63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0286 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0286  hypothetical protein  100 
 
 
121 aa  238  2e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.248934  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0304  hypothetical protein  54.17 
 
 
120 aa  134  3.0000000000000003e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00945381  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3323  hypothetical protein  34.71 
 
 
123 aa  75.9  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565499  normal  0.239211 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2116  putative small multidrug resistance transmembrane protein  33.03 
 
 
118 aa  61.2  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.380203  normal  0.497912 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0853  hypothetical protein  31.19 
 
 
139 aa  59.3  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0100048  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1132  hypothetical protein  30.83 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0801  hypothetical protein  31.19 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.351912  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3729  transporter protein  31.9 
 
 
118 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000221526  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3408  hypothetical protein  37.84 
 
 
121 aa  58.5  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0526043  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2966  hypothetical protein  30.28 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3972  hypothetical protein  29.17 
 
 
125 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0829336  normal  0.0274812 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2476  transporter  37.97 
 
 
117 aa  54.7  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000067585  decreased coverage  0.00107573 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1802  putative small multidrug resistance transmembrane protein, DMT superfamily  26.05 
 
 
123 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647816  hitchhiker  0.00398859 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5060  transporter  36.44 
 
 
114 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5055  transporter  36.44 
 
 
114 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539508  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0826  hypothetical protein  27.5 
 
 
150 aa  52.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0093  conserved hypothetical protein; inner membrane protein  36.36 
 
 
112 aa  52  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1259  putative small multidrug resistance transmembrane protein  27.27 
 
 
123 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627101  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1198  small multidrug resistance protein  26.45 
 
 
123 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.969405  normal  0.128153 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1415  small multidrug resistance protein  25.21 
 
 
123 aa  50.4  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303434  normal  0.334257 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0955  hypothetical protein  33.8 
 
 
115 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00515656  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5159  hypothetical protein  24.37 
 
 
123 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486542  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1858  hypothetical protein  24.37 
 
 
123 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2747  hypothetical protein  29.29 
 
 
122 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000323664 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0921  hypothetical protein  29.36 
 
 
120 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.729046  normal  0.185429 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1882  hypothetical protein  24.37 
 
 
123 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.226664  hitchhiker  0.00000199647 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1768  hypothetical protein  24.37 
 
 
123 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0433646  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1796  hypothetical protein  24.37 
 
 
123 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6221  hypothetical protein  24.37 
 
 
123 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0927  hypothetical protein  25.21 
 
 
141 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.110405  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1389  hypothetical protein  23.53 
 
 
123 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2194  hypothetical protein  23.53 
 
 
123 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000274513  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2400  drug/metabolite exporter (DME) family protein  23.53 
 
 
123 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1879  hypothetical protein  23.53 
 
 
123 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659154  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1151  hypothetical protein  23.53 
 
 
123 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.972837  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0018  hypothetical protein  23.53 
 
 
123 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2236  hypothetical protein  23.53 
 
 
123 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3453  hypothetical protein  27.73 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3364  hypothetical protein  28.28 
 
 
122 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2274  hypothetical protein  23.73 
 
 
123 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1038  hypothetical protein  31.62 
 
 
122 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.550209 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4229  putative inner membrane protein  35.29 
 
 
113 aa  45.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0573  hypothetical protein  27.93 
 
 
118 aa  45.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454488  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4515  transporter protein  25.69 
 
 
123 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0688727 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2232  hypothetical protein  29.82 
 
 
138 aa  45.1  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.791357  normal  0.0104044 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4021  hypothetical protein  30 
 
 
132 aa  44.3  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.903985  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0132  hypothetical protein  31.17 
 
 
164 aa  44.3  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.574487 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2694  hypothetical protein  29.63 
 
 
108 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0340055  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1731  hypothetical protein  32.5 
 
 
128 aa  43.9  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0754  small multidrug resistance protein  26.97 
 
 
126 aa  43.9  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1837  hypothetical protein  32.5 
 
 
128 aa  43.9  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2606  hypothetical protein  32.5 
 
 
128 aa  43.9  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2846  hypothetical protein  29.33 
 
 
114 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.367285  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2073  hypothetical protein  24.17 
 
 
127 aa  42.7  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5531  Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  23.89 
 
 
122 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.382861  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4020  putative inner membrane protein  33.33 
 
 
113 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2159  hypothetical protein  41.18 
 
 
115 aa  41.6  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2385  small multidrug resistance transmembrane protein  25.93 
 
 
123 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.147787 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2320  hypothetical protein  26.25 
 
 
139 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.384685  normal  0.0277976 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0304  hypothetical protein  41.82 
 
 
273 aa  40.8  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.589486  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2226  putative small multidrug resistance transmembrane protein  28.99 
 
 
112 aa  40.8  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.545131  hitchhiker  0.00000175504 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1186  hypothetical protein  27.43 
 
 
127 aa  40.4  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2847  hypothetical protein  32.84 
 
 
134 aa  40.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.391182  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>