein L32  46.67 
 
 		 59 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.990769 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1070  50S ribosomal protein L32  46.55 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.772826  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0999  50S ribosomal protein L32  46.67 
 
 		 59 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.852349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1715  50S ribosomal protein L32  45 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1070  50S ribosomal protein L32  46.67 
 
 		 59 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1598  50S ribosomal protein L32P  47.27 
 
 		 56 aa  52.8  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.208872  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0639  50S ribosomal protein L32  46.67 
 
 		 59 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0492807  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0995  50S ribosomal protein L32  46.67 
 
 		 59 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1119  50S ribosomal protein L32  46.67 
 
 		 59 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2185  50S ribosomal protein L32  45 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409214  normal  0.0976531 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0826  ribosomal protein L32  45 
 
 		 59 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.784617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2482  50S ribosomal protein L32  45 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.130811  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2800  50S ribosomal protein L32  45 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.223415  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2794  50S ribosomal protein L32  45 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.317349  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2855  50S ribosomal protein L32  45 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1805  50S ribosomal protein L32  45 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2628  ribosomal protein L32  49.09 
 
 		 56 aa  51.6  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000100434  hitchhiker  0.00000142207 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02335  50S ribosomal protein L32  49.09 
 
 		 56 aa  52  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000084206  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0913  50S ribosomal protein L32  45 
 
 		 59 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0957314 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1599  50S ribosomal protein L32  49.09 
 
 		 56 aa  51.6  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000342659  hitchhiker  0.00352794 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0396  50S ribosomal protein L32  43.33 
 
 		 59 aa  51.6  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>