More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0037 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0037  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
537 aa  1053    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6431  aldehyde dehydrogenase  50.48 
 
 
530 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00291714  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3045  aldehyde dehydrogenase  50.96 
 
 
525 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5321  aldehyde dehydrogenase  50.96 
 
 
525 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.711093 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4947  aldehyde dehydrogenase  50.38 
 
 
525 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0190727 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0328  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  50.58 
 
 
525 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3399  aldehyde dehydrogenase  49.62 
 
 
525 aa  443  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.202581  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5206  aldehyde dehydrogenase  49.81 
 
 
525 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.222173 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4679  aldehyde dehydrogenase  49.23 
 
 
525 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4441  aldehyde dehydrogenase  45.66 
 
 
526 aa  436  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2306  aldehyde dehydrogenase  45.8 
 
 
530 aa  429  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.862226  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003674  ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase  45.24 
 
 
510 aa  429  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.690417  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1283  aldehyde dehydrogenase  47.01 
 
 
525 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.435 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1256  ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase  46.82 
 
 
525 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.333102 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4861  Aldehyde Dehydrogenase  45.42 
 
 
527 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.187571 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3713  aldehyde dehydrogenase  48.57 
 
 
525 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1805  putative fatty aldehyde dehydrogenase  45.7 
 
 
527 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00336157  normal  0.0125854 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0832  aldehyde dehydrogenase  47.45 
 
 
525 aa  417  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0547808 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0057  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  47.52 
 
 
526 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0035  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  47.52 
 
 
526 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1189  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  47.52 
 
 
656 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1541  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  47.52 
 
 
659 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.211116  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3624  aldehyde dehydrogenase  48.57 
 
 
525 aa  415  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.186491  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0038  aldehyde dehydrogenase  47.52 
 
 
526 aa  413  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0042  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  47.52 
 
 
656 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1470  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  47.52 
 
 
526 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0043  aldehyde dehydrogenase  47.52 
 
 
526 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0253475  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4135  aldehyde dehydrogenase  47.88 
 
 
525 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1140  aldehyde dehydrogenase  45.47 
 
 
525 aa  409  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2670  aldehyde dehydrogenase  46.05 
 
 
533 aa  412  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2460  aldehyde dehydrogenase  47.45 
 
 
527 aa  406  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000205723 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6526  aldehyde dehydrogenase  47.13 
 
 
527 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.0487781 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2116  aldehyde dehydrogenase  46.92 
 
 
525 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.458004  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3101  aldehyde dehydrogenase  47.63 
 
 
526 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3323  aldehyde dehydrogenase family protein  45.83 
 
 
527 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559722  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0227  aldehyde dehydrogenase  45.71 
 
 
527 aa  403  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1897  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase  46.82 
 
 
527 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.271045  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4229  aldehyde dehydrogenase  47.22 
 
 
530 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.857739  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0844  aldehyde dehydrogenase  47.16 
 
 
508 aa  405  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4137  aldehyde dehydrogenase  47.22 
 
 
530 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0528665  normal  0.209657 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49290  Aldehyde dehydrogenase  47.02 
 
 
526 aa  402  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.213935  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3157  aldehyde dehydrogenase  45.64 
 
 
527 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000809211  normal  0.137723 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4029  aldehyde dehydrogenase  45.86 
 
 
530 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.123507  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4199  aldehyde dehydrogenase  45.12 
 
 
522 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3078  aldehyde dehydrogenase  46.95 
 
 
528 aa  399  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.165309 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2314  aldehyde dehydrogenase  46.86 
 
 
526 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0433257  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05180  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  46.93 
 
 
525 aa  400  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3382  aldehyde dehydrogenase  47.21 
 
 
530 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869145  normal  0.274011 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4450  aldehyde dehydrogenase  46.63 
 
 
530 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.888148 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2817  aldehyde dehydrogenase  46.87 
 
 
526 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106118  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3602  ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase  47.25 
 
 
526 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.133791  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1998  aldehyde dehydrogenase  47.33 
 
 
524 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0448113  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3264  aldehyde dehydrogenase  46.59 
 
