More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1934 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1934  zinc uptake regulator  100 
 
 		 135 aa  270  5.000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395595  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1261  ferric uptake regulator, Fur family  66.18 
 
 		 141 aa  172  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7037  ferric uptake regulator, Fur family  71.31 
 
 		 150 aa  170  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3370  ferric uptake regulator, Fur family  63.78 
 
 		 167 aa  168  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.073099  normal  0.112136 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3820  ferric uptake regulator family protein  61.11 
 
 		 131 aa  168  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.396621  normal  0.536437 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3458  zinc uptake regulator  62.6 
 
 		 131 aa  167  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.455544  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3447  zinc uptake regulator  62.6 
 
 		 131 aa  167  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0819749  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3510  zinc uptake regulator  62.6 
 
 		 131 aa  167  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1599  ferric uptake regulator, Fur family  63.7 
 
 		 135 aa  166  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4089  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2171  ferric uptake regulator, Fur family  61.29 
 
 		 133 aa  164  5e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00854605  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12385  ferric uptake regulation protein furB  60.16 
 
 		 130 aa  163  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1772  ferric uptake regulator, Fur family  63.41 
 
 		 141 aa  163  8e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.431388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2717  ferric uptake regulator family protein  58.73 
 
 		 134 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13650  zinc uptake regulator, Fur family  63.03 
 
 		 136 aa  160  7e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.357837 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1536  ferric uptake regulator, Fur family  57.26 
 
 		 130 aa  158  2e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.451133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13670  zinc uptake regulator, Fur family  60.94 
 
 		 142 aa  157  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.557708 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2745  ferric uptake regulator, Fur family  58.14 
 
 		 138 aa  153  9e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4538  ferric uptake regulator family protein  57.48 
 
 		 134 aa  151  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0148082  normal  0.344615 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2638  zinc uptake regulator  59.35 
 
 		 154 aa  150  5e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2373  ferric uptake regulator, Fur family  58.54 
 
 		 154 aa  149  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000416204 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7263  ferric uptake regulator family protein  56.45 
 
 		 175 aa  147  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0956308 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2543  ferric-uptake regulator  58.54 
 
 		 187 aa  147  5e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37741  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11800  zinc uptake regulator, Fur family  55.12 
 
 		 129 aa  146  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00894406  normal  0.765019 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07800  zinc uptake regulator, Fur family  59.2 
 
 		 148 aa  146  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2730  ferric uptake regulator family protein  58.54 
 
 		 150 aa  145  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2340  ferric uptake regulator family protein  56.2 
 
 		 135 aa  144  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3230  ferric uptake regulator, Fur family  55.47 
 
 		 150 aa  144  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0854036  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0856  zinc uptake regulator  55.37 
 
 		 129 aa  143  7.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.763265  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0066  ferric uptake regulator, Fur family  52.85 
 
 		 137 aa  141  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17110  zinc uptake regulator, Fur family  59.17 
 
 		 138 aa  141  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184262  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2085  zinc uptake regulator  55.04 
 
 		 138 aa  141  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1179  Fur family ferric uptake regulator  55.37 
 
 		 142 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.462177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3150  ferric-uptake regulator  56.1 
 
 		 137 aa  138  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.517881  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0061  zinc uptake regulator  54.84 
 
 		 142 aa  137  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0734  ferric uptake regulator, Fur family  52.94 
 
 		 123 aa  137  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264881  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2442  ferric uptake regulator, Fur family  49.6 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000168746 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1040  transcriptional regulator, Fur family  46.83 
 
 		 134 aa  124  4.0000000000000003e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0885  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  48.78 
 
 		 142 aa  119  9.999999999999999e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  38.71 
 
 		 143 aa  92  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  37.9 
 
 		 143 aa  90.1  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  37.9 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  37.6 
 
 		 146 aa  88.2  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0265  ferric-uptake regulator family  38.02 
 
 		 144 aa  86.7  9e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.460406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0291  ferric uptake regulator family protein  38.02 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.420841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  38.71 
 
 		 147 aa  86.7  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0630  FUR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 143 aa  84.3  5e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_571  transcriptional regulator, Fur family  37.3 
 
 		 143 aa  84.3  5e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0546  ferric uptake regulator family protein  31.97 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1842  ferric uptake regulator  38.61 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000255764  normal  0.0169118 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1885  ferric uptake regulator family protein  36.59 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2622  ferric uptake regulator  38.61 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000743772  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0322  ferric uptake regulator  33.08 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2509  ferric uptake regulator  38.61 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000631479  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2152  ferric uptake regulator  30.66 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2502  ferric uptake regulator  38.61 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000739379  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  33.86 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  33.86 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  29.37 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  33.86 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00640  ferric uptake regulator  35.25 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0211931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2954  ferric uptake regulator, Fur family  35.25 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000269107  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1796  ferric uptake regulator  34.96 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0654147  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2973  ferric uptake regulator  35.25 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00611688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0778  ferric uptake regulator  35.25 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000701006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0567  ferric uptake regulator  35.25 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138653  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0740  ferric uptake regulator  35.25 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0711  ferric uptake regulator  35.25 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00631  hypothetical protein  35.25 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0172811  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0849  ferric uptake regulator  35.25 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000679753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0752  ferric uptake regulator  35.25 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000171486  normal  0.37739 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0730  ferric uptake regulator  35.25 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177584  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0800  ferric uptake regulator  35.25 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00301514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0813  ferric uptake regulator  35.25 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000465454  normal  0.444337 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3367  ferric uptake regulator family protein  32.59 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0705  ferric uptake regulator  35.25 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000882448  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  34.68 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2902  ferric uptake regulator  33.08 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  33.87 
 
 		 148 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2991  ferric uptake regulator  33.08 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00139405  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  33.85 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1661  ferric uptake regulator  39.6 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000966153  normal  0.373988 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0603  ferric uptake regulator family protein  36.51 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1460  ferric uptake regulator, Fur family  36.59 
 
 		 161 aa  80.5  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1434  ferric uptake regulator  37.62 
 
 		 161 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000031646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3901  ferric uptake regulator family protein  37.4 
 
 		 168 aa  80.1  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000831439  normal  0.164099 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0603  ferric uptake regulator family protein  29.63 
 
 		 138 aa  80.1  0.000000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.401566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  33.6 
 
 		 146 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  29.6 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1206  ferric uptake regulator  34.43 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000560641  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0842  ferric uptake regulator, Fur family  33.62 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  36 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1211  ferric uptake regulation protein  33.66 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0179394  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1198  ferric uptake regulator  34.43 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000281175  hitchhiker  0.000179243 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2263  ferric uptake regulator  37.62 
 
 		 143 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3125  ferric uptake regulator  34.43 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  33.87 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1575  ferric uptake regulator  37.37 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0405  ferric uptake regulator family protein  34.17 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.165057 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  28.8 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  28.8 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>