More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0052 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0052  folylpolyglutamate synthetase  100 
 
 
442 aa  883  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0060  FolC bifunctional protein  87.56 
 
 
442 aa  785  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0632  FolC bifunctional protein  69.59 
 
 
448 aa  618  1e-176  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0075  FolC bifunctional protein  70.39 
 
 
442 aa  619  1e-176  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0673465  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0200  FolC bifunctional protein  69.61 
 
 
448 aa  606  1e-172  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0389  FolC bifunctional protein  71.17 
 
 
447 aa  606  1e-172  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.251585  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0094  putative folC protein  70.65 
 
 
447 aa  600  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0475  FolC bifunctional protein  58.03 
 
 
441 aa  478  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.617675  hitchhiker  0.00760667 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1623  FolC bifunctional protein  58.26 
 
 
441 aa  473  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1697  FolC bifunctional protein  59.65 
 
 
447 aa  474  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  4.1019e-06 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4444  FolC bifunctional protein  56.42 
 
 
441 aa  467  1e-130  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.545059 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4908  FolC bifunctional protein  56.42 
 
 
441 aa  467  1e-130  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.094704  normal  0.815295 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4958  FolC bifunctional protein  56.19 
 
 
441 aa  460  1e-128  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583341  normal  0.154774 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3380  FolC bifunctional protein  56.42 
 
 
441 aa  444  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873983  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1986  FolC bifunctional protein  54.94 
 
 
438 aa  438  1e-122  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0400217 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1404  FolC bifunctional protein  51.83 
 
 
438 aa  438  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.327079 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2675  FolC bifunctional protein  54.1 
 
 
423 aa  414  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0814  FolC bifunctional protein  51.74 
 
 
430 aa  409  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0140  FolC bifunctional protein  52.3 
 
 
444 aa  399  1e-110  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2022  FolC bifunctional protein  49.43 
 
 
442 aa  396  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000765521  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2106  FolC bifunctional protein  49.66 
 
 
442 aa  398  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0277055  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0059  FolC bifunctional protein  50.82 
 
 
421 aa  390  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0662  FolC bifunctional protein  50.92 
 
 
440 aa  385  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0116745  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1988  FolC bifunctional protein  53.5 
 
 
422 aa  381  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362806  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0024  folylpolyglutamate synthase  48.53 
 
 
470 aa  376  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3957  FolC bifunctional protein  47.82 
 
 
442 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.755042  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2985  FolC bifunctional protein  53.68 
 
 
412 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0930  folylpolyglutamate synthetase  53.86 
 
 
424 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3240  FolC bifunctional protein  50 
 
 
447 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4979  FolC bifunctional protein  53.18 
 
 
437 aa  375  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3431  folylpolyglutamate synthetase  50.57 
 
 
435 aa  370  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0132  folylpolyglutamate synthase  53.74 
 
 
422 aa  365  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4284  FolC bifunctional protein  46.67 
 
 
442 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.045669  normal  0.825965 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2589  FolC bifunctional protein  52.93 
 
 
424 aa  360  3e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.500866  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2729  FolC bifunctional protein  45.7 
 
 
453 aa  350  2e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1963  FolC bifunctional protein  49.05 
 
 
432 aa  344  2e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0844  FolC bifunctional protein  48.16 
 
 
437 aa  327  2e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1352  folylpolyglutamate synthase  42.06 
 
 
440 aa  326  5e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5701  FolC bifunctional protein  44.68 
 
 
467 aa  324  2e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.504133  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0088  FolC bifunctional protein  46.23 
 
 
397 aa  318  9e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1052  folylpolyglutamate synthase  37.11 
 
 
429 aa  301  1e-80  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.275241  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1061  FolC bifunctional protein  44.1 
 
 
443 aa  294  3e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0353  folylpolyglutamate synthetase  38.15 
 
 
434 aa  281  2e-74  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0702  folylpolyglutamate synthase  38.72 
 
 
435 aa  276  4e-73  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1299  FolC bifunctional protein  40.72 
 
 
435 aa  268  2e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0715  folylpolyglutamate synthase  38 
 
