More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1488 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2762  glycerol kinase  64.98 
 
 		 496 aa  647    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161395  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1676  glycerol kinase  65.66 
 
 		 496 aa  644    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000621066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1488  glycerol kinase  100 
 
 		 498 aa  984    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.562917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2688  glycerol kinase  64.78 
 
 		 496 aa  647    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  63.86 
 
 		 520 aa  645    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  58.63 
 
 		 505 aa  624  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  62.5 
 
 		 496 aa  619  1e-176  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2603  glycerol kinase  58.23 
 
 		 500 aa  616  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.817773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1922  glycerol kinase  61.57 
 
 		 502 aa  615  1e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2707  glycerol kinase  58.23 
 
 		 500 aa  614  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  60.61 
 
 		 505 aa  615  1e-175  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  58.23 
 
 		 500 aa  614  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3321  glycerol kinase  58.63 
 
 		 499 aa  615  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.24675 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2678  glycerol kinase  58.23 
 
 		 500 aa  614  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0252  glycerol kinase  59.6 
 
 		 497 aa  615  1e-175  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0912912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0619  glycerol kinase  58.23 
 
 		 500 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0599  glycerol kinase  58.63 
 
 		 500 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0638  glycerol kinase  58.43 
 
 		 499 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2987  glycerol kinase  59.76 
 
 		 498 aa  611  9.999999999999999e-175  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2731  glycerol kinase  57.83 
 
 		 500 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0727  glycerol kinase  57.69 
 
 		 513 aa  609  1e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015647 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0240  glycerol kinase  58.23 
 
 		 503 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329761  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  58.23 
 
 		 503 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2452  glycerol kinase  58.23 
 
 		 518 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0107802  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  56.28 
 
 		 498 aa  604  9.999999999999999e-173  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0419  glycerol kinase  58.23 
 
 		 499 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.33105 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2706  glycerol kinase  58.23 
 
 		 518 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2371  glycerol kinase  58.23 
 
 		 518 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137405  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0725  glycerol kinase  58.23 
 
 		 518 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315112  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0739  glycerol kinase  58.23 
 
 		 518 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2698  glycerol kinase  56.6 
 
 		 501 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4187  glycerol kinase  58.1 
 
 		 496 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.324248 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0809  glycerol kinase  58.59 
 
 		 497 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.344576 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1063  glycerol kinase  58.63 
 
 		 503 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0902987  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2987  glycerol kinase  59.76 
 
 		 498 aa  599  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3334  glycerol kinase  59.15 
 
 		 498 aa  595  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.921166  normal  0.722803 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3052  ATP:glycerol 3-phosphotransferase protein  59.76 
 
 		 498 aa  591  1e-168  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.155292 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  55.91 
 
 		 501 aa  591  1e-168  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2213  glycerol kinase  59.36 
 
 		 516 aa  592  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256504  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  55.65 
 
 		 497 aa  594  1e-168  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1389  glycerol kinase  56.07 
 
 		 499 aa  592  1e-168  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  56.28 
 
 		 496 aa  594  1e-168  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  56.48 
 
 		 496 aa  594  1e-168  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1465  glycerol kinase  59.52 
 
 		 505 aa  592  1e-168  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1075  glycerol kinase  56.48 
 
 		 499 aa  586  1e-166  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0100  glycerol kinase  56.05 
 
 		 507 aa  584  1e-166  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0410  glycerol kinase  56.65 
 
 		 497 aa  588  1e-166  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0101  glycerol kinase  56.05 
 
 		 507 aa  584  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  53.44 
 
 		 496 aa  587  1e-166  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000315642  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0246  glycerol kinase  54.73 
 
 		 501 aa  587  1e-166  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4113  glycerol kinase  56.05 
 
 		 507 aa  584  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2238  glycerol kinase  57.58 
 
 		 510 aa  586  1e-166  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2876  glycerol kinase  55.62 
 
 		 500 aa  586  1e-166  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2559  glycerol kinase  55.22 
 
 		 500 aa  585  1e-166  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1461  glycerol kinase  55.38 
 
 		 499 aa  585  1e-166  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3665  putative ATP:glycerol 3-phosphotransferase protein  61.24 
 
 		 499 aa  586  1e-166  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.10918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0841  glycerol kinase  53.75 
 
 		 494 aa  585  1e-166  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0155188  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3223  glycerol kinase  60.36 
 
 		 497 aa  583  1.0000000000000001e-165  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  52.93 
 
 		 496 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  53.13 
 
 		 496 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  52.93 
 
 		 496 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0174  glycerol kinase  55.44 
 
 		 503 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.300542  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1116  glycerol kinase  56.28 
 
 		 499 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4337  glycerol kinase  56.07 
 
 		 499 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  52.93 
 
 		 496 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0373  glycerol kinase  55.85 
 
 		 494 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  52.53 
 
 		 496 aa  581  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000818027  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03811  glycerol kinase  55.65 
 
 		 502 aa  579  1e-164  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4059  glycerol kinase  55.65 
 
 		 502 aa  579  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4157  glycerol kinase  55.65 
 
 		 502 aa  579  1e-164  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5381  glycerol kinase  55.65 
 
 		 502 aa  579  1e-164  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4681  glycerol kinase  56.94 
 
 		 494 aa  578  1e-164  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.648243  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3822  glycerol kinase  54.95 
 
 		 493 aa  579  1e-164  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0373  glycerol kinase  60.69 
 
 		 498 aa  580  1e-164  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.177298  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4168  glycerol kinase  54.84 
 
 		 501 aa  580  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  52.93 
 
 		 496 aa  581  1e-164  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3905  glycerol kinase  54.64 
 
 		 501 aa  578  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03760  hypothetical protein  55.65 
 
 		 502 aa  579  1e-164  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  52.93 
 
 		 496 aa  581  1e-164  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000330334  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0159  glycerol kinase  55.65 
 
 		 503 aa  580  1e-164  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4092  glycerol kinase  55.65 
 
 		 502 aa  579  1e-164  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4460  glycerol kinase  55.65 
 
 		 502 aa  579  1e-164  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3583  glycerol kinase  55.65 
 
 		 494 aa  579  1e-164  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  52.53 
 
 		 496 aa  580  1e-164  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000910223  decreased coverage  0.00000000961259 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4366  glycerol kinase  55.65 
 
 		 502 aa  579  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.569877 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3756  glycerol kinase  55.24 
 
 		 494 aa  578  1e-164  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0928777 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0402  glycerol kinase  55.44 
 
 		 494 aa  580  1e-164  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000703202 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3803  glycerol kinase  55.89 
 
 		 503 aa  581  1e-164  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0341  glycerol kinase  56.28 
 
 		 495 aa  580  1e-164  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  59.19 
 
 		 501 aa  578  1e-164  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4798  glycerol kinase  54.91 
 
 		 502 aa  580  1e-164  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000311367 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  52.73 
 
 		 496 aa  580  1e-164  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000269449  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1104  glycerol kinase  55.67 
 
 		 501 aa  581  1e-164  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2059  glycerol kinase  55.04 
 
 		 507 aa  580  1e-164  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000191654  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4408  glycerol kinase  55.65 
 
 		 502 aa  580  1e-164  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0391  glycerol kinase  55.24 
 
 		 494 aa  578  1e-164  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1268  glycerol kinase  56.45 
 
 		 496 aa  581  1e-164  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000199841  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4544  glycerol kinase  54.16 
 
 		 495 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0143138 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4485  glycerol kinase  55.04 
 
 		 502 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4415  glycerol kinase  55.04 
 
 		 502 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>