 
508 aa  391  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000455371 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1008  Aldehyde Dehydrogenase  43.44 
 
 
536 aa  392  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.69554 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1484  aldehyde dehydrogenase  46.56 
 
 
497 aa  392  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3224  aldehyde dehydrogenase  45.49 
 
 
526 aa  391  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.169196  normal  0.562334 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2070  aldehyde dehydrogenase family protein  47.32 
 
 
530 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4865  aldehyde dehydrogenase  49.16 
 
 
504 aa  390  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.670882 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2289  aldehyde dehydrogenase  42.5 
 
 
525 aa  392  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3548  aldehyde dehydrogenase  46.63 
 
 
530 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.623229  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4869  aldehyde dehydrogenase  46.33 
 
 
530 aa  388  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3112  aldehyde dehydrogenase  46.4 
 
 
527 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1883  aldehyde dehydrogenase family protein  46.74 
 
 
530 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0566  aldehyde dehydrogenase family protein  46.74 
 
 
530 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4783  aldehyde dehydrogenase  46.33 
 
 
530 aa  388  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.233271  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6713  aldehyde dehydrogenase  45.49 
 
 
529 aa  388  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2585  aldehyde dehydrogenase family protein  45.84 
 
 
526 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.882727 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3131  aldehyde dehydrogenase  45.84 
 
 
526 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1422  aldehyde dehydrogenase family protein  46.55 
 
 
530 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.24251  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0877  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  46.55 
 
 
530 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.854859  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1706  putative aldehyde dehydrogenase  48.13 
 
 
517 aa  383  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155195  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0468  aldehyde dehydrogenase family protein  46.74 
 
 
530 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315073  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2192  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  46.55 
 
 
530 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.65984  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5547  aldehyde dehydrogenase  45.17 
 
 
507 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0649354 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1031  aldehyde dehydrogenase  44.82 
 
 
532 aa  384  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0036  aldehyde dehydrogenase  43.45 
 
 
538 aa  385  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5169  aldehyde dehydrogenase  45.76 
 
 
530 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0593368 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3135  Aldehyde Dehydrogenase  48.05 
 
 
483 aa  380  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.18311 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6846  Aldehyde Dehydrogenase  43.8 
 
 
515 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.29435 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0350  Aldehyde Dehydrogenase  43.48 
 
 
537 aa  379  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5736  Aldehyde Dehydrogenase  47.17 
 
 
533 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.437114  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3253  aldehyde dehydrogenase  46.62 
 
 
526 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.177644 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3072  putative aldehyde dehydrogenase  45.21 
 
 
527 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3912  dehydrogenase  44.4 
 
 
504 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0195751  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3869  aldehyde dehydrogenase  45.65 
 
 
505 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36050  putative aldehyde dehydrogenase  45.21 
 
 
527 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0976275  hitchhiker  0.00000000280554 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1760  aldehyde dehydrogenase  42.88 
 
 
521 aa  376  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000916491  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05368  ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase protein  46.17 
 
 
528 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.588855  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5346  Aldehyde Dehydrogenase  47.34 
 
 
505 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.671468 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0197  aldehyde dehydrogenase  46.53 
 
 
522 aa  378  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1529  fatty aldehyde dehydrogenase  42.22 
 
 
515 aa  373  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3656  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  46.35 
 
 
508 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2498  Aldehyde Dehydrogenase  45.86 
 
 
549 aa  375  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0186  aldehyde dehydrogenase family protein  46.07 
 
 
524 aa  375  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0864  aldehyde dehydrogenase  42.42 
 
 
528 aa  374  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.321546 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3325  aldehyde dehydrogenase  46.23 
 
 
506 aa  373  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48010  putative semialdehyde dehydrogenase  46.26 
 
 
526 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014327  normal  0.873423 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4139  putative semialdehyde dehydrogenase  45.79 
 
 
526 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.557422  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3335  aldehyde dehydrogenase  48.61 
 
 
489 aa  372  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2364  aldehyde dehydrogenase  41.51 
 
 
521 aa  370  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0248212  normal  0.117766 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>