 
442 aa  255  9e-67  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2329  FolC bifunctional protein  39.03 
 
 
426 aa  249  5e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  37.73 
 
 
427 aa  229  7e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1239  FolC bifunctional protein  40.16 
 
 
437 aa  213  7e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.168236  normal  0.703163 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  37.8 
 
 
424 aa  212  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4359  FolC bifunctional protein  37.38 
 
 
427 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.601802  normal  0.624925 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2764  FolC bifunctional protein  34.86 
 
 
424 aa  212  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  33.33 
 
 
428 aa  210  3e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  33.57 
 
 
424 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0203  FolC bifunctional protein  31.83 
 
 
418 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0053743 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0207  FolC bifunctional protein  31.83 
 
 
418 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  38.41 
 
 
424 aa  206  9e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0119  FolC bifunctional protein  37.3 
 
 
447 aa  203  4e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0944  FolC bifunctional protein  36.52 
 
 
412 aa  202  9e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1603  FolC bifunctional protein  34.89 
 
 
420 aa  200  4e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119279  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  33.72 
 
 
457 aa  200  4e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.37038e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  34.76 
 
 
434 aa  200  5e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  3.74021e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0544  FolC bifunctional protein  33.02 
 
 
425 aa  198  1e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  34.6 
 
 
422 aa  198  1e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1256  FolC bifunctional protein  43.16 
 
 
386 aa  199  1e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  37.38 
 
 
424 aa  197  2e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  34.97 
 
 
425 aa  197  4e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2572  FolC bifunctional protein  40.38 
 
 
431 aa  196  5e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  34.6 
 
 
459 aa  196  6e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0533  FolC bifunctional protein  36.32 
 
 
440 aa  196  6e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.861672 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  31.47 
 
 
432 aa  194  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  35.95 
 
 
424 aa  192  8e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  35.81 
 
 
431 aa  191  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2780  FolC bifunctional protein  36.73 
 
 
437 aa  191  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38262  normal  0.709673 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  34.47 
 
 
443 aa  191  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3345  FolC bifunctional protein  34.11 
 
 
429 aa  189  7e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3683  folylpolyglutamate synthetase  33.33 
 
 
416 aa  189  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1911  folylpolyglutamate synthetase  35.31 
 
 
422 aa  189  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.553938 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3525  FolC bifunctional protein  37.09 
 
 
440 aa  187  3e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  35.23 
 
 
466 aa  187  3e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0325  FolC bifunctional protein  31.26 
 
 
438 aa  187  4e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1236  FolC bifunctional protein  36.92 
 
 
428 aa  187  4e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2368  folC bifunctional protein  37.7 
 
 
381 aa  186  6e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.183429  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1110  FolC bifunctional protein  31.79 
 
 
465 aa  186  1e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.94602 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0880  FolC bifunctional protein  38.98 
 
 
431 aa  185  1e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4190  folylpolyglutamate synthase  32.57 
 
 
433 aa  184  2e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4689  folylpolyglutamate synthase  32.57 
 
 
433 aa  184  2e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4354  folylpolyglutamate synthase  32.57 
 
 
433 aa  184  2e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1051  FolC bifunctional protein  31.29 
 
 
425 aa  185  2e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0461  FolC bifunctional protein  31.31 
 
 
408 aa  184  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0603  FolC bifunctional protein  33.64 
 
 
435 aa  183  4e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4201  folylpolyglutamate synthase  31.66 
 
 
433 aa  183  5e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1665  folylpolyglutamate synthetase  32.13 
 
 
434 aa  183  7e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.157637  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  32.05 
 
 
429 aa  182  7e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3814  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  32.81 
 
 
434 aa  183  7e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1997  FolC bifunctional protein  31.98 
 
 
436 aa  182  9e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.708043 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4548  folylpolyglutamate synthase  31.44 
 
 
433 aa  182  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4590  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  31.44 
 
 
433 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4544  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  32.35 
 
 
433 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3764  FolC bifunctional protein  31.96 
 
 
435 aa  181  3e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>