81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0904 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0904  HD-superfamily hydrolase  100 
 
 
322 aa  655    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0730  HD-superfamily hydrolase  48.56 
 
 
316 aa  330  3e-89  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1448  HD-superfamily hydrolase  45.98 
 
 
325 aa  303  3.0000000000000004e-81  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000046208  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1766  HD-superfamily hydrolase  41.8 
 
 
313 aa  282  6.000000000000001e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00925857  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2193  HD-superfamily hydrolase  42.95 
 
 
314 aa  280  2e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1773  HD domain-containing protein  39.94 
 
 
313 aa  277  1e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0235466  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0636  3'-5' exoribonuclease YhaM  44.08 
 
 
324 aa  265  5e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000053339  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4249  3'-5' exoribonuclease YhaM  41.88 
 
 
314 aa  263  3e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000074521 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1052  3'-5' exoribonuclease YhaM  41.88 
 
 
314 aa  262  6e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299092  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0927  3'-5' exoribonuclease YhaM  42.16 
 
 
314 aa  262  6e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.475944  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0920  3'-5' exoribonuclease YhaM  41.88 
 
 
314 aa  262  6e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0118856  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0933  3'-5' exoribonuclease YhaM  41.88 
 
 
314 aa  262  6e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0143521  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1111  3'-5' exoribonuclease YhaM  41.88 
 
 
314 aa  262  6e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.189435  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1087  3'-5' exoribonuclease YhaM  41.88 
 
 
314 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6154099999999997e-58 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1012  3'-5' exoribonuclease YhaM  41.56 
 
 
314 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0947  3'-5' exoribonuclease YhaM  41.56 
 
 
314 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0716307  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1180  3'-5' exoribonuclease YhaM  41.88 
 
 
314 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000316143  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0796  3'-5' exoribonuclease YhaM  41.1 
 
 
318 aa  258  8e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1452  3'-5' exoribonuclease YhaM  42.48 
 
 
376 aa  256  3e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1378  3'-5' exoribonuclease YhaM  38.82 
 
 
313 aa  254  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.280441  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1929  3'-5' exoribonuclease YhaM  39.47 
 
 
313 aa  253  3e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1895  3'-5' exoribonuclease YhaM  39.47 
 
 
313 aa  253  3e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.469436  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0473  hypothetical protein  37.58 
 
 
326 aa  187  3e-46  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl244  cmp-binding factor-1  33.76 
 
 
326 aa  181  1e-44  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2548  metal dependent phosphohydrolase  36.43 
 
 
386 aa  172  9e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.98451e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2929  metal dependent phosphohydrolase  37.41 
 
 
366 aa  170  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.220477  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1665  metal dependent phosphohydrolase  36.07 
 
 
388 aa  170  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0157  metal dependent phosphohydrolase  33.68 
 
 
348 aa  170  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2675  metal dependent phosphohydrolase  36.79 
 
 
384 aa  170  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.606537 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0086  metal dependent phosphohydrolase  34.8 
 
 
361 aa  169  8e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1796  metal dependent phosphohydrolase  35.74 
 
 
315 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000175278  normal  0.229909 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1122  HD domain-containing protein  35.19 
 
 
375 aa  166  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2404  HD-superfamily hydrolase  35.25 
 
 
321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0036501  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1091  metal dependent phosphohydrolase  31.49 
 
 
347 aa  163  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.628877  normal  0.443941 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2339  metal dependent phosphohydrolase  35.22 
 
 
347 aa  164  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0049  metal dependent phosphohydrolase  37.81 
 
 
371 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1025  metal dependent phosphohydrolase  36.88 
 
 
336 aa  162  6e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0129  metal dependent phosphohydrolase  32.61 
 
 
343 aa  161  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1404  metal dependent phosphohydrolase  31.11 
 
 
343 aa  160  3e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.248325  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0022  metal dependent phosphohydrolase  37.07 
 
 
361 aa  158  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0126816 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0027  3'-5' exoribonuclease YhaM  31.09 
 
 
323 aa  157  3e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.838244  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2013  HD-superfamily hydrolase  37.32 
 
 
387 aa  154  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000276986  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0027  HD domain-containing protein  31.09 
 
 
323 aa  155  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1026  metal dependent phosphohydrolase  33.56 
 
 
327 aa  152  5.9999999999999996e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2466  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  31.27 
 
 
328 aa  152  7e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0701415  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4294  metal dependent phosphohydrolase  32.32 
 
 
375 aa  151  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298288  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1988  metal dependent phosphohydrolase  33.45 
 
 
295 aa  150  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.489678  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0691  metal dependent phosphohydrolase  32.85 
 
 
344 aa  147  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000585513  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0440  metal dependent phosphohydrolase  36.46 
 
 
377 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000386707  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0667  metal dependent phosphohydrolase  31.58 
 
 
336 aa  142  6e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2639  metal dependent phosphohydrolase  31.63 
 
 
528 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.130174  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2543  metal dependent phosphohydrolase  31.97 
 
 
531 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.738894  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1164  metal dependent phosphohydrolase  32.19 
 
 
320 aa  138  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1317  metal dependent phosphohydrolase  32.29 
 
 
534 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0700325  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2446  metal dependent phosphohydrolase  30.38 
 
 
534 aa  136  5e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0158  metal dependent phosphohydrolase  30.38 
 
 
315 aa  135  9e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3087  metal dependent phosphohydrolase  28.86 
 
 
330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.120543 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0147  metal dependent phosphohydrolase  32.44 
 
 
344 aa  123  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5784  metal dependent phosphohydrolase  29.12 
 
 
327 aa  122  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.825544 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0317  metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 
333 aa  119  7e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1645  metal dependent phosphohydrolase  28.99 
 
 
352 aa  114  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0847  metal dependent phosphohydrolase  28.28 
 
 
354 aa  112  6e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.241634  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5827  metal dependent phosphohydrolase  26.77 
 
 
295 aa  112  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.163543  normal  0.236354 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0913  hypothetical protein  28.47 
 
 
313 aa  94.4  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1871  metal dependent phosphohydrolase  26.28 
 
 
317 aa  93.6  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0450  metal dependent phosphohydrolase  25.86 
 
 
309 aa  72  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2850  metal dependent phosphohydrolase  24.05 
 
 
309 aa  64.7  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1243  metal dependent phosphohydrolase  26.82 
 
 
228 aa  55.1  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1232  metal dependent phosphohydrolase  28.03 
 
 
228 aa  53.9  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1443  metal dependent phosphohydrolase  28.03 
 
 
228 aa  54.3  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.281894  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0723  metal dependent phosphohydrolase  28.03 
 
 
228 aa  53.1  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0254  metal dependent phosphohydrolase  31.51 
 
 
320 aa  50.1  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00126604  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0933  metal dependent phosphohydrolase  26.45 
 
 
249 aa  48.1  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0222  metal dependent phosphohydrolase  29.6 
 
 
170 aa  45.4  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2814  Relaxase  30.19 
 
 
1096 aa  44.3  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.127016  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3034  hypothetical protein  30.77 
 
 
575 aa  44.3  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.877854  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0932  Relaxase  37.8 
 
 
616 aa  43.9  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0425  Relaxase  35.44 
 
 
599 aa  43.9  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1614  Relaxase  35.29 
 
 
593 aa  43.1  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1141  metal dependent phosphohydrolase  31 
 
 
320 aa  42.7  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00121912  hitchhiker  0.00000000000000887406 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2175  relaxase  36.59 
 
 
614 aa  42.4  